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最简MATLAB代码-FNIRSR:分析功能性近红外光谱(fNIRS)数据的工具包

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简介:
最简MATLAB代码-FNIRSR是一个专注于简化功能近红外光谱(fNIRS)数据分析流程的MATLAB工具包,旨在为研究人员提供便捷的数据处理和解析方案。 在使用MATLAB分析功能性近红外光谱(fNIRS)数据之前,请确保安装了R包fnirsr。如果尚未安装devtools,则首先需要通过`install.packages(devtools)`命令来安装它,然后利用`devtools::install_github(erzk/fnirsr)`来获取fnirsr软件包。 样本数据文件可以从提供的来源获得(此处未提供具体链接)。使用此小插图时所用的和附带于该软件包中的Hitachi_ETG4000_24Ch_Total.csv文件同样来自上述来源。记录的基本信息保存在标题中,由于其不规则形式,解析起来可能有些复杂。 当前开发阶段下,fnirsr仅能读取由日立ETG-4000系统生成的原始csv文件格式的数据部分,在未来可能会扩展支持更多类型的文件类型以兼容其他系统的数据。对于使用该软件包时的具体操作步骤,请参考以下示例代码: ```r library(fnirsr) file_path <- system.file(extdata,Hitachi_ETG4000_24Ch_Total.csv) ``` 这行代码将加载指定路径中的文件,并读取其中的标题信息,返回一个包含标头数据信息的向量。

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客服
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  • MATLAB-FNIRSR(fNIRS)
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    最简MATLAB代码-FNIRSR是一个专注于简化功能近红外光谱(fNIRS)数据分析流程的MATLAB工具包,旨在为研究人员提供便捷的数据处理和解析方案。 在使用MATLAB分析功能性近红外光谱(fNIRS)数据之前,请确保安装了R包fnirsr。如果尚未安装devtools,则首先需要通过`install.packages(devtools)`命令来安装它,然后利用`devtools::install_github(erzk/fnirsr)`来获取fnirsr软件包。 样本数据文件可以从提供的来源获得(此处未提供具体链接)。使用此小插图时所用的和附带于该软件包中的Hitachi_ETG4000_24Ch_Total.csv文件同样来自上述来源。记录的基本信息保存在标题中,由于其不规则形式,解析起来可能有些复杂。 当前开发阶段下,fnirsr仅能读取由日立ETG-4000系统生成的原始csv文件格式的数据部分,在未来可能会扩展支持更多类型的文件类型以兼容其他系统的数据。对于使用该软件包时的具体操作步骤,请参考以下示例代码: ```r library(fnirsr) file_path <- system.file(extdata,Hitachi_ETG4000_24Ch_Total.csv) ``` 这行代码将加载指定路径中的文件,并读取其中的标题信息,返回一个包含标头数据信息的向量。
  • 基于MATLAB
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    本软件为科研人员和工程师提供了一套基于MATLAB平台的高效、便捷的近红外光谱数据分析解决方案。通过集成多种先进的处理算法与模型,支持用户进行数据预处理、特征提取及定量预测等操作,广泛应用于食品、农业、医药等领域的产品品质控制和成分分析研究中。 用于近红外光谱分析的聚类分析和判别方法的MATLAB程序。
  • Matlab预处理.rar
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    本资源提供了一系列用于近红外光谱数据分析的Matlab预处理代码,包括基线校正、标准化及多种散点去除方法。适合科研与教学使用。 提供关于使用MATLAB进行近红外数据预处理的代码及介绍。这些内容可以直接复制粘贴到MATLAB环境中运行。提供的资料包括相关代码及其解释说明,便于用户直接在软件中操作应用。
  • PCA_daima.zip_matlab与pca_定量
    优质
    本资源包含利用Matlab进行PCA(主成分分析)处理近红外光谱数据以实现定量分析的代码。通过PCA技术,可以有效地从复杂的数据中提取关键信息,用于化学物质浓度等参数的精准预测和评估。此代码包适用于科研人员及学生研究近红外光谱学应用。 PCA(主成分分析)是一种广泛应用于数据分析的统计方法,在光谱学领域尤其有用,因为它能够有效地降维并提取数据中的关键信息。“pca-daima.zip”压缩包中详细介绍了如何使用MATLAB进行近红外光谱的PCA分析,并探讨了其在定性和定量分析中的应用。 近红外光谱(NIR Spectroscopy)是一种非破坏性的技术,通过测量分子振动和转动能级间的跃迁来获取物质的信息。这种技术广泛应用于化学、生物医学、食品科学等领域,因为它可以快速且无损地检测样品的化学组成。 PCA的主要目标是将高维数据转换为一组线性不相关的低维特征向量(主成分),这些主成分保留了原始数据中的大部分变异信息,使得复杂的数据集更容易理解和解释。在光谱分析中,PCA有助于识别和去除噪声,并突出显示样本之间的差异,可能还会发现潜在的模式。 使用MATLAB实现PCA通常包括以下步骤: 1. **预处理**:对原始光谱数据进行归一化、平滑滤波或基线校正等操作,以减少随机噪声和系统误差的影响。 2. **构建数据矩阵**:将预处理后的光谱数据整理成矩阵形式,其中行代表样本而列则表示不同的光谱波长。 3. **计算协方差/相关性矩阵**:这一步骤旨在揭示数据之间的关系及其变化情况。 4. **特征值分解**:对上述构建的矩阵进行特征值分解操作,得到对应的特征向量和它们各自的特征值。 5. **选择主成分**:依据特征值大小排序后选取前几个具有最大特征值的向量作为主成分,这些成分为数据提供了大部分变异信息。 6. **投影到主成分空间**:将原始光谱数据映射至由选定的主成分构成的新坐标系统中,从而获得降维后的结果。 7. **分析和解释**:通过可视化手段(如散点图)展示降维后得到的数据集,并从中提取有价值的信息或建立预测模型。 在定量分析方面,PCA可以用于创建预测模型,例如偏最小二乘回归(PLS-R),通过对主成分进行回归来估计未知样品的属性。而在定性研究中,则可以通过聚类(如K-means)或者判别分析(LDA)等方法将样本分组以区分不同类型的材料。 压缩包中的代码涵盖了上述所有步骤,提供了实现PCA的具体算法和函数示例。通过学习这些内容,用户可以在MATLAB环境中进行实际的NIR光谱数据分析,并将其应用于自己的研究或项目中。 总之,PCA是一种强大的工具用于处理近红外光谱数据,在MATLAB的帮助下可以高效地执行降维、模式识别以及模型构建等任务。压缩包提供的资源对于想要掌握和实践PCA在光谱分析中的应用非常有帮助。
  • 预处理
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    近红外光谱数据的预处理旨在通过消除噪音、基线漂移等干扰因素,优化信号质量,增强有效信息,为后续分析提供可靠的数据基础。 光谱信息预处理的MATLAB代码包括标准正态变换(SNV)、多元散射校正(MSC)和Savitzky-Golay卷积平滑。
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    简介:近红外光谱仪是一种利用近红外光(约780nm至2500nm)与物质相互作用来获取样品化学成分信息的分析仪器。广泛应用于食品、农业、制药等领域,具有快速无损检测的特点。 已故院士陆婉珍撰写的关于近红外技术的参考书目涵盖了近红外原理、仪器设备、化学计量学以及相关应用。
  • MATLAB预处理
    优质
    本文章介绍了如何在MATLAB环境中对近红外光谱数据进行各种预处理操作的技术与方法,旨在优化数据质量以提升后续分析效果。 提供关于使用MATLAB进行近红外预处理的代码及相关的介绍。可以直接复制粘贴到MATLAB环境中运行。
  • Matlab预处理
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    本文章介绍了如何使用MATLAB对近红外光谱数据进行预处理的方法和技术,包括常见的平滑、导数运算及归一化等步骤。 十分有用的MATLAB预处理近红外光谱代码,并附有详细的讲解。
  • 特征降维方法比较
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    本研究对多种用于处理近红外光谱数据的特征降维技术进行了系统性评估与对比,旨在探索最有效的数据分析手段。通过综合考量各类算法在不同场景下的表现,为相关领域的应用提供了有益参考和理论支持。 由于近红外光谱具有波长点多、谱带归属困难、光谱重叠严重及光谱分布结构未知等问题,在进行关键特征提取和数据特征空间映射时难以准确选择合适的降维方法。为解决这一问题,本段落对比分析了典型的线性和非线性降维方法,并利用烟叶近红外光谱数据从数据降维可视化和分类准确性识别率两方面进行了实验验证。结果表明,线性降维算法,特别是主成分分析(PCA)和线性判别分析(LDA),在处理烟叶近红外光谱时更为适用;而非线性降维方法由于其泛化学习能力较弱、推广能力和本征维度估计困难等原因,在这种情况下并不适合使用。
  • MIDAS 2010:适用于二维Matlab软件-_matlab开发_
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    MIDAS 2010是一款用于二维红外和中红外光谱数据分析的MATLAB工具包,专为研究人员提供全面的数据处理与解析功能。 MIDAS 2010 是在加拿大光源开发的一款软件包,用于时间分辨红外光谱的二维光谱分析及数据探索。其主要功能包括: - 计算并绘制同步与异步二维光谱以及一维切片。 - 设计和应用过滤器。 有关更多信息和使用指南,请参阅用户手册。该软件由 Elise Normand 开发。