Advertisement

基于Boruta+SHAP与立方样条回归的R语言Shiny应用程序构建

  •  5星
  •     浏览量: 0
  •     大小:None
  •      文件类型:None


简介:
本研究利用R语言开发了一个集成Boruta算法和SHAP值的特征选择模块,并结合立方样条回归模型,创建了交互式的Shiny应用,以优化数据预测精度。 Boruta+SHAP分析与立方样条回归分析流程结合成一个快速发现变量间关系的数据分析过程,并将其整合到一款APP中,实现了便捷高效的数据处理功能。同时该应用展示了shinyAPP的构建方法,采用流行的shiny和bslib库技术,包含isolate语法、主题切换及忙碌指示等功能元素。推荐对数据分析与shinyAPP开发感兴趣的人士下载使用。

全部评论 (0)

还没有任何评论哟~
客服
客服
  • Boruta+SHAPRShiny
    优质
    本研究利用R语言开发了一个集成Boruta算法和SHAP值的特征选择模块,并结合立方样条回归模型,创建了交互式的Shiny应用,以优化数据预测精度。 Boruta+SHAP分析与立方样条回归分析流程结合成一个快速发现变量间关系的数据分析过程,并将其整合到一款APP中,实现了便捷高效的数据处理功能。同时该应用展示了shinyAPP的构建方法,采用流行的shiny和bslib库技术,包含isolate语法、主题切换及忙碌指示等功能元素。推荐对数据分析与shinyAPP开发感兴趣的人士下载使用。
  • SHAPCOX模型变量间关系分析:boruta+treeshap+拟合
    优质
    本研究采用Boruta算法与TreeSHAP方法结合立方样条拟合技术,深入探究了基于SHAP值的Cox模型中变量间的复杂关系,旨在提高生存数据分析的透明度和可解释性。 使用Boruta算法筛选变量后,构建随机森林模型,并通过treeshap计算SHAP值。再利用rcs拟合变量间的关系,以展示一个特定变量对结局变量贡献度随其自身取值变化的模式及其关键转折点,从而为决策提供支持。 传统的RCS分析仅能探究连续型自变量之间的关系及斜率的变化点;而基于SHAP值进行的RCS分析则能够处理包含分类和连续混合类型的数据集,并且可以确定某个特定变量对结局变量贡献方向转变的关键节点,这是传统方法所不具备的功能。
  • R绘制Cox限制性代码
    优质
    本代码示例展示如何使用R语言进行Cox比例风险模型中的限制性立方样条分析,并绘制相关图形。适合生物统计和医学研究中数据分析需求。 R绘制cox回归限制性立方样条图的代码示例可以这样描述:使用R语言编写用于创建Cox回归模型限制性立方样条图的脚本。这样的代码通常会包括加载必要的库,如`spline`或`survival`包,并定义数据集、拟合模型以及绘制图形的具体步骤。
  • R绘制线性限制性代码
    优质
    本段代码展示如何使用统计软件R来绘制基于线性回归模型的限制性立方样条(Restricted Cubic Spline, RCS)图形。通过该教程,读者可以掌握在回归分析中加入非线性关系的方法,并直观地呈现变量间的关系变化趋势。 R绘制线性回归限制性立方样条图的代码可以在R语言环境中实现。这类图表用于展示非线性的关系,并且可以通过使用特定的库来简化创建过程。在进行此类绘图时,首先需要安装并加载必要的包,如`splines`或`splines2`等,然后利用这些工具生成限制性立方样条(Restricted Cubic Splines, RCS),最后绘制出线性回归的结果。这样的图表可以帮助分析者更好地理解数据中的趋势和模式。
  • Shiny框架R数据挖掘平台原型
    优质
    本研究旨在开发一个基于Shiny框架的R语言数据挖掘平台原型,为用户提供直观的数据分析和可视化工具,助力科研与商业决策。 Shiny是R语言中的一个Web开发框架,它使用户无需深入了解CSS和JavaScript的知识,只需掌握一些HTML知识即可进行网页开发。通过学习Shiny及shinydashboard包的相关知识点,并学会如何搭建web框架以及使用shinythemes包来改变主题,学员可以达到自行创建网页应用的能力。以下是通过四个实际案例详细讲解这一过程。
  • R空间分析
    优质
    本课程聚焦于利用R语言进行空间数据分析与建模。涵盖空间数据处理、可视化及空间自相关理论,并深入讲解空间回归模型的应用。适合对地理统计有浓厚兴趣的研究者和从业者学习使用。 在学习空间经济学的过程中,掌握R软件和进行空间回归分析是非常有用的技能。
  • 随机森林R
    优质
    本文章介绍了如何使用R语言实现随机森林回归算法,并探讨了其在预测分析中的有效应用。通过实例讲解了模型构建和优化的过程。 这段文字主要介绍使用R语言进行随机森林回归和其他两种回归方法的实现过程。 首先加载必要的库: ```r library(lattice) library(grid) library(DMwR) library(rpart) library(ipred) library(randomForest) ``` 接着,利用`randomForest`, `ipred`, 和 `rpart`三个包来进行随机森林、装袋算法和回归树的建模。前两种方法可以处理缺失数据,但是随机森林模型不能直接使用含有缺失值的数据集。 对于原始数据: ```r data(algae) algae <- algae[-manyNAs(algae,0.2), ] ``` 这里删除了包含超过20% NA值的行,并通过`knnImputation()`函数进行平均值填充,以处理剩余的NA值。 ```r clean.algae <- knnImputation(algae,k=10) ``` 然后使用回归树模型计算: ```r model.tree=rpart(a1 ~ ., data = clean.algae[, 1:12]) summary(model.tree) pre.tree <- predict(model.tree, clean.algae) plot(pre.tree~clean.algae$a1) nmse1 <- mean((pre.tree- clean.algae[,a1])^2)/mean((mean(clean.algae[,a1])- clean.algae[,a1])^2) ``` 上述代码创建了回归树模型,并预测其结果,最后计算了均方误差(NMSE)。
  • RShiny指南中文版
    优质
    《R语言Shiny官方指南中文版》是一本全面介绍如何使用R编程语言及其Shiny框架开发交互式网页应用的教程书。它将原汁原味的英文官方文档翻译成中文,旨在帮助中国用户更便捷地学习和掌握Shiny技术,适用于所有水平的数据科学家与工程师。 R语言Shiny官方教程的中文版提供了用R语言搭建可视化数据分析平台的方法和技巧。
  • RGARCH分析
    优质
    本文介绍如何在R语言环境中进行GARCH模型的构建与应用,并探讨其在金融时间序列数据中的回归分析方法。 在使用 `rugarch` 包进行时间序列分析的过程中,我们首先定义了一个 GARCH 模型的规格: ```r variance.model = list(model = sGARCH, garchOrder = c(1, 1), submodel = NULL, external.regressors = NULL, variance.targeting = FALSE) distribution.model = norm ``` 接着,我们使用 `ugarchfit` 函数来拟合数据: ```r myspec=ugarchspec(variance.model = list(model = sGARCH, garchOrder = c(1, 1), submodel = NULL, external.regressors = NULL, variance.targeting = FALSE), mean.model = list(armaOrder = c(1, 1), include.mean = TRUE, archm = FALSE, archpow = 1, arfima = FALSE, external.regressors = NULL, archex = FALSE), distribution.model = norm) myfit=ugarchfit(myspec,data=datax,solver=solnp) ``` 从拟合结果中提取信息可以通过 `as.data.frame` 函数实现,例如: - 提取模型的拟合值: ```r as.data.frame(myfit, which = fitted) ``` - 提取残差序列: ```r as.data.frame(myfit, which = residuals) ``` - 提取方差序列: ```r as.data.frame(myfit, which = sigma) ``` 也可以使用 `which=all` 参数来提取所有相关信息。 通过 `plot(myfit)` 可以对模型结果进行图形诊断。如果模型检验通过,可以利用 `ugarchforecast` 函数对未来数据做出预测: ```r for <- ugarchforecast(myfit, n.ahead = 20) ``` 此外,在分析过程中还需要导入一些其他包来辅助完成时间序列的预处理、单位根检验以及自回归模型相关操作等任务,例如: - `zoo` 和 `xts` 包用于数据的时间格式预处理。 - `urca`, `tseries`, 及 `fUnitRoots` 用来进行单位根检验。 - `FinTS` 调用其中的自回归检验函数。 - `rugarch`, `nlsme`, 以及 `fArma` 包用于拟合和模型的相关操作。