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基于GCN网络的PPI数据集节点分类方法

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简介:
本研究提出了一种利用图卷积网络(GCN)对蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)数据进行节点分类的方法,提升了生物信息学中的预测精度和效率。 在PPI数据集上使用图卷积神经网络进行节点分类,包括GCN分类网络的搭建、PPI数据集的数据预处理以及节点分类网络的训练和测试代码。

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  • GCNPPI
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    本研究提出了一种利用图卷积网络(GCN)对蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)数据进行节点分类的方法,提升了生物信息学中的预测精度和效率。 在PPI数据集上使用图卷积神经网络进行节点分类,包括GCN分类网络的搭建、PPI数据集的数据预处理以及节点分类网络的训练和测试代码。
  • GCNCora和Citeseer实现
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    本研究利用图卷积网络(GCN)在Cora和Citeseer数据集中进行节点分类任务,实现了高效的特征学习与分类性能提升。 在Cora和Citeseer数据集上使用图卷积神经网络进行节点分类的任务包括:构建GCN分类网络、对Cora和Citeseer数据集进行预处理以及编写训练和测试的代码。
  • CoraGCN
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    本研究运用图卷积网络(GCN)在Cora文献引文数据集上进行节点分类实验,探索神经网络模型在半监督学习中的应用效果。 GCN节点分类在Cora数据集上的应用涉及利用图卷积网络对学术论文进行分类,其中每个节点代表一篇论文,并通过引用来构建整个文献网络的结构。这种方法能够有效捕捉到不同学科领域内的知识传播与演化模式,在研究和实际应用中显示出良好的性能。
  • 图卷积(GCN)与部件
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    本研究提出了一种基于图卷积网络(GCN)的方法,专门用于提升点云数据的分类和部件分割精度。通过将GCN应用于点云处理中,我们能够有效地捕捉到局部几何特征以及全局结构信息,从而在多个基准测试集上达到了最先进的性能水平。这种方法为自动驾驶、三维建模等领域提供了强有力的技术支持。 本项目是一个简单的图中点分类代码示例,涵盖了完整的网络搭建、模型训练、模型保存、模型调用及可视化全过程。该项目旨在帮助初学者快速熟悉图神经网络的训练流程,并为入门者提供指导和支持。
  • SOMIris
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    本研究采用自组织映射(SOM)神经网络对经典的Iris数据集进行分类,提出了一种高效准确的数据分类方案。 利用SOM(自组织映射)在Matlab程序中对数据进行分类。
  • BP神经Iris
    优质
    本研究采用BP神经网络对经典的Iris数据集进行分类,通过优化算法调整权重,实现高效准确的数据分类,验证了BP网络在模式识别中的应用潜力。 使用BP神经网络对iris数据集进行分类是一种不错的编程思路,适合初学者学习。
  • CARVANAUNet
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    本研究采用UNet网络模型,针对CARVANA数据集进行车辆图像的精确分割,优化了汽车零部件识别精度,为自动驾驶与智能检测提供技术支持。 基于CARVANA数据集的分割任务可以使用UNet网络进行高效处理。
  • BP神经Iris
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    本研究提出了一种基于BP(反向传播)神经网络的Iris数据分类方法,通过优化网络结构和训练算法,实现了对Iris数据集高效准确的分类。 使用BP神经网络对UCI平台上的iris数据进行分类,在适当调整误差精度后,可以实现高达99%的分类准确率。
  • [GCN论文解析PPT] DropEdge:用DeepGCN
    优质
    DropEdge是一种改进的DeepGCN方法,专注于通过在图形神经网络中随机删除边来防止过深模型中的特征退化问题,从而提高节点分类任务的效果。 需要制作一个原创的PPT来讲解论文《DROPEDGE: TOWARDS DEEP GRAPH CONVOLUTIONAL NETWORKS ON NODE CLASSIFICATION(Dropedge:面向节点分类的deepGCN)》,该PPT包含21页内容。
  • PPI析:聚中度研究
    优质
    本研究聚焦于运用PPI网络分析技术探讨蛋白质相互作用中的聚类现象及集中趋势,揭示生物分子间的复杂关联。 Louvain聚类与蛋白质间相互作用(PPI)网络的集中度分析存储库包含用于从PPI网络检测具有统计意义的重要社区的Python脚本。进行集中度分析需要使用Python 3.0、networkx 2.4、qstest 1.1.0和pandas 1.0.4。 用法如下: - 对于重要社区发现,可以运行命令:`python python/find_significant_module.py -n example/example_network.txt -g example/example_input.txt -o output_dir` - 要获取更多详细信息,请使用命令:`python python/find_significant_module.py -h` 对于中心性分析,则可执行: - 命令为: `python python/perform_centrality_analysis.py -n example/example_network.txt -g example/example_input.txt`