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3D MRI GAN:利用GAN进行3D T1w和T2w解剖MR图像的图像转换

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简介:
简介:本文介绍了一种基于Generative Adversarial Networks (GAN)的技术——3D MRI GAN,用于将三维T1加权(T1w)磁共振(MR)图像转化为对应的T2加权(T2w)解剖图像。此技术旨在提高医学影像分析的效率和准确性。 用于3D图像到图像翻译的生成对抗网络旨在训练一个模型,以从T1w图像创建T2w图像,并且可以反向操作。该模型接受完整的3D NIfTI格式输入,并能够直接生成相应模态的3D体积。 此研究基于Per Welander和Anders Eklund的工作开展。 在训练这一网络时面临的一大挑战是内存限制问题,因为整个数据集必须存储在GPU内存中才能实现合理的训练时间(少于一周)。为了进行这项3D GAN的研究,我们使用了一台配备有32GB RAM的NVIDIA Tesla V100 GPU。如果RAM不足,则可能会出现内存溢出错误。 系统设置: - 训练是在配备了CUDA版本10.2.89的NVIDIA Tesla V100上进行。 - 所需Python软件包的具体版本信息保存在requirements.txt文件中,建议将这些依赖项安装在一个虚拟环境中以避免冲突。例如: ``` python3 -m venv env source env/bin/activate pip install -r requirements.txt ```

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  • 3D MRI GANGAN3D T1wT2wMR
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    简介:本文介绍了一种基于Generative Adversarial Networks (GAN)的技术——3D MRI GAN,用于将三维T1加权(T1w)磁共振(MR)图像转化为对应的T2加权(T2w)解剖图像。此技术旨在提高医学影像分析的效率和准确性。 用于3D图像到图像翻译的生成对抗网络旨在训练一个模型,以从T1w图像创建T2w图像,并且可以反向操作。该模型接受完整的3D NIfTI格式输入,并能够直接生成相应模态的3D体积。 此研究基于Per Welander和Anders Eklund的工作开展。 在训练这一网络时面临的一大挑战是内存限制问题,因为整个数据集必须存储在GPU内存中才能实现合理的训练时间(少于一周)。为了进行这项3D GAN的研究,我们使用了一台配备有32GB RAM的NVIDIA Tesla V100 GPU。如果RAM不足,则可能会出现内存溢出错误。 系统设置: - 训练是在配备了CUDA版本10.2.89的NVIDIA Tesla V100上进行。 - 所需Python软件包的具体版本信息保存在requirements.txt文件中,建议将这些依赖项安装在一个虚拟环境中以避免冲突。例如: ``` python3 -m venv env source env/bin/activate pip install -r requirements.txt ```
  • CNN-3D-Tensorflow:CNN对3D分类
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    本文介绍了一种基于TensorFlow框架的深度学习模型,该模型采用卷积神经网络(CNN)技术来处理和分析三维图像数据,并实现高效的图像分类。 使用Tensorflow的CNN进行3D MRI分类任务需要解决一些挑战。代码依赖关系包括:Tensorflow 1.0、Anaconda 4.3.8 和 Python 2.7。 从3D医学图像中学习模型存在困难,主要是由于数据大小庞大(例如218x182x218或256x256x40)以及训练规模较小。此外,所有图像看起来非常相似,并且主体之间只有细微的差别。 为了解决这些问题,可以采取以下措施:配备高性能机器特别是增加RAM;在预处理阶段对图像进行下采样以减小数据量;通过旋转、平移等操作进行数据扩充来生成更多训练样本。此外还可以考虑利用迁移学习的方法提高模型性能。
  • 使 GAN DCGAN 生成
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    本章节探讨了利用生成对抗网络(GAN)及其变种深度卷积生成对抗网络(DCGAN)进行图像合成的技术。通过理论解析与实践案例,深入剖析了这两种模型的架构及应用场景,展示了如何运用它们创建逼真的图像数据。 使用GAN(生成对抗网络)和DCGAN(深度卷积生成对抗网络)来生成图像,并用Python编写相应的训练程序代码。请提供具体的训练代码实现。
  • 3D-GAN-PyTorch: PyTorch下3D-GAN实现
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    3D-GAN-PyTorch是一款基于PyTorch框架开发的深度学习项目,专注于三维生成对抗网络(3D-GAN)模型的构建与训练。 3D-GAN-火炬Pytorch实现。数据集可以通过wget命令下载http://3dshapenets.cs.princeton.edu/3DShapeNetsCode.zip,然后使用unzip解压文件,并将解压后的目录重命名为ModelNet。具体步骤如下: 1. 使用 wget 命令下载数据集:`wget http://3dshapenets.cs.princeton.edu/3DShapeNetsCode.zip` 2. 解压缩下载的文件:`unzip 3DShapeNetsCode.zip` 3. 将解压后的目录重命名为 ModelNet:`mv 3DShapeNetsCode ModelNet`
  • CTMRI
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    《CT和MRI影像解剖学图谱》是一本集成了大量高质量医学影像图片的专业书籍,系统地展示了人体各部位在CT与MRI成像中的表现,对于医学生、临床医师及研究人员具有极高的参考价值。 CT与MRI影像解剖学图谱是影像医学生的必备资料。
  • Python GAN卡通化【100011318】
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    本项目采用Python语言及GAN(生成对抗网络)技术,旨在实现高精度的人脸图像向卡通风格的转换,探索AI在艺术创作中的应用潜力。项目编号为【100011318】。 项目的运行流程主要分为图像预处理和卡通图像风格迁移两个部分。
  • 2D到3D:2D3D-MATLAB开发
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    本项目利用MATLAB实现从二维图像到三维模型的自动转换技术,旨在为用户提供简便高效的图像处理解决方案。通过创新算法和图形用户界面设计,使得非专业用户也能轻松完成复杂的图像转换任务。 从2D到3D:将2D输入图像转换为3D模型,使用MATLAB 2019b软件。支持的文件格式包括JPEG、JPG、TIF和DICOM。结果形式包括网格和3D点数据。
  • Pytorch-Image-Dehazing:使GAN去雾-源码
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    Pytorch-Image-Dehazing项目采用生成对抗网络(GAN)技术实现图像去雾效果。该项目提供了详细的代码和文档,帮助用户理解和应用深度学习方法解决图像处理问题。 该项目旨在实现基于GAN的图像去雾方法。生成器可以直接输出无雾图像而无需估计中间参数;鉴别器则可以引导生成器产生更真实的除雾结果。要运行此项目,您需要设置环境、下载数据集,并训练及测试网络模型。 已在一个配备GPU Titan V的Ubuntu 16.04系统上进行了测试,请注意执行代码时需使用到一个GPU设备,否则须对部分代码进行修改以适应CPU模式;不过在没有足够强大的硬件支持下用CPU运行可能会非常慢。因此建议您至少拥有大约12G内存和合适的显卡。 软件依赖关系推荐使用Python 3.5或3.6版本,并且需要安装以下库: - tqdm==4.19.9 - numpy==1.17.3 - tensorflow==1.12.0 - tensorboardX - torch==1.0.0 - Pillow==6.2.0
  • Python-Keras中使GAN去模糊
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    本篇文章将介绍如何在Python-Keras框架下利用生成对抗网络(GAN)技术实现图像去模糊应用,探索深度学习在计算机视觉领域的实际运用。 Keras实现的DeblurGAN:使用条件对抗网络进行盲动图去模糊。