
MAESTRO:单细胞转录组与规则组分析工具管道
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简介:
Maestro是一款专为单细胞转录组和表观基因组数据分析设计的高效软件管道,旨在简化复杂的数据处理流程,加速科学发现。
MAESTRO(Single-Cell Analysis Ecosystem for T-cell RNA and ATAC Sequencing)是一个综合的单细胞RNA-seq和ATAC-seq分析平台,内置了多种工具和软件包以创建一个集成管道。该系统能够从原始测序数据(fastq文件)开始进行比对、质量控制、细胞过滤、归一化、无监督聚类、差异表达等操作,并支持scRNA-seq协议及scATAC-seq协议的峰调用、细胞类型注释和转录调控分析。
更新记录:
v1.0.0 发布了MAESTRO。
v1.0.1 提供Docker镜像以方便安装。请注意,该映像不包含cellranger/cellranger ATAC及其相应的基因组索引。请根据安装说明自行安装相关工具。
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