MATLAB中用于管道中心线拟合的代码-PIPE

简介：
本段代码为在MATLAB环境中使用的PIPE工具，专门针对三维空间中的点云数据进行处理，通过优化算法精确提取出管道的中心线，适用于工业检测与自动化分析场景。 在Matlab环境中用于分析光电转换电影的软件包包括了一段拟合中心线的代码。这段代码是由Rotem Gura Sadovsky在麻省理工学院Jeremy England博士实验室开发，旨在为科学界提供帮助。 该软件名为光转换强度分布扩展（PIPE），能够测量活细胞中的蛋白质扩散情况。其工作原理是通过使用可光转换荧光蛋白产生的脉冲信号，在产生峰值荧光区域后分析随着扩散而变化的空间信号宽度。此信号的宽度直接反映了分子集合体在均方位移上的特性，进而可以计算出该集合体的扩散系数。 软件的主要执行文件包括： - PIPE.m：这是主程序，接收输入数据的形式为文件夹路径或由PIPE_read_2d_movie.m读取的Matlab矩阵。 - PIPE_read_2d_movie.m：这个脚本用于从原始的数据文件创建二维电影格式的数据矩阵。通常情况下用户无需直接运行此脚本。 分析的核心功能包括： - PIPE_calc_gaussian_widths.m：该函数使每个强度轮廓拟合高斯分布，并从中提取宽度信息。 -PIPE_calc_D_of_expanding_gaussians.m: 这个脚本进一步处理，计算扩散系数。