
Deep Learning in Genomics
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简介:
Deep Learning in Genomics探索深度学习技术如何应用于基因组学研究,涵盖从DNA序列分析到复杂遗传疾病预测等多个方面。通过模型训练和数据挖掘揭示生命科学的新见解。
卡耐基梅隆大学硕士岳天溦与Eric Xing教授的学生汪浩瀚合著的论文《深度学习在基因组学中的应用综述》探讨了深度学习技术如何应用于基因组研究领域,分析了不同模型的优势及劣势,并举例说明这些方法是如何解决实际问题的。同时文中也指出了当前科研面临的问题和挑战。
人类基因组计划的目标是测定构成人体染色体的所有30亿个碱基对序列,旨在绘制出完整的人类基因组图谱并解析其中包含的遗传信息。由于这一领域的研究需要处理大量数据,因此先进的测序技术至关重要。2000年首次商用化的高通量测序(High-throughput Sequencing, HTS)为该领域带来了革命性的变化。
Google Brain与Alphabet旗下的Verily公司共同开发了开源工具DeepVariant,它将HTS序列片段的拼接问题转化为图像处理分类任务来解决。通过使用Inception模型和深度神经网络技术,DeepVariant能够更准确地识别出测序结果中的变异信息。
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