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Matlab KPCA代码-PCA-PMI:量化网络直接关联部分互信息的代码

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简介:
这段代码实现了一种基于KPCA和PMI的方法来量化神经网络中节点间的直接相互作用强度。使用MATLAB语言编写,适用于复杂系统数据分析。 Matlab kpca程序中的PCA-PMI用于量化网络中直接关联的部分互信息。“PCA”在这里指PC算法(一种网络结构推断算法),与主成分分析无关。PMI是相互信息的一部分,用作估计条件独立性的新标准。 要使用我们实现的所有方法以及进行比较的方法,请运行/lib文件夹中的make.m脚本将路径临时添加到Matlab搜索路径中;如果希望永久添加该路径,则请运行make-p命令,并在完成后从“设置路径”底部删除此路径。以下是各函数的用途: - cmi.m:使用bin方法计算条件互信息 - pmi.m:使用bin方法计算部分互信息 - pmiguass.m:用高斯分布近似的方法来计算部分互信息 - dcorr.m:用于计算距离相关性 - pdcor:局部距离相关的计算函数 - graphicalLasso.m:利用图形拉索进行网络结构推断的实现代码。 - pca_pmi.m: 结合了PC算法和部分互信息,用于执行网络结构推断。 - kpca_pmi.m: 该文件结合核化后的部分互信息与PC算法以完成网络结构推理任务 - pca_cmi.m:利用条件互信息改进的PC算法来实现网络结构推断功能。 - pcapcc.m:使用皮尔逊相关性的PC算法进行网络结构推断。 示例代码请参见conf。

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  • Matlab KPCA-PCA-PMI
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    这段代码实现了一种基于KPCA和PMI的方法来量化神经网络中节点间的直接相互作用强度。使用MATLAB语言编写,适用于复杂系统数据分析。 Matlab kpca程序中的PCA-PMI用于量化网络中直接关联的部分互信息。“PCA”在这里指PC算法(一种网络结构推断算法),与主成分分析无关。PMI是相互信息的一部分,用作估计条件独立性的新标准。 要使用我们实现的所有方法以及进行比较的方法,请运行/lib文件夹中的make.m脚本将路径临时添加到Matlab搜索路径中;如果希望永久添加该路径,则请运行make-p命令,并在完成后从“设置路径”底部删除此路径。以下是各函数的用途: - cmi.m:使用bin方法计算条件互信息 - pmi.m:使用bin方法计算部分互信息 - pmiguass.m:用高斯分布近似的方法来计算部分互信息 - dcorr.m:用于计算距离相关性 - pdcor:局部距离相关的计算函数 - graphicalLasso.m:利用图形拉索进行网络结构推断的实现代码。 - pca_pmi.m: 结合了PC算法和部分互信息,用于执行网络结构推断。 - kpca_pmi.m: 该文件结合核化后的部分互信息与PC算法以完成网络结构推理任务 - pca_cmi.m:利用条件互信息改进的PC算法来实现网络结构推断功能。 - pcapcc.m:使用皮尔逊相关性的PC算法进行网络结构推断。 示例代码请参见conf。
  • MATLAB.rar_熵_MATLAB熵_合熵_
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    该资源包含一系列用于计算互信息熵、联合熵及条件熵的MATLAB代码。适用于研究和工程应用中涉及的信息理论分析,提供了一个便捷的数据处理工具包。 实现互信息程序化可以自动化地进行互信息熵计算和联合熵计算,无需手动操作,从而更加方便快捷。
  • MATLAB
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    本段落提供MATLAB环境下计算互信息的源代码,适用于研究及工程应用中分析变量间的统计依赖关系。 计算两幅图像的互信息和联合熵。 该函数接收两个图像并返回它们之间的互信息和联合熵。为了实现此功能,请下载joint_histogram.m文件(可在作者的资源库中找到)。 由Amir Pasha Mahmoudzadeh编写,赖特州立大学生物医学成像实验室。
  • MATLAB
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    这段简介可以描述为:MATLAB中的互信息源代码提供了一套用于计算两个随机变量之间统计依赖性的高效工具和函数,适用于信号处理、图像分析及机器学习等领域的研究与开发。 function mi = MI(a,b) % 计算a和b在重叠部分的互信息(Mutual Information, MI) [Ma,Na] = size(a); [Mb,Nb] = size(b); M=min(Ma,Mb); N=min(Na,Nb); % 初始化直方图数组 hab = zeros(256,256); ha = zeros(1,256); hb = zeros(1,256); % 归一化处理 if max(max(a))~=min(min(a)) a = (a-min(min(a)))/(max(max(a))-min(min(a))); else a = zeros(M,N); end if max(max(b))-min(min(b)) b = (b-min(min(b)))/(max(max(b))-min(min(b))); else b = zeros(M,N); end a = double(int16(a*255))+1; b = double(int16(b*255))+1; % 统计直方图 for i=1:M for j=1:N indexx = a(i,j); indexy = b(i,j) ; hab(indexx,indexy) = hab(indexx,indexy)+1; % 联合直方图 ha(indexx) = ha(indexx)+1; % a图直方图 hb(indexy) = hb(indexy)+1; % b图直方图 end end % 计算联合信息熵 hsum = sum(sum(hab)); index = find(hab~=0); p = hab/hsum; Hab = sum(-log(p(index)).*(p(index))); % 计算a图的信息熵 hsum = sum(ha); index = find(ha~=0); p = ha/hsum; Ha = -sum(log(p(index)).*p(index)); % 计算b图信息熵 hsum = sum(hb); index = find(hb~=0); p = hb/hsum; Hb = -sum(log(p(index)).*p(index)); % 计算a和b的互信息 mi = Ha+Hb-Hab; %计算归一化互信息(注释掉了,原文中未给出具体公式) % mi = hab/(Ha+Hb);
  • Matlab计算-Mutual-information-code:用于计算Matlab编写
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    这段代码是为使用Matlab编程语言计算两个随机变量之间的互信息而设计的。该项目提供了一个便捷的方法来评估数据集间的相互依赖性,适用于各种数据分析和机器学习场景。 互信息计算的Matlab代码用于衡量一个随机变量提供给另一个变量的信息量。它是无单位的度量,并以比特为单位表示,在已知另一随机变量的情况下量化不确定性的减少程度。高相互信息表明不确定性显著降低;低相互信息则意味着减少幅度很小;两个随机变量之间的互信息为零时,说明这两个变量是独立的。
  • 特征选择.txt
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    本文件包含用于实现基于联合互信息进行特征选择的Python代码,适用于机器学习和数据挖掘中筛选相关特征。 联合互信息特征选择的Python实现是基于参考文献《基于联合互信息的特征选择》的方法进行的。
  • 基于MATLABKPCA
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    本简介提供了一段基于MATLAB实现的KPCA(Kernel Principal Component Analysis)代码。该代码适用于数据降维和特征提取任务,并包含详细的注释说明。 KPCA的MATLAB代码在特征提取方面十分有效。
  • PCAKPCA及TE过程故障检测MATLAB+文章!
    优质
    本资源提供基于PCA(主成分分析)、KPCA(核主成分分析)和TE(独立分量分析)的过程故障检测方法及其MATLAB实现代码,并附有相关研究论文。 基于PCA与KPCA的TE过程故障检测资源包括MATLAB代码、PDF文档及Word文档。这些资料适用于毕业设计或相关研究项目使用。