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netplotbrain: net visualization tool for creating simple 3D networks in the brain

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简介:
利用三维可视化技术展示大脑中的网络结构,该工具采用Python语言实现无复杂操作的网络绘制过程。其核心功能包括: 支持灵活配置节点和边界的外观细节,例如设置大小、颜色等。用户可通过自定义样式快速生成符合需求的图形界面。 提供丰富的样式选择,用户可自定义不同视角的展示效果,并根据研究需要生成多角度图像以辅助分析。 安装方式为:使用pip安装源代码仓库地址(具体链接如下): https://github.com/wihetonicl/plotbrain 软件运行过程分为三个独立的部分: 1. 节点配置 2. 边界设置 3. 图形模板选择 用户无需同时指定所有部分即可开始绘图操作。 在使用过程中,您需要确定节点数量。具体方法包括: 方式一:直接输入坐标形式的数据框格式。 方式二:导入预定义的3D图像模板(Nodeimg)进行配置。 需要注意的是,Nodeimg支持两种存储形式: - 为3D NIFTI图像文件 - 或者是字典格式,可从templateflow资源集中获取图集信息 每个节点数据应包含坐标值x、y和z,并且这些值需对应于模板空间中的实际位置。

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