
基于Matlab的fMRI时间序列提取与功能连接矩阵构建代码
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简介:
本代码利用MATLAB实现功能性磁共振成像(fMRI)的时间序列数据提取及功能连接矩阵的建立,为神经科学研究提供技术支撑。
在图论分析中从fMRI数据提取复杂网络的主要步骤如下:
第一步:对采集的功能磁共振成像数据进行预处理,包括时间校正、重新对准、图像配准、基于分割的归一化以及空间平滑等操作。需要注意的是,这些预处理步骤的选择和顺序可能会影响最终图指标测量的结果。
第二步:为了探索大脑的大规模网络结构,应用适当的解剖学自动标记图谱来将整个大脑划分为若干皮质与皮质下的解剖单元。
第三步:通过计算特定区域内所有体素的时间进程平均值,得到该脑区的时间序列数据。
第四步:采用相关分析等方法确定不同脑区间时间序列的成对关联性。
第五步:通过对相关矩阵进行阈值处理获得二进制连通性矩阵(即邻接矩阵)。
第六步:利用大脑连接工具箱获取描述大脑网络结构的关键拓扑属性,包括局部和整体架构特征。
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