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Molecules_Dataset_Collection: 收集分子数据集以验证性质推测

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简介:
Molecules_Dataset_Collection项目致力于搜集广泛的分子数据集,用于测试和验证对分子特性的预测模型。 收集分子及其性质的数据集:它是什么?受到启发式分子(SMILES)和理化特性数据集的选择目标是什么? 数据集中包含的SMILES已通过将数据集聚集在同一位置进行整理。这些经过处理的数据集合在这里可以使用,用于验证各种机器学习模型在推断分子性质上的效果。 为了确保一致性,在所有数据集中进行了正则化处理以输出异构、规范和kekulise SMILES(如果无法成功进行此操作,则会保留原始SMILES并用空格替换)。这些数据集包括: 1. **量子力学**:QM9,包含通过DFT建模的小分子的几何形状、能量、电子及热力学性质。 2. **物理化学**:ESOL和FreeSolv,涉及溶剂化自由能与溶解度预测等任务。 3. **生物物理学(亲脂性)**:PCBA, HIV, BACE,用于评估药物活性以及相关生物学效应的研究中使用。 4. **生理学**:BBBP、Tox21、ToxCast、SIDER和ClinTox,这些数据集涵盖了血脑屏障渗透率预测及毒性研究等方面。

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  • Molecules_Dataset_Collection:
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    Molecules_Dataset_Collection项目致力于搜集广泛的分子数据集,用于测试和验证对分子特性的预测模型。 收集分子及其性质的数据集:它是什么?受到启发式分子(SMILES)和理化特性数据集的选择目标是什么? 数据集中包含的SMILES已通过将数据集聚集在同一位置进行整理。这些经过处理的数据集合在这里可以使用,用于验证各种机器学习模型在推断分子性质上的效果。 为了确保一致性,在所有数据集中进行了正则化处理以输出异构、规范和kekulise SMILES(如果无法成功进行此操作,则会保留原始SMILES并用空格替换)。这些数据集包括: 1. **量子力学**:QM9,包含通过DFT建模的小分子的几何形状、能量、电子及热力学性质。 2. **物理化学**:ESOL和FreeSolv,涉及溶剂化自由能与溶解度预测等任务。 3. **生物物理学(亲脂性)**:PCBA, HIV, BACE,用于评估药物活性以及相关生物学效应的研究中使用。 4. **生理学**:BBBP、Tox21、ToxCast、SIDER和ClinTox,这些数据集涵盖了血脑屏障渗透率预测及毒性研究等方面。
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    本文介绍了如何有效地将数据集划分成测试集、验证集和训练集,为机器学习模型提供科学的数据准备方法。 将数据集划分为测试集、验证集和训练集。
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    该数据集包含丰富的细胞图像及对应标注信息,旨在为科研人员和工程师提供一个全面的平台以评估和优化细胞分割算法的性能。 细胞分割是计算机视觉领域的一项关键任务,在医学影像分析中尤其重要,其目的在于自动识别并定位图像中的各个细胞或组织结构。数据集“细胞分割数据集-测试集+验证集.zip”提供了理想的学习平台,适合初学者进行人工智能和计算机视觉的实践。 该压缩包内包含以下几个主要文件夹: 1. **Training_Images**:这是训练集中存放图像的位置,用于模型学习及参数调整。通过这些图像,算法可以了解细胞的不同外观特征及其与背景的区别。 2. **Test_Images**:这一部分包含了测试集中的所有图像,旨在评估模型在新数据上的表现能力。它的目的是验证模型的泛化性能,即确保模型能够准确处理未见过的数据样本而不仅仅是记住训练时所见的内容。 3. **Test_Labels**:这是与测试集中每个图像对应的标签文件,指明了各个像素属于的具体类别(如细胞核、细胞膜等)。这些标签是评估模型准确性的重要依据。 4. **Training_Labels**:这一部分提供了每张训练图中精确的细胞边界信息。它是监督学习算法进行训练的基础。 处理此类数据集时,通常会遵循以下步骤: 1. 数据预处理:包括图像归一化、尺寸调整和噪声去除等操作,以确保模型能够从一致的数据集中学习。 2. 模型选择:可以考虑使用如U-Net、Faster R-CNN或Mask R-CNN这样的经典分割模型。这些模型在医学影像领域表现出色。 3. 模型训练:利用标注的训练集进行模型的学习和优化,通过反向传播来调整参数以实现尽可能准确的细胞分割预测。 4. 验证与调优:在验证集中评估模型性能,并根据需要通过调节超参数、改变网络结构或增加训练周期等方式来进行优化。 5. 最终测试:最后,在独立于训练集和验证集的新数据上进行测试,从而衡量模型的实际应用能力。 对于初学者而言,“细胞分割数据集-测试集+验证集.zip”提供了一个良好的起点。通过该平台可以学习如何加载及处理图像、构建并训练卷积神经网络(CNN),以及评估与展示结果的方法。此外,在有限的数据条件下优化模型也是实践过程中的一项重要课题,有助于理解小样本情况下模型的性能限制。
  • Oxford Flowers17,已随机割为训练
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    简介:Oxford Flowers17数据集包含多种不同类别花卉的图像,并已被随机划分为训练集、验证集与测试集,便于模型训练及效果评估。 本段落介绍了如何使用Keras进行迁移学习,并以Inception V3模型为例进行了讲解。通过这篇文章的学习,读者可以了解到利用预训练的深度神经网络来处理自己的数据集的方法,从而能够快速地构建出性能良好的图像分类器。该文章是《Keras 入门课6》系列的一部分,适用于希望在计算机视觉任务中应用迁移学习技术的新手和中级开发者。
  • 猫与鱼的:包含训练
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    本数据集为猫与鱼的分类项目设计,包括用于模型训练、测试和验证的三组图像数据。 这是一个关于机器学习领域中的图像分类任务的数据集。该数据集包括训练集、测试集和验证集,分别用于模型的学习、性能评估以及参数调优。这些集合是进行深度学习或传统机器学习算法的重要组成部分。 训练集为模型提供了基础的学习材料,其中包含了大量的带有“猫”或“鱼”标签的图像样本。通过观察这些样本,模型能够识别出区分两类对象所需的特征,并在预测过程中不断调整权重以减少误差,这一过程称为反向传播。 测试集用于评估模型在未见过的数据上的泛化能力。它包含了未知的图像数据,需要根据已学知识进行分类。这有助于我们了解模型是否过拟合或欠拟合。 验证集则是在训练期间用来优化超参数的一个中间集合。它可以提供一个不干扰测试集的情况下改进模型性能的方法。例如,我们可以利用验证集来确定最佳的学习轮次、选择最优的神经网络架构或者调整正则化参数等。 数据挖掘是任务开始阶段的关键步骤,包括清洗和预处理图像以及进行特征工程等工作。这可能涉及对图像进行归一化或统一尺寸以减少计算负担并提升模型效果;同时还需要解决缺失值、异常值等问题,并平衡两类样本的数量,避免模型偏向于数量较多的一类。 人工智能与机器学习是这一任务的技术核心,常用的方法包括卷积神经网络(CNN)和支持向量机(SVM)、随机森林等。由于其在图像处理方面的优越性,CNN常被用于此类分类问题中;它能够自动提取并学习到图像的局部特征。 算法的选择和设计对于解决问题至关重要。例如,在使用CNN时可以考虑采用LeNet、VGG、ResNet或Inception系列等多种架构,每种模型都有独特的优势与适用场景。比如:ResNet通过引入残差块来解决深层网络中的梯度消失问题;而Inception则利用多尺度信息处理技术以提高性能。 在训练阶段还需要选择合适的优化器(如SGD、Adam)和设计损失函数(例如交叉熵损失)。此外,还可以采用数据增强策略(比如旋转、翻转或裁剪等),来进一步提升模型的泛化能力。 这个数据集提供了一个完整的实践平台,涵盖了从预处理到训练再到测试等多个环节。它对于理解和掌握机器学习及深度学习的方法和技巧具有很高的价值。
  • VOC训练、的代码
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    本代码提供了一套高效的方法来将VOC数据集划分为训练集、验证集及测试集,便于机器学习模型的开发与评估。 一个简单的代码可以将VOC数据集按照7:1:2的比例划分为训练集、验证集和测试集,并将其放置在相应的VOC格式文件夹下。只需调整__main__中的三个路径,即可运行该程序来划分VOC数据集为train、val和test集合。