
基于MATLAB的LT码与BayesianDLM仿真——哥伦比亚大学任楚乔和钟瑞林的贝叶斯动态线性模型实现
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简介:
本文由哥伦比亚大学学者任楚乔和钟瑞林合作完成,利用MATLAB软件实现了LT码及Bayesian DLM(贝叶斯动态线性模型)的仿真研究。
LT码的MATLAB仿真代码与贝叶斯动态线性模型
这是关于贝叶斯动态线性模型实现的内容,作者为楚乔任、钟瑞林,哥伦比亚大学2016年春季CBMFW4761计算基因组学课程最终项目。特别感谢Itsik Peer博士和Suo Yang。
此repo包括以下文件夹:
- data_process:包含处理B.Pseudomallei数据及已处理过的相关数据的Python脚本。
- processing_data.csv:所有基因的数据
- processed_data_chromosome_1.csv:染色体1的所有基因数据
- processing_data_chromosome_2.csv:2号染色体上的所有基因数据
- DLM:包含贝叶斯动态线性模型的MATLAB实现,其中main.py是调用ltpdf.m函数的主要脚本。
- 模拟:包括用于模拟DLM数据的Python脚本。
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