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利用MATLAB,基于掩膜提取来自SPM12/CAT12的脑灰质体积值。

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简介:
最初,我们运用SPM12/CAT12软件对灰质、白质和脑脊液区域进行了分割,从而获得了分别对应的灰质体积图像文件。目前,目标是基于特定脑区的mask,提取其体积值并进行统计分析,同时将其与临床资料(如量表)进行相关性研究。 针对提取ROI(区域感兴趣)灰质体积的方法及相应的软件,我尝试了dpabi和restplus两种方案,但由于mask和灰质体积图像的体素大小不一致,以及缺乏配准等问题,导致程序在运行过程中频繁出现错误。即使经过reslice和配准操作,并尝试使用这两个软件进行修正,仍然无法解决这些报错问题。因此,我决定自行学习并基于MATLAB编写一个批量处理的脚本,该脚本能够根据mask自动提取灰质体积值。在使用该代码之前,必须首先进行reslice和配准处理,并对mask进行二值化操作,以确保其能够顺利运行并产生准确的结果。

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