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基于Python和NetworkX的快速实现Gephi ForceAtlas2图形布局算法_python_代码

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简介:
本文章介绍如何利用Python编程语言及NetworkX库高效地实现Gephi中的ForceAtlas2图布局算法,提供详尽的代码示例。 ForceAtlas2Gephi 是一个将 Force Atlas 2 布局算法移植到 Python 的项目,支持Python 2 和 Python 3,并且提供了与 NetworkX 和 igraph 库的接口。这是目前最快的 Python 实现之一,大多数功能已经完成。此外,它还支持 Barnes Hut 近似以实现加速效果。 ForceAtlas2 是一种快速力导向图布局算法,适用于在二维空间中对加权无向图进行可视化(边权重表示连接强度)。该实现基于相关论文和 Gephi 的 Java 代码。与 NetworkX 中的 Fruchterman-Reingold 算法相比,它运行速度更快,并且可以很好地处理大量节点(超过10,000个)的情况。 强烈建议在构建源代码时使用 Cython,因为这可以使算法的速度提高10到100倍。

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  • PythonNetworkXGephi ForceAtlas2_python_
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    本文章介绍如何利用Python编程语言及NetworkX库高效地实现Gephi中的ForceAtlas2图布局算法,提供详尽的代码示例。 ForceAtlas2Gephi 是一个将 Force Atlas 2 布局算法移植到 Python 的项目,支持Python 2 和 Python 3,并且提供了与 NetworkX 和 igraph 库的接口。这是目前最快的 Python 实现之一,大多数功能已经完成。此外,它还支持 Barnes Hut 近似以实现加速效果。 ForceAtlas2 是一种快速力导向图布局算法,适用于在二维空间中对加权无向图进行可视化(边权重表示连接强度)。该实现基于相关论文和 Gephi 的 Java 代码。与 NetworkX 中的 Fruchterman-Reingold 算法相比,它运行速度更快,并且可以很好地处理大量节点(超过10,000个)的情况。 强烈建议在构建源代码时使用 Cython,因为这可以使算法的速度提高10到100倍。
  • Graphology-Layout-ForceAtlas2ForceAtlas 2
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    Graphology-Layout-ForceAtlas2是一款采用ForceAtlas 2算法优化的高效图形布局工具,适用于复杂网络数据可视化,助力用户探索和理解大规模图结构。 笔迹学FortAtlas2 算法的JavaScript实现参考了Jacomy M、Venturini T、Heymann S 和 Bastian M(2014)在《公共科学学报》上发表的文章,文中介绍了ForceAtlas2算法,这是一种为Gephi软件设计用于网络可视化的连续图布局算法。要使用此算法,请先安装graphology-layout-forceatlas2模块。 使用方法 在运行ForceAtlas 2布局之前,必须设置每个节点的初始位置。因此需要定义一个名为x和y的属性来表示所有图形节点的位置。如果有必要,可以初始化这些属性为随机或圆形布局形式。需要注意的是,在所有节点都以坐标(0,0)开始的情况下,算法可能无法计算出合理的图布局。 设定值 - AdjustSizes:boolean类型,默认false;是否考虑节点大小。 - barnesHutOptimize:boo(原文中的这一项似乎未完成,请根据需要补充完整)。
  • PythonNetworkXBGLL社区划分
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    本研究利用Python编程语言及其NetworkX库实现并分析了BGLL社区检测算法,有效识别复杂网络中的紧密联系群体。 算法来自论文《Fast unfolding of communities in large networks》是一种快速的非重叠社团划分方法。使用该算法时,直接调用BGLL函数,并将Graph类型的变量作为参数传入即可获取结果。返回值包括社区结构的结果以及每个节点对应的社区编号。
  • FFTMATLAB
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    本项目提供了一套基于快速傅里叶变换(FFT)实现信号处理中常用快速算法的MATLAB代码,适用于科研与工程应用。 基二快速FFT变换的Matlab实现算法包括了位反转排序、基二FFT以及IFFT。
  • 原生JS树状.zip
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    本资源提供了一个使用纯JavaScript编写的树状图布局算法,适用于前端开发中的数据可视化需求。通过简洁高效的代码实现了节点自动定位及层级关系展示功能。 该算法用原生的JavaScript实现了树布局,并通过大规模数据测试验证了其有效性,在算法上没有任何问题。此外,它还支持垂直树布局。
  • MATLAB部特征FPFH(点特征直方).zip
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    本资源提供了一种利用MATLAB语言实现快速点特征直方图(FPFH)算法的方法,专注于云计算中的局部特征提取。适合于三维物体识别与匹配的研究和应用开发。 版本:Matlab 2014/2019a 领域:智能优化算法、神经网络预测、信号处理、元胞自动机、图像处理、路径规划以及无人机等多种领域的Matlab仿真。 内容:标题所示,详细介绍可通过主页搜索博客获取。 适合人群:本科及硕士等教研学习使用。 博主介绍:热爱科研的Matlab仿真开发者,在修心和技术上同步精进。如有matlab项目合作需求,请私信联系。
  • C#中排序
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    本篇文章详细介绍了如何在C#编程语言中实现快速排序算法,并提供了完整的代码示例。快速排序是一种高效的排序方法,在计算机科学中应用广泛。通过阅读本文,您可以了解其工作原理并将其应用于实际项目中。 生成n个随机数并存入数组中,然后对这n个数进行快速排序。
  • 不变矩
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    本文介绍了一种计算图像处理中不变矩的高效算法,并提供了详细的代码实现。通过优化算法流程和数据结构设计,提高了计算速度与准确性,为模式识别和机器学习应用提供有力支持。 不变矩及其快速算法代码 有注释 易看懂
  • 随机扩展树路径规划
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    本项目提供了一种基于随机快速扩展树(RRT)的路径规划算法的代码实现。通过模拟环境中的随机采样与优化迭代,该算法能够有效解决高维空间下的非holonomic机器人路径规划问题,适用于复杂场景中寻找近似最优路径的应用需求。 随机快速扩展树路径规划算法的代码实现有几个例子可供学习,非常值得参考。