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TBtools提供生物信息分析功能。

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简介：
该软件的核心应用领域是生物信息学相关的数据分析工作。其主要功能涵盖了序列数据的批量提取、便捷的转存操作，以及深入的转录组富集分析能力，旨在为用户提供全面的生物信息学分析工具支持。

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  • 生物信息分析-TBtools
    优质
    TBtools是一款专为生物信息学研究设计的强大工具箱，它集成了基因组、转录组等多方面的数据分析功能，旨在简化复杂的数据处理流程。 该软件主要用于生物信息相关的分析工作。主要功能包括批量提取序列、转存以及转录组富集分析。
     
  • 生物信息学分析脚本
    优质
    简介：本项目汇集了一系列用于生物信息学研究的自动化脚本，旨在简化DNA序列分析、基因表达数据处理及蛋白质结构预测等任务。 在Linux系统上使用Python编写脚本来转换RNA数据格式。
     
  • R语言生物信息学分析
    优质
    《R语言生物信息学分析》是一本介绍如何利用R编程语言进行生物学数据处理与统计分析的专业书籍，涵盖基因表达、序列比对等主题。 在R语言的生物信息分析中，可以使用vegan包进行Anosim分析。
     
  • 生物信息学分析示例文档
    优质
    本文档提供了详细的生物信息学数据分析流程和实例，涵盖序列比对、基因预测及通路分析等技术，旨在帮助科研人员有效开展生物数据研究。 通过生物信息学分析挖掘在癌症中的三个MicroRNA,为肿瘤治疗提供潜在靶点。
     
  • 生物信息学技能树
    优质
    《生物信息学技能树》是一份详尽的学习指南，旨在帮助学生和研究人员掌握从基础到高级的生物信息学技术与工具。该书通过构建一个系统的知识框架，引导学习者逐步深入探索基因组学、蛋白质组学等领域的数据处理方法及应用技巧，为生物学研究注入新的动力。 生信技能树的创始人制作的内容有需求可以下载。
     
  • TBtool-生物信息学技术分析工具
    优质
    TBtool是一款集成了多种生物信息学常用功能的综合性软件工具箱，旨在为研究人员提供便捷的数据处理和分析服务。 TBtools-生物信息分析是一款非常实用的工具，可以用于查找基因序列以及进行相关基因研究。它的主要功能包括批量提取、转存序列和转录组富集分析等。这款软件主要用于生物信息相关的数据分析工作。
     
  • WPS提供的API功能
    优质
    WPS提供的API功能简介涵盖了文档处理、表格操作、演示文稿制作等多方面的接口服务，便于开发者集成和扩展应用。 使用WPS提供的API函数进行WPS二次开发。
     
  • 陈连福的生物信息分析Perl程序 blast.pl
    优质
    简介：该Perl脚本由陈连福开发，名为blast.pl，旨在简化和优化生物信息学中BLAST工具的应用，帮助研究人员高效地进行序列比对与分析。 使用说明：/home/chenlianfu/chenlianfu_scripts/blast.pl [选项] BLAST_DB file.fasta > out.txt --tmp-prefix <字符串> 默认值为 blast。设置临时文件或目录的前缀，默认情况下，程序会生成名为 command.blast.list 的命令列表和名为 blast.tmp 的临时文件夹。 --chunk <整数> 默认值为 10。设定每个数据块中的序列数量。输入 FASTA 文件会被分割成多个部分，每份包含相邻的十条序列；在 blast.tmp/ 目录下生成次级目录存放这些分段的 fasta 文件，并且为每一个文件夹创建一个 BLAST 命令到 command.blast.list 中；随后程序会调用 ParaFly 来进行并行计算。请注意，如果数据块数量超过一百万个，默认设置可能导致 blast.tmp/ 目录中的子目录过多（超出一万个），这将导致文件系统运行速度变慢且影响 ParaFly 的效率，并不能充分利用服务器资源。此时建议调整 --chunk 参数值为 100。 --blast-program <字符串> 默认使用 blastp 命令，支持的命令包括：blastn, blastp, blastx, tblastn 和 tblastx。 --CPU <整数> 默认设置为单线程运行 BLAST 程序。设定并行执行 BLAST 的程序数量。 --blast-threads <整数> 默认值为 1，用于指定 BLAST 命令的 -num_threads 参数值，这个参数允许每个 BLAST 进程使用多线程进行计算。请注意：--CPU 和 --blast-threads 设置乘积不应超过服务器总 CPU 线程数量。 --evalue <浮点数> 默认设置为 1e-3，设定用于 BLAST 命令的 -evalue 参数值。 --outfmt <整数> 默认输出格式为 XML（5）。支持表格形式的结果输出。如果 --outfmt 设置为6或7，则分别对应不同的表格结果输出模式。 --max-target-seqs <整数> 默认设置为 20，用于指定 BLAST 命令的 -max_target_seqs 参数值，此参数定义了BLAST在数据库中最多匹配序列的数量。 -cleanup：若选择添加该选项，在程序执行成功后会自动删除临时文件或目录。
     
  • 生物信息聚类热图示例数据分析
    优质
    本案例提供了一套详尽的生物信息聚类热图分析流程，涵盖数据预处理、统计计算及可视化展示等环节，旨在帮助科研人员快速理解和应用该技术。 用于“生物信息可视化 01 | 聚类热图”的例子数据均为虚拟数据，与实际生物学过程无关。这些示例数据旨在展示如何使用聚类热图进行数据分析和呈现，而不涉及具体的实验结果或真实世界的数据集。
     
  • 常用的生物信息学数据分析软件
    优质
    本资源合集涵盖了多种常用生物信息学数据分析软件，旨在为研究者提供便捷的数据处理和分析工具，适用于基因组学、转录组学等多个领域。 本段落概述了多种生物信息学分析中常用的软件和技术，并提供了具体的使用方法及示例代码。