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心脏扩散MRI:心肌中DWI和DTI的运用 - MATLAB开发相关...

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简介:
本项目基于MATLAB开发,专注于利用心脏扩散MRI技术进行心肌DWI及DTI成像分析,旨在深入研究心肌结构与功能。 此存储库包含或将包含以下内容: - 在MATHEMATICA中调整了自旋回波单极、自旋回波双极、受激回波采集模式单极、两次重新聚焦以及两次重新聚焦的序列图,包括bmatrix、M0-M1-M2、速度偏移和麦克斯韦梯度矩。 - C. Tous等人 (2020) 在 MATLAB 中发表的文章中介绍的先天性心脏病 (CHD) 标本的弥散加权图像 - 使用 MRTRIX 软件处理的,C. Tous 等人 (2020) 的文章中介绍的 CHD 标本的牵引成像 参考文献: Tous, C., Gentles, TL, Young, AA et al. Ex vivo cardiovascular magnetic resonance diffusion weighted imaging of congenital heart disease: microstructural insights into tetralogy of Fallot with double outlet right ventricle and tricuspid atresia in a single systemic right ventricular system. J Cardiovasc Magn Reson 22, 69 (2020). https://doi.org/10.1186/s12968-020-00662-8

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客服
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  • MRIDWIDTI - MATLAB...
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    本项目基于MATLAB开发,专注于利用心脏扩散MRI技术进行心肌DWI及DTI成像分析,旨在深入研究心肌结构与功能。 此存储库包含或将包含以下内容: - 在MATHEMATICA中调整了自旋回波单极、自旋回波双极、受激回波采集模式单极、两次重新聚焦以及两次重新聚焦的序列图,包括bmatrix、M0-M1-M2、速度偏移和麦克斯韦梯度矩。 - C. Tous等人 (2020) 在 MATLAB 中发表的文章中介绍的先天性心脏病 (CHD) 标本的弥散加权图像 - 使用 MRTRIX 软件处理的,C. Tous 等人 (2020) 的文章中介绍的 CHD 标本的牵引成像 参考文献: Tous, C., Gentles, TL, Young, AA et al. Ex vivo cardiovascular magnetic resonance diffusion weighted imaging of congenital heart disease: microstructural insights into tetralogy of Fallot with double outlet right ventricle and tricuspid atresia in a single systemic right ventricular system. J Cardiovasc Magn Reson 22, 69 (2020). https://doi.org/10.1186/s12968-020-00662-8
  • MRI数据集.7z
    优质
    心房心脏MRI数据集.7z包含高质量的心脏磁共振成像(MRI)图像,专注于心脏心房区域。此数据集旨在支持医学研究与教育,促进心脏病学领域的诊断和治疗进展。 Cardiac MRI Dataset 是一个心房医疗影像数据集,包含来自心脏病患者的图像资料。该数据集包括33位患者共计7980张图片,并详细标注了左心室的心内膜与外膜信息。这一数据集由IBM Research – Almaden的Brain-Inspired Computing小组于2008年发布,主要贡献者为Alexander Andreopoulos和John K. Tsotsos。相关研究论文题目是《Efficient and Generalizable Statistical Models of Shape and Appearance for Analysis of Cardiac MRI》。
  • Python在MRI图像分割
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    本研究探讨了Python编程语言在处理和分析心脏磁共振成像(MRI)数据中的作用,特别关注于自动图像分割技术的应用与优化。通过结合先进的机器学习算法,我们展示了如何利用Python高效准确地识别并区分心脏结构,为心脏病学的诊断和治疗提供有力支持。 心脏核磁共振(MRI)图像分割是指对心脏MRI影像进行精确划分和分析的过程,目的是为了更准确地识别和评估心脏结构及其功能状态。这一过程在心脏病学研究与临床诊断中具有重要意义。通过计算机辅助技术实现的自动或半自动图像分割能够提高医生的工作效率,并有助于提供更加精准的医疗建议和支持。
  • DTI与纤维追踪:利Matlab进行MRIDTI),计算FA、ADC、矢量场并可视化神经束-_matlab
    优质
    本项目采用MATLAB实现基于扩散张量成像(DTI)的数据分析,包括纤维追踪及FA、ADC参数的计算,并对神经束进行可视化展示。 简单的扩散 MRI (DTI) 和纤维跟踪 (FT) 功能及示例。 - DTI.m:此脚本将计算由至少6个不同MRI梯度的数据集以及至少1个无梯度数据集组成的DTI数据集的表观扩散系数(ADC)、分数各向异性(FA)和扩散张量场。 - FT.m:从大脑中的每个点开始,该脚本会计算神经束,并输出所有穿过某个感兴趣区域 (ROI) 的纤维。 可以尝试运行 DTI_example.m 和 FT_example.m 来了解这些功能的具体应用。
  • MRI影像数据集
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    本数据集包含大量心脏病患者的高质量MRI影像资料,旨在支持医学研究与诊断技术的发展,促进心血管疾病的早期检测和治疗。 Cardiac MRI 是一种用于心脏病患者心房的医疗影像数据,并包含其左心室的心内膜和外膜图像标注。该数据集包括33位患者的案例,共有7980张图像。作者发布的数据集是经过处理后的 Matlab 数据文件,而非原始图像文件。
  • 分割在MRI图像 - 数据集
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    本数据集专注于心脏分割技术在磁共振成像(MRI)中的应用研究,提供详细的MRI图像及对应的心脏标注信息。旨在促进医学影像分析领域的学术交流和技术进步。 MRI图像中的心脏分割涉及使用特定的数据集进行研究和分析。相关的数据集文件包括Heart Segmentation in MRI Images_datasets.txt 和 Heart Segmentation in MRI Images_datasets.zip。这些资源对于开展基于MRI的心脏区域自动识别与标注的研究非常有用。
  • MATLAB 血管线提取
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    本研究利用MATLAB软件开发了一种心脏血管中心线自动提取算法,旨在提高心血管疾病诊断效率和准确性。该方法结合图像处理技术,实现对复杂冠状动脉结构的有效分析。 利用Matlab程序提取心脏血管中心线并实现心血管分割。
  • 细胞视频计量量化BeatMap-MATLAB
    优质
    本项目致力于通过MATLAB开发的心肌细胞视频量化工具BeatMap,实现对心肌细胞收缩行为的高效分析与可视化。 BeatMap是一款专为心肌细胞运动量化设计的MATLAB App Designer应用。该工具利用快速傅里叶变换(FFT)互相关技术对AVI格式视频数据进行分析,旨在研究和理解心肌细胞收缩与舒张过程,这对于心血管疾病的研究、药物筛选及教学具有重要意义。 MATLAB是MathWorks公司开发的一种强大的数值计算和编程环境,在工程、科学计算和数据分析领域广泛应用。App Designer是MATLAB中的一个图形化用户界面(GUI)开发工具,允许非专业程序员通过拖放组件创建交互式应用程序而无需深厚的编程基础。BeatMap使用App Designer使视频分析变得简单易用。 FFT互相关是一种信号处理技术,用于估计两个信号之间的相似性或关联程度。在BeatMap中,此技术被用来比较连续帧间的细胞运动变化以检测微小位移。具体来说,它首先对每一帧进行快速傅里叶变换,然后计算每帧与参考帧的互相关函数来识别心脏细胞周期性搏动模式。 心肌细胞视频计量量化过程包括以下关键步骤: 1. **预处理**:消除噪声并提高后续分析准确性和可靠性。这可能涉及灰度转换、去噪和平滑滤波。 2. **细胞分割**:通过图像处理技术(如阈值分割、边缘检测或区域生长算法)将心肌细胞从背景中分离出来。 3. **特征提取**:确定用于追踪运动的关键点,通常包括计算质心和边界点等信息。 4. **FFT变换**:对每一帧的细胞特性进行快速傅里叶变换以分析频率成分。 5. **互相关性评估**:比较每帧与参考帧来识别最佳匹配位置并测定相对位移变化。 6. **结果可视化**:将运动模式呈现为图形,如位移曲线、速度图或力图等便于理解的形式。 7. **数据分析**:计算平均速度、振幅和周期参数以提供科学研究的定量指标。 压缩文件`code_20170518_beatmap.zip`可能包含了BeatMap应用源代码及示例数据,通过查看运行这些资源可以帮助用户深入了解其工作原理并进行定制或扩展。总体而言,BeatMap结合了MATLAB和App Designer的优势,在心血管生理学研究中提供了高效直观的研究平台。
  • Python病患者特征分析
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    本项目利用Python进行心脏病患者的数据挖掘与统计分析,旨在识别关键风险因素和疾病模式,为临床诊断提供数据支持。 今天要跟大家分享的数据集分析是关于心脏病的。作为全球第一大杀手,心脏病是我们不得不提前防御的一种疾病。今天我们利用这个数据集中的一些规律来找出哪些特征对于确诊有较大影响,并提醒大家注意平时的生活习惯。 在开始分析之前,需要先介绍一下这份从Kaggle下载的数据集。接下来我们对其中的字段进行简要说明: - age:年龄 - sex:性别(1表示男性,0表示女性)
  • 疾病展数据集.zip
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    本资料包包含一个扩大的心脏疾病研究数据集,旨在为心脏病预测模型提供更为全面和多样化的训练资源。 标题中的“心脏病拓展数据集.zip”表明这是一个与医疗领域相关的大数据集,专注于心脏病的数据分析。这个数据集可能包含了各种关于心脏病患者的个人信息、临床检查结果、病史等多维度信息,旨在为研究者提供丰富的素材进行疾病预测、诊断模型开发或健康研究。 描述中提到的文章详细介绍了如何使用该数据集。通过这篇文章,我们可以获取到更多关于数据集的结构、特征和解析方法的信息。这可能是对心脏病数据集的预处理步骤、数据清洗、特征工程以及利用Python编程语言进行数据分析的一个示例。 标签“大数据”暗示了这个数据集规模可能非常大,包含大量的记录和复杂的结构。通常需要高效的数据存储和处理技术来应对这样的大规模数据集,如Hadoop或Spark等工具。同时,在使用Python作为主要分析工具时,我们可以期待看到利用Pandas、NumPy及Scikit-learn库进行数据分析的实践。 在压缩包内的文件名称列表中,“2.zip”、“3.zip” 和 “1.zip” 这三个子文件可能表示数据被分成了三部分。这可能是为了便于管理和处理大规模的数据集,通常需要将这些分块合并成一个完整的数据集再进行统一分析。 结合以上信息,我们可以从中提取出以下知识点: 1. 医疗数据分析:该数据集用于心脏病相关的研究任务,包括患者特征分析、疾病风险预测等。 2. 大数据处理技术:由于涉及大数据标签,需要掌握分布式计算框架如Hadoop或Spark,并了解如何在大规模数据上进行高效操作。 3. Python编程技能:Python是当前主流的数据科学工具之一。熟悉Pandas用于数据清洗和处理,NumPy用于数值计算以及Scikit-learn库来构建机器学习模型至关重要。 4. 数据预处理流程:包括清理缺失值、异常值等步骤,并实施特征选择与工程以提高预测准确性。 5. 文件分块的合并操作:理解如何将多个压缩文件中的内容整合在一起,可能需要使用Python中的`zipfile`模块进行相关工作。 该心脏病拓展数据集为学习者提供了从获取原始资料到最终模型构建的一站式平台。这使得它成为提升医疗大数据处理能力和掌握Python编程技能的理想选择。