
Matlab口罩识别代码-mZAP:更新了用于ZMW/TIRF成像的区域投影功能,该工作正在进行中。
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简介:
该项工作,即Matlab口罩识别代码ZMW分析平台(ZAP),目前正处于持续的开发阶段,尚未达到最终完成。该平台由Matlab构建,并包含一个分析工具和图形用户界面(GUI),旨在支持利用零模式波导(ZMW)进行配体结合的单分子成像实验。此存储库囊括了我期间在威斯康星大学麦迪逊分校攻读博士学位时编写的一系列软件程序。该平台的核心功能包括:图像蒙版创建者,能够生成阈值图像掩码以精确地定位TIFF图像中的单分子时间序列;创建器,用于在一个TIFF图像堆栈中,对每个局部单分子位置生成强度值的时间序列数据;以及理想化时间序列集成模块,该模块整合了我在近期发表的文章中提出的,使用自上而下的机器学习方法对给定时间序列中的状态和转换进行无监督识别的技术。此外,DISC还提供了对理想化时间序列的通用分析功能,涵盖停留时间分析、状态占用分析、漂白步骤分析等,并支持导出数据到QuB软件进行更高级的隐马尔可夫建模。项目成功实施离不开威斯康星大学麦迪逊分校BaronChanda博士和RandallH.Goldsmith博士的宝贵支持。我同样衷心感谢MarcelGoldschen-Ohm博士和OwenRafferty博士对早期代码的积极贡献。我的学术论文成果...
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