
MATLAB直方图裁剪代码-OCT-tools:用于脉络膜及视网膜层的OCT B扫描分割与分析
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简介:
这段代码是为使用MATLAB进行光学相干断层扫描(OCT)B扫描图像中脉络膜和视网膜层的精确分割而设计,提供详细的分层分析。
MATLAB裁剪直方图代码用于OCT工具,旨在从单个OCT B扫描图像中分割并分析视网膜层,重点在于计算脉络膜厚度。此代码由华盛顿大学的Sara Patterson开发。
使用方法如下:当所有图像都放在一个以数字命名的文件夹内时(例如1.png、2.png等),该代码运行效果最佳。经过处理和分析后的数据将以im1_、im2_等前缀保存。
若要比较同一只眼睛中的不同图像,首先需要将它们对齐。这可以通过alignImages.m函数实现,此函数会计算两个图像之间旋转所需的参数,并将其存储下来。完成分割后可以进一步确定沿X轴的平移量。
裁剪步骤:在OCT类中使用octImage属性返回经由特定角度旋转后的图像版本之后进行裁剪操作最为理想,在执行旋转处理后再裁减能取得更好的效果。MATLAB内置函数imcrop在此过程中非常有用。
用户可以在命令行输入ChoroidApp并选择所需分析的图像,或者直接将文件路径或OCT类作为第一个参数传递给该程序。
此外,代码还支持手动添加用于标记脉络膜-巩膜边界的控制点,并提供了一维直方图和峰谷检测功能以帮助更准确地定位这些边界。
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