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一个基于双螺旋PSF拟合3D单分子图像的开源GUI工具。

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简介:
当运用双螺旋点扩散函数(DH-PSF)技术进行宽视场显微镜观察时,这款配备MATLAB的MATLAB示例程序包能够帮助科学家精确测量单个分子的三维位置。此版本进一步增强了功能,加入了基于本地加权二次3D配准函数的代码,该函数旨在整合来自两个光谱通道的位置数据。具体而言,它通过对明亮的固定荧光发射器(例如磁珠)进行轴向扫描来校准双高斯估计量,随后利用DH定位进行模板匹配以及后续的双高斯拟合。此外,该程序包还支持使用模板匹配分析SM图像的Tiff堆栈,并执行双高斯拟合以获得分子位置的估算值。最后,通过从控制点生成局部加权的二次映射函数,实现了两个光谱通道的注册与对齐。

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    Easy-DHPSF是一款开源图形界面工具,专门设计用于在三维单分子成像数据中进行双螺旋点扩散函数(DH PSF)的精确拟合。 使用双螺旋点扩散函数(DH-PSF)宽视场显微镜时,这种附带MATLAB例程包可以帮助科学用户测量单个分子的三维位置。版本2还包含代码特征,这些特征利用本地加权二次3D配准功能来结合来自两个光谱通道的数据定位信息——通过轴向扫描明亮固定荧光发射器(例如磁珠)校准双高斯估计量;使用DH定位进行模板匹配,并随后执行双高斯拟合。此外,该程序包可以分析SM图像的Tiff堆栈并提取分子位置的估算值,方法是先利用模板匹配技术然后通过双高斯拟合来实现这一目的。它还允许从控制点对生成局部加权二次映射函数以注册两个光谱通道。
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