Advertisement

DFT的MATLAB源代码-VASP-DOS提取器:基于Pymatgen的Python脚本,用于从vasprun...

  •  5星
  •     浏览量: 0
  •     大小:None
  •      文件类型:None


简介:
这段代码是为Materials Science社区提供的一个开源工具,它利用Python和Pymatgen库来解析VASP计算生成的vasprun.xml文件,并从中提取态密度(DOS)数据。此外,该脚本还提供了将DOS结果转换成MATLAB可读格式的功能,以便进一步的数据分析与可视化处理。 DFT的MATLAB源代码VASP_DOS_extractor简介:这是一个基于Python库pymatgen编写的脚本,用于从vasprun.xml文件中提取状态密度(DOS)以及投影态密度数据。 该脚本替代了使用p4vasp进行常见操作的一种方式——即从输出中抽取DOS信息。尽管p4vasp提供了一个直观的图形用户界面,但当处理包含大量原子、能带和能量网格的数据时,这个过程可能变得耗时且繁琐。在运行此脚本前,请确保已安装了Python库pymatgen。 使用p4vasp的传统步骤包括:下载xml文件至本地计算机(通常超过100MB)、打开该xml文件于p4vasp界面、选择绘制特定元素或单个原子的局部投影态密度,并将提取的数据导出到指定文件名中。利用DOS_extractor.py脚本,上述操作可以通过单一命令行实现: $python DOS_extractor.py [xml_filename] [out_filename] [entries_or_options] 其中[xml_filename]: 输入vasprun.xml文件; [out_filename]: 输出结果的保存路径及名称。 该方法大大简化了从VASP计算中提取DOS信息的过程,节省了大量的时间和精力。

全部评论 (0)

还没有任何评论哟~
客服
客服
  • DFTMATLAB-VASP-DOSPymatgenPythonvasprun...
    优质
    这段代码是为Materials Science社区提供的一个开源工具,它利用Python和Pymatgen库来解析VASP计算生成的vasprun.xml文件,并从中提取态密度(DOS)数据。此外,该脚本还提供了将DOS结果转换成MATLAB可读格式的功能,以便进一步的数据分析与可视化处理。 DFT的MATLAB源代码VASP_DOS_extractor简介:这是一个基于Python库pymatgen编写的脚本,用于从vasprun.xml文件中提取状态密度(DOS)以及投影态密度数据。 该脚本替代了使用p4vasp进行常见操作的一种方式——即从输出中抽取DOS信息。尽管p4vasp提供了一个直观的图形用户界面,但当处理包含大量原子、能带和能量网格的数据时,这个过程可能变得耗时且繁琐。在运行此脚本前,请确保已安装了Python库pymatgen。 使用p4vasp的传统步骤包括:下载xml文件至本地计算机(通常超过100MB)、打开该xml文件于p4vasp界面、选择绘制特定元素或单个原子的局部投影态密度,并将提取的数据导出到指定文件名中。利用DOS_extractor.py脚本,上述操作可以通过单一命令行实现: $python DOS_extractor.py [xml_filename] [out_filename] [entries_or_options] 其中[xml_filename]: 输入vasprun.xml文件; [out_filename]: 输出结果的保存路径及名称。 该方法大大简化了从VASP计算中提取DOS信息的过程,节省了大量的时间和精力。
  • Discord-Scraper:Discord服务和媒体Python
    优质
    Discord-Scraper是一款专为Python用户设计的工具,能够便捷地从Discord服务器中提取文本消息及各类媒体文件,便于数据收集与分析。 在配置不和谐刮板机目录中的桌面应用程序时,请遵循以下步骤: 1. 打开Discord应用并进入用户设置。 2. 启用开发人员模式(如果尚未启用)。 3. 按下Ctrl + Shift + I (对于macOS,使用Command + Shift + I) 来打开开发者工具,并切换到“网络”标签。通过移动界面来收集您的授权令牌;例如,在此示例中,我点击了Nitro选项卡然后返回以生成一个请求。 4. 创建一个新的文档并将其命名为任意名称,但确保该文件名以.token结尾。举个例子:my.token.txt, another.token.rtf 或 yes.another.token。 注意.gitignore 文件会指示Git(或Github桌面应用程序)避免推送与这些规则相匹配的任何文件和名字。 以上步骤可以帮助您完成不和谐刮板机目录配置中的相关设置工作。
  • Python批量PDF中
    优质
    这是一款高效的Python脚本工具,专门设计用于从大量PDF文档中快速、准确地批量提取文本内容。 本段落实例展示了如何使用Python批量提取PDF文件中的文本内容。首先需要通过命令`pip install pdfminer3k`安装处理PDF的扩展库。 ```python import os import sys import time pdfs = (pdfs for pdfs in os.listdir(.) if pdfs.endswith(.pdf)) for pdf1 in pdfs: pdf = pdf1.replace( , _).replace(-, _).replace(&, _) os.rename(pdf1, pdf) ```
  • Python批量PDF中
    优质
    这是一个专为需要从大量PDF文件中快速、高效地抽取纯文本内容而设计的Python脚本工具。它能够简化繁琐的手动操作流程,显著提升工作效率。 本段落详细介绍了用于批量提取PDF文件中文本的Python脚本,并具有参考价值,对相关主题感兴趣的读者可以参考此内容。
  • ChromePass:谷歌浏览
    优质
    ChromePass是一款方便用户快速提取和查看存储在谷歌浏览器中的密码信息的脚本工具。 ChromePass 是一个用于获取 Google Chrome 密码的脚本。要使用该工具的相关功能,请先安装 PyWin32 以调用 Windows 函数。请注意,此项目仅限于教育用途,并且作者与贡献者不对由此作品或其缺陷、错误或无法执行所导致的任何直接、间接、偶然或后果性损害承担责任。
  • Extractor:Patreon或OnlyFans和读数据
    优质
    Extractor是一款专为创作者设计的数据管理工具,能够轻松从Patreon或OnlyFans平台提取并分析订阅者信息,助力内容营销与用户互动优化。 提取器用于从Patreon或OnlyFans中获取数据的脚本包。 需求: 您需要与npm一起安装Node.js。 已在节点14上进行过测试。 设置步骤: # 安装node_modules cd extractor-server npm install 使用方法: 首先,启动服务器: cd extractor-server npm start # 或者: node .index.js 对于粉丝数据的下载: 要获取特定用户的数据,请访问该用户的OnlyFans页面。 打开浏览器中的开发者工具(Ctrl + Shift + I),然后选择控制台选项卡。 将服务器在控制台中输出的脚本复制到浏览器控制台,按Enter键执行。 停留在页面上直到脚本显示“Download finished xx (100%)”。
  • PythonWindows注册表USB设备信息.zip
    优质
    该压缩包包含一个Python脚本,专门设计用于从Windows系统的注册表中提取USB设备的相关信息。此工具对于系统管理员和安全研究人员来说非常有用,能够帮助他们分析USB设备的使用记录和行为模式。 usbdeviceforensics 是一个 Python 脚本,用于从 Windows 注册表中提取有关 USB 设备的大量信息。最初,它使用 Rob Stewart 的博客中的信息来检索操作系统特定的信息。现在,它可以一次性处理多个 NTUSER.dat 文件。
  • MATLABDFT-DFT: 离散傅立叶变换
    优质
    本资源提供基于MATLAB实现的离散傅里叶变换(DFT)源代码,适用于信号处理与分析中的频谱分析。 DFT的MATLAB源代码使用了离散傅立叶变换(dft.m)。输入文件为amplitudes.dat。输出结果保存在output.txt文件中,其中包含DFT频率值。
  • PDFtoTXT:PythonPDF(OCR)中
    优质
    本教程介绍如何使用Python编写代码,高效地从包含光学字符识别(OCR)的PDF文档中提取纯文本信息。适合需要处理大量PDF文件数据的用户学习和应用。 使用Python代码对PDF文件进行OCR识别并将文本导出到TXT文件的方法如下: 对于LocalOCR,在Ubuntu上安装所需的软件包: ``` apt-get install python-pyocr python-wand imagemagick libleptonica-dev tesseract-ocr-dev tesseract-ocr-it pip install -r requirements.txt ``` 对于CloudOCR,同样在Ubuntu上设置并安装相应的依赖项。
  • DFTMatlab-DFTfun_A_density_functional_theory_solver: 展示...
    优质
    DFTfun_A_density_functional_theory_solver是一个基于Matlab编写的程序包,提供了一套实现密度泛函理论计算的函数,适用于教学和科研展示。 DFT的MATLAB源代码DFTfun曾经在CodePlex上上传过,但由于Microsoft关闭了CodePlex,该代码已转移到其他地方。这是一个针对Hartree-Fock(HF)和密度泛函理论(仅X-alpha功能)学习者的示例性代码,在内部有详细的注释来帮助读者理解DFT和HF的基础算法。 此代码可以利用我自己的高斯基集积分函数计算包含第二行及第三行原子的分子。此外,它还提供了从计算结果中提取并可视化分子轨道、电子密度以及波函数等信息的功能。 对于对分子几何优化感兴趣的用户,在我的GitHub账户的Chem-kit存储库中实现了BFGS和GDIIS优化器(不打算实现分析能量梯度功能,因为如果不使用编译器级别的优化,其计算速度会太慢)。 在HF级别上进行的能量计算结果应与高斯软件完全一致。然而由于密度函数积分网格定义的不同(我的积分网格不会被截断且更粗糙),DFT的计算结果可能会稍有不同。