DROMPAplus：一个多样的ChIP-seq数据分析平台，涵盖质量检查、标准化、统计分析及可视化功能

简介：
DROMPAplus是一款全面的ChIP-seq数据分析软件平台，提供从数据质控到标准化处理、深入统计分析直至结果可视化的全流程服务。 DROMPAplus是基于C++开发的ChIP-seq数据分析工具，在原有DROMPA（DRaw and Observe Multiple Peak Alignments）的基础上进行了功能增强。它支持多种地图文件格式，包括SAM、BAM、CRAM以及Bowtie和TagAlign（.gz），并且能够读取分发格式如WIG（.gz）、bigWig和bedGraph。 DROMPAplus具备加标归一化及总读取归一化的功能，并能输出用于ChIP-seq分析的质量指标。它以常规PDF形式展示阅读分布，无需额外的程序支持，适合与生物信息学知识有限的合作方共享结果（例如通过云存储）。此外，该工具能够自动从单端读取中估计片段长度使用SSP方法。 DROMPAplus还允许在单一视图内比较两个样本间的读数富集情况，如H3K4me3和H3K27ac的共现现象。