
GTEx:eQTL检测基于GTEx数据
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简介:
本研究利用大规模基因表达数据库GTEx进行eQTL(表达定量性状位点)分析,探索遗传变异对人类组织中基因表达的影响,为理解复杂疾病中的遗传机制提供重要线索。
祖松鹏使用贝叶斯非参数方法从GTEx数据中检测顺式eQTL。程序包括:给定距离截断值后,获取每个基因周围的SNP(文件名:genelocsnp);运行R脚本以获得DECODE结果。
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