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DeepPlantPhenomics:基于深度学习的植物表型分析

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简介:
DeepPlantPhenomics是运用先进的深度学习技术进行高效、精准的植物表型数据分析的研究平台。通过智能化的数据处理和模型训练,该系统能够揭示作物生长发育中的细微特征及环境响应机制,助力农业研究与应用领域实现重大突破。 已淘汰的深度植物物候学不再积极维护。尽管如此,它仍可用于历史用途,并按原样提供,不包含计划中的更新或错误修复。 深度植物表象学(DPP)是一个利用深度学习技术进行植物表型分析的平台,专为植物科学家设计。 该平台集成了多种学习方法,这意味着它可以同时在CPU和GPU上运行并轻松地跨设备扩展。用户可以通过教程了解如何使用它,并查看示例以获取更多帮助。 关于维护::sheaf_of_rice: :Canada: 什么是深度学习? 从原则上讲,DPP为植物表型及相关应用提供了深度学习功能支持。深度学习是一种技术类别,其中包括多种类型的神经网络,在包括图像分类、目标检测和定位以及图像分割等基于图像的任务中处于领先地位。 如何使用该软件包? 此软件包提供以下两种服务: 1. 使用预训练的神经网络来开发有用的工具。 例如,可以调用tools.predict_rosette_leaf_count()。

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客服
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  • DeepPlantPhenomics
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    DeepPlantPhenomics是运用先进的深度学习技术进行高效、精准的植物表型数据分析的研究平台。通过智能化的数据处理和模型训练,该系统能够揭示作物生长发育中的细微特征及环境响应机制,助力农业研究与应用领域实现重大突破。 已淘汰的深度植物物候学不再积极维护。尽管如此,它仍可用于历史用途,并按原样提供,不包含计划中的更新或错误修复。 深度植物表象学(DPP)是一个利用深度学习技术进行植物表型分析的平台,专为植物科学家设计。 该平台集成了多种学习方法,这意味着它可以同时在CPU和GPU上运行并轻松地跨设备扩展。用户可以通过教程了解如何使用它,并查看示例以获取更多帮助。 关于维护::sheaf_of_rice: :Canada: 什么是深度学习? 从原则上讲,DPP为植物表型及相关应用提供了深度学习功能支持。深度学习是一种技术类别,其中包括多种类型的神经网络,在包括图像分类、目标检测和定位以及图像分割等基于图像的任务中处于领先地位。 如何使用该软件包? 此软件包提供以下两种服务: 1. 使用预训练的神经网络来开发有用的工具。 例如,可以调用tools.predict_rosette_leaf_count()。
  • MKMatlab代码-Deep-Plant-Phenotyping:
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    MKMatlab代码-Deep-Plant-Phenotyping 是一个用于进行深度学习驱动的植物表型分析的开源项目,利用MATLAB实现高效的数据处理与模型训练。 Matlab代码深层植物表型分析:DeepPod 该管道引入了深度CNN技术,将拟南芥植物部分分为4类,并使用基于补丁的分类方法来检测和计数该植物的果实。 参考文献: Hamidinekoo, A., Garzón-Martínez, G.A., Ghahremani, M., Corke, F.M.K., Zwiggelaar, R. & Doonan, J.H. (2020). DeepPod: a convolutional neural network based quantification of fruit number in Arabidopsis. *GigaScience*, 9(3), Oxford University Press. 文件和代码要求: 需要使用MATLAB 2017 v9.3或更高版本,以及CAFFE 1.0.0-rc3或更高版本。 引用方式: 如果您在学术环境中使用本段落,请参考以下文献格式进行引用: @article{hamidinekoo2020deeppod, title={DeepPod: a convolutional neural network based quantification of fruit number in Arabidopsis}, author={Hamidinekoo, Azam and Garzón-Martínez, Gina A. and Ghahremani, Morteza and Corke, Fiona MK and Zwiggelaar, Reyer and Doonan, John H} }
  • 在农业研究中应用综述.pptx
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    本PPT深入探讨了深度学习技术如何应用于农业植物表型研究中,总结并分析了当前的研究进展、挑战及未来发展方向,旨在促进智能农业的发展。 基于深度学习的农业植物表型研究综述 在当前农业领域内,利用深度学习技术进行农业植物表型的研究是一个热门方向。通过这项技术可以实现对农作物生长状态、作物产量预测以及植物分类等任务的自动化处理,从而提高生产效率和质量,并降低成本。 具体而言,深度学习的应用主要集中在以下三个方面:首先,在植物表型识别与分类方面,该方法能够帮助研究人员准确地辨识出不同种类的植物及其特征;其次,在监测农作物生长状态及预测其未来发展趋势上也展现出了巨大潜力。例如,通过无人机拍摄图像并结合深度学习算法进行分析,可以实时监控作物健康状况,并提前预警可能发生的病虫害问题;最后,利用这些技术还可以对未来的产量做出准确估计。 为了实现上述目标,研究人员需要收集大量高质量的数据用于训练模型和测试效果。常见的数据采集手段包括使用高分辨率相机、无人机以及各种传感器等设备来获取植物的详细信息。同时,在选择合适的深度学习算法方面也至关重要。目前常用的方法有卷积神经网络(CNN)、循环神经网络(RNN)及生成对抗网络(GAN)。每种方法都有其独特的优势,可以根据具体需求灵活选用。 尽管前景广阔,但将深度学习技术应用于农业植物表型研究仍面临一些挑战。例如,在数据采集阶段可能会遇到复杂多变的环境条件限制;而在算法模型的选择上也需要综合考虑计算资源和实际应用场景等因素的影响。因此,未来的研究工作还需不断探索和完善相关的技术和策略以克服这些障碍。 总之,随着深度学习技术的发展及其在农业领域的广泛应用,我们有理由相信这将为提高农业生产效率、优化资源配置等方面带来革命性的变化。
  • 微博情感
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    本研究提出了一种基于深度学习的情感分析模型,专门用于分析新浪微博上的用户评论和帖子,以识别公众情绪趋势。 一种用于微博情感分析的情感语义增强的深度学习模型在自然语言处理领域被提出和发展。
  • 类模.rar
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    本项目采用深度学习技术构建高效准确的分类模型,适用于图像、文本等多种数据类型。通过优化网络架构和训练策略,提升模型性能与泛化能力,为实际应用提供有力支持。 深度学习是人工智能领域的一项关键技术,它模仿人脑神经网络的工作方式,通过大量数据的自动特征提取实现预测或分类任务。“基于深度学习的分类”主题涵盖了如何使用深度学习算法处理各种类型的数据以高效完成分类工作。 在该压缩包文件中可以找到关于利用深度学习进行有效分类方法的详细文档。深度学习中的分类主要依赖于多种类型的深层神经网络(DNNs),例如卷积神经网络(CNN)用于图像识别,循环神经网络(RNN)及其变种如长短期记忆模型(LSTM)则适用于处理序列数据比如文本分析任务,还有全连接多层感知器(MLP)可以用来进行结构化数据分析。这些模型通过学习和理解复杂的数据模式,在面对未知数据时能表现出强大的泛化能力。 卷积神经网络在图像分类中的应用是深度学习领域的一个标志性成就。例如,AlexNet、VGG、ResNet以及Inception系列等模型都在ImageNet挑战中展示了CNN的强大潜力,它们可以通过一系列的卷积层和池化操作来捕捉到局部特征,并生成多层次的数据表示。 至于循环神经网络(RNN)及其变种如长短期记忆网络(LSTM),则在自然语言处理领域取得了显著成果。由于能处理长度不固定的序列数据,这些模型常用于文本生成、情感分析以及机器翻译等任务中。LSTM通过引入门机制解决了传统RNN中的梯度消失问题,使其更适合于学习长期依赖关系。 除了基础架构之外,还有许多先进的技术如迁移学习、数据增强、注意力机制和模型融合可以进一步提升深度学习分类器的性能。例如,在大型预训练模型上获取到的知识可以通过迁移学习应用至新任务中;通过引入随机变换(data augmentation)来增加训练集多样性以提高泛化能力等。 评估基于深度学习的分类效果通常会使用准确率、精确度、召回率和F1分数作为标准,同时AUC-ROC曲线以及混淆矩阵也是重要的评价工具。实践中还需要考虑模型效率及内存占用情况,并通过剪枝、量化或蒸馏技术进行优化调整。 文档“基于深度学习的分类.docx”中可能会详细介绍上述概念并提供具体的案例研究与实现步骤说明。无论你是初学者还是有经验的研究人员,这都将是一份非常有价值的参考资料,帮助你更好地理解和应用深度学习来进行有效的分类任务。
  • RootNav 2.0:应用
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    RootNav 2.0是一款先进的软件工具,专门用于自动化和优化植物根系及其他特征的表型分析。通过高效处理图像数据,它帮助研究人员深入理解植物生长与环境适应性之间的关系。 这是RootNav 2.0的代码存储库。在准备发布期间,自述文件和存储库中的代码会每天进行改进,请及时查看新功能及说明文档! **版本更新** - **2020年8月24日 - 版本2.1** - RootNav 2.0 的训练代码得到了显著的优化,使得在新的数据集上训练该工具变得更加容易。 - 新增的功能包括: - 简化的文件夹结构:现在只需传递包含根系统图像和RSML描述的`train` 和 `valid` 文件夹即可开始训练。 - 默认创建并缓存用于训练的遮罩,仅需提供 RSML 描述即可。 - 训练完成后,可以通过运行 `training.py publish` 函数来发布模型,在RootNav 2中使用。 **长期计划** - 其他预训练模型:如果您有特定的数据集需要使用此工具,请联系开发者团队寻求合作。 - 模型和训练代码的持续优化:我们将不断审查现有的架构及培训代码,以期提高性能。
  • FPGACNN网络移
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    本研究探讨了将卷积神经网络(CNN)模型移植到FPGA平台上的方法,以实现高效、低功耗的硬件加速。通过优化CNN架构与算法,充分发挥FPGA灵活性和可编程性优势,适用于图像识别等应用场景。 这篇论文和代码介绍了如何将基于FPGA的深度学习算法移植到CNN上。
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  • 品识别
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    本研究聚焦于开发先进的深度学习算法,旨在提升物品识别技术的准确性和效率。通过构建高效的神经网络模型,我们致力于解决复杂场景下的多类别物品精准识别问题,并探索其在智能安防、自动驾驶等领域的应用潜力。 近年来,在电子商务的快速扩张与人工智能技术的进步推动下,构建高效的商品识别系统已成为零售行业提升服务质量和运营效率的关键手段之一。商品识别在改善购物体验及优化库存管理方面扮演着重要角色,通过准确地对商品图像进行分类和识别,可以为零售商提供实时的库存信息,并帮助消费者更便捷地完成购买过程。 为了实现这一目标,本段落利用公开的数据集以及自行采集的商品图片创建了专门用于训练模型的商品识别数据集。在Tensorflow框架的支持下进行了数据增强处理后,提出了一种基于特征融合方式的MobileNetV2-DenseNet121双模型结构,并将其与传统的Vgg16、MobileNetV2和DenseNet121等其他几种主流网络架构进行对比实验。从四个评价指标来看,本段落所提出的方案在识别精度上有了显著的进步。 此外,为了提高系统的用户友好性,我们还基于PyQt5开发了一款商品识别系统界面。这款软件提供了直观的操作流程及结果展示功能,并支持实时的商品图像识别和可视化输出,极大地方便了零售人员以及消费者的使用体验。