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医学图像分割数据集:大脑肿瘤分割任务(包含2分割)【提供数据集、类别标签及可视化代码】

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简介:
该项目涵盖大脑肿瘤分割任务,具体包括双分割方法【包含数据集、类别标签以及用于可视化的代码】。 该数据集包含416x416分辨率下人脑MRI图像背景下的肿瘤(Tumor)分割实例。其主要任务是进行肿瘤分割,即分离出前景的肿瘤区域。标签图像采用1的阈值来标记肿瘤区域,0则代表背景区域。为了便于用户理解和观察,我们提供了相应的可视化代码辅助。该数据集的背景环境相对简单,而前景区域则具有丰富的细节并得到了精确的标注,这使得它非常适合用于图像分割相关研究和应用。可视化代码的效果可以参考: 该数据集被划分为两个主要部分:训练集和测试集。 训练集包含图像目录和模板目录,其中包含1632张图像以及与其对应的1632个mask图像。 此外,测试集也采用了相同的结构,即图像目录和模板目录,并包含了240张图像以及相应的240个mask图像。 此外,该资源集成了图像分割的可视化脚本,它能够随机选取一张图片进行展示,并同时呈现出该图片的原始图像、Ground Truth图像以及Ground Truth在原始图像蒙版上的显示效果,最后将这些图像保存至当前工作目录。

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客服
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  • (LiTS):切片(3)、
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    简介:LiTS数据集专为肝肿瘤分割设计,提供包含肝脏、肿瘤和背景三类别的CT切片图像及其对应标注,并附有可视化工具。 项目包含:肝肿瘤分割(LiTS)切片【包括切片后的数据集(3类别)、标签文件、可视化代码】 其中mask中的1表示肝脏区域、2表示肿瘤区域,0为背景部分,请参考classes.txt文件以获取更多细节。 该数据集由LITS的冠状面图像切分而成,共包含从131个病例中提取出的数据。为了便于分割操作,在进行切片时已去除ROI(感兴趣区域)不足5%的部分。mask灰度值为0、1和2的阈值图,图片与标签分别以jpeg和png格式存储,并提供了可视化代码用于观察mask。 数据集分为训练集和测试集: - 训练集包括images目录中的10937张图片及masks模板目录下的对应数量的mask图片; - 测试集中则有4686张图像及其对应的相同数量的标签。
  • :实例.zip
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    本数据集包含大量标注清晰的脑肿瘤图像,适用于深度学习模型进行实例分割研究和训练。 脑肿瘤图像数据集:实例分割.zip 是一个专门针对计算机视觉领域的实例分割任务的数据集。实例分割是识别并区分同一类别中的每个单独对象的技术,在医疗影像分析中用于定位病灶,如脑肿瘤。 该数据集中包含了一系列MRI或CT扫描图像,用于训练和测试机器学习模型以自动检测和分割脑肿瘤。预览内容需联系作者获取详细信息,这些原始数据集的使用可能受到隐私保护协议限制。 计算机视觉数据集强调了这个数据集的核心应用领域,即利用计算机处理和理解医疗影像中的视觉信息,并特别聚焦于实例分割任务。 压缩包内的文件名称列表及其作用如下: 1. README.txt:包含关于数据集的详细说明,包括来源、格式、使用方法及注意事项等。 2. ignore.txt:列出了一些不应被模型考虑或者在数据处理过程中应忽略的文件或目录。 3. data.yaml:配置文件,可能包含了关于数据集元信息的内容,如类别定义和预处理参数等。 4. train:包含用于训练模型的图像数据,并且这些图像已经标注了肿瘤的位置和形状。 5. valid:验证集,在模型训练过程中评估性能、防止过拟合及调整参数时使用。 6. test:测试集,在开发完成后用来最终评估模型在新数据上的泛化能力。 这个数据集提供了一个平台,用于训练和评估实例分割模型,特别是在脑肿瘤检测领域。开发者可以利用此数据集来训练深度学习模型(如Mask R-CNN)以实现对脑肿瘤的精确识别与分割,这对医疗诊断和治疗规划具有重要意义。同时,该数据集鼓励研究者在医疗图像分析领域的创新工作,并推动AI技术在医学健康行业的应用发展。
  • Medical_Image_Segmentation.rar__matlab_水平(部)工具
    优质
    该资源包提供了一个基于MATLAB的医学图像分割工具,利用水平集方法对脑部肿瘤进行精确分割。适用于科研和教学用途。 医学图像分割的Matlab程序针对脑部肿瘤图像使用水平集方法划分出肿瘤区域,并包含测试程序。
  • PyTorch 的语义加载模块
    优质
    本模块利用PyTorch框架,专注于医学图像中脑肿瘤的语义分割任务,提供高效的数据集加载与预处理功能。 在进行基于深度学习的脑肿瘤语义分割实验过程中,自定义数据加载模块显得尤为重要。使用PyTorch库中的`torch.utils.data.Dataset`类可以方便地创建自己的数据集类来处理大量医学图像。 具体来说,在这个项目中需要处理的是一个包含多个病人的大型脑肿瘤数据集,每个病人文件夹内含有原始CT或MRI扫描图及其对应的分割标注图。这些图像和标签通常用于指示特定区域如肿瘤的位置。为了加载这样的结构化数据集合,我们定义了一个名为`driveDateset`的类来继承自基础的数据集类。 在初始化方法中(即`__init__`),首先需要指定根目录路径,并遍历每个病人的文件夹以找到匹配的图像和标注图对。这里的关键是确保每张原始图片与其对应的分割图能够正确配对,通常通过检查它们的名字来实现这一目标——比如保证两个文件名在忽略后缀的情况下是一致的。 一旦找到了合适的图像-标签对,就会将这些信息存储在一个字典中,并将其添加到一个列表里。`__len__` 方法返回数据集中的样本总数,而 `__getitem__` 则用于根据索引获取具体的训练或测试样本——包括原始图、分割标注以及原图的尺寸等关键信息。 在实际操作时,可以通过PyTorch提供的DataLoader类来创建一个高效的数据加载器。该工具能够处理批量数据加载,并支持多线程和随机化等功能,这对于模型训练过程中的效率提升非常重要。 为了确保自定义的数据集模块工作正常,在开发阶段可以打印或展示一些样本图像及其对应的分割图来进行初步验证。这一步骤有助于确认整个数据预处理流程的准确性与完整性。 这种方法特别适用于那些需要从特定文件结构中加载医学图像的应用场景,通过调整匹配规则和处理方式,还可以灵活地应用于其他类型的标注格式或者不同的疾病类型上。因此,在面对大规模复杂的数据集时,优化数据加载过程对于提升训练效率以及减少内存占用具有重要意义。
  • MATLAB—高级3D示例...
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    本项目提供基于MATLAB的高级3D脑肿瘤图像分割代码,采用先进的图像处理技术,实现对复杂脑部结构中肿瘤区域的精准识别与分离。 此存储库使用基于产品示例的代码“使用深度学习进行3-D脑肿瘤分割”。该示例采用BRaTS数据集,这是一个包含四个通道或模态的大脑体积表示的数据集。这里的高级示例如何实现是与弗莱堡大学研究团队合作的结果,并且这些例子是根据具有七种模式头颈数据集的论文开发出来的。 这项工作之后是在NVIDIA GTC会议上的演讲,题目为“使用MATLAB从桌面到云端扩展您的深度学习研究:为头颈部肿瘤分割实施多个AI实验”,重点展示了如何利用该工具进行一些高级功能。本存储库将包含我提供的代码和一个博客以更详细地介绍相关工作。 在ParameterSweepingWithExpMgr中,我们修改了大脑分段的代码来展示如何使用ExperimentManagerApp来进行一次留一法分析以及贝叶斯优化(用于确定超参数)。
  • 火灾烟雾3
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    本数据集提供全面的火灾烟雾图像,涵盖三类标签(背景、烟雾、火焰),并附带可视化工具与代码,便于研究和分析。 项目包括:火灾烟雾分割(3分割),包含数据集、类别标签及可视化代码。 该数据集的图像分辨率为512*512像素,并专注于全场景下的烟雾分割任务,其中前景为烟雾等目标物,背景与前景区域区分明显且标注完整。为了方便观察和理解,提供了相关的可视化脚本。具体效果可参考相关文档或示例。 数据集分为训练集和测试集: - 训练集中包含315张图片及其对应的掩模图像。 - 测试集中则有35张图片及相应的掩膜图。 此外,项目还提供了一个用于图像分割的可视化脚本。该脚本能随机选取一张图片,并展示原始图像、真实标签(GT)以及在原图上应用了标签后的效果,最后将结果保存到当前目录中。
  • 玉米叶片病害
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    本数据集提供丰富的玉米叶片病害图像,并附带详细分类标签与可视化代码,旨在促进植物病理学研究和智能农业发展。 项目包含:玉米叶片病害分割【数据集+类别标签+可视化代码】 数据集为256*256分辨率下的玉米叶片病害分割。 分割前景包括叶片等部分,标签的mask图像采用RGB彩色表示,其中0代表背景。为了方便观察和理解,提供了一段可视化的代码。 该数据集中包含4个文件夹(健康、锈菌、斑点、枯萎病),共计3852张原始图片及其对应的mask标签。 此外,项目中还包含一个图像分割的可视化脚本,随机抽取一张图片,并展示其原始图、GT图像以及在原图上的蒙板效果,并将结果保存到当前目录下。
  • LITS肝-Codalab挑战赛
    优质
    简介:LITS肝肿瘤分割数据集挑战赛是在Codalab平台上举办的医学影像分析竞赛,旨在通过机器学习方法提高肝脏和肝内肿瘤自动分割的准确性。 如果无法访问Google,可以尝试其他替代方案。