MATLAB计算程序运行时间的代码-CIAtah: CIAtah（发音为cheetah，原名为calciumImaging...

简介：
CIAtah（读作“cheetah”）是一款专为钙成像数据分析设计的MATLAB工具箱。它提供了一系列用于计算程序运行时间的代码，帮助科研人员高效处理数据。 Matlab计算程序运行时间的代码是CIAtah（发音为猎豹；以前称为C铝一世maging一种nalysis，简称ciapkg）。这是一个用于分析单光子和双光子钙成像数据集的软件包。完整的文档可以在相应的资源中找到。 该软件包的功能包括： - 具有不同模块进行大规模批处理分析的图形用户界面（GUI）。 - CIAtah函数位于ciapkg/+ciapkg文件夹内，用于创建无GUI且支持命令行操作的分析管道。 - 包含所有主要的钙成像分析步骤：电影可视化、预处理（包括运动校正和时空下采样）、空间滤波及相对荧光计算等。 - 支持多种细胞提取方法如CELLMax、PCA-ICA以及CNMF-E等，并通过GUI手动对单元进行分类，同时支持自动细胞分类功能（即将推出！）及其他跨会话单元格对齐等功能。 - 提供用于测试的CIAtah示例一光子和二光子钙成像数据集。 - 动物位置跟踪（例如，在开放式检测中）。 此外，该软件包还支持大多数主要影像电影文件格式：HDF5、NWB、AVI、ISXD[Inscopix]及TIFF等。