肝癌分割：MICCAI 2019病理学大赛-PAIP2019
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简介：
肝癌分割：MICCAI 2019病理学大赛-PAIP2019是于2019年在MICCAI会议上举办的国际性竞赛，专注于利用AI技术提高肝脏肿瘤病理图像的自动分析与分割精度。
为了使用该代码，请确保安装以下软件包：
```shell
$ sudo apt-get install openslide-tools
$ sudo apt-get install libgeos-dev
$ pip install -r requirements.txt
```
预处理步骤如下：
1. 下载并解压缩幻灯片：下载所有50张压缩的幻灯片和两个csv文件，将它们放在`./data/SourceData`目录下。然后通过运行以下命令来解压这些文件：
```shell
$ cd preprocess
$ python unzip_slides.py
```
所有的幻灯片将会被解压到`./data/LiverImages`。
2. 检查分割蒙版：为了直观地了解肿瘤的外观，可以通过运行下面这段代码生成带有相应幻灯片图像与蒙版并排视图：
```shell
$ python check_mask.py
```
此外还提供了一种算法来定位载玻片中真实组织边界。
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