Advertisement

Spmv的MPI与MPI+CUDA并行实现方法

  •  5星
  •     浏览量: 0
  •     大小:None
  •      文件类型:None


简介:
本文探讨了稀疏矩阵向量乘法(SPMV)在高性能计算中的MPI和MPI+CUDA混合编程技术,并分析了它们的性能特征。 Spmv的串行和CPU、GPU并行性能测试demo展示了如何评估不同计算架构下的稀疏矩阵向量乘法操作效率。这种测试对于优化高性能计算应用至关重要,能够帮助开发者了解在不同的硬件平台上实现spmv算法的最佳实践方法。通过比较串行执行与多核CPU及图形处理器(GPU)的并行处理能力,可以揭示各种技术方案的优势和局限性,从而指导更高效的软件设计和技术选择。

全部评论 (0)

还没有任何评论哟~
客服
客服
  • SpmvMPIMPI+CUDA
    优质
    本文探讨了稀疏矩阵向量乘法(SPMV)在高性能计算中的MPI和MPI+CUDA混合编程技术,并分析了它们的性能特征。 Spmv的串行和CPU、GPU并行性能测试demo展示了如何评估不同计算架构下的稀疏矩阵向量乘法操作效率。这种测试对于优化高性能计算应用至关重要,能够帮助开发者了解在不同的硬件平台上实现spmv算法的最佳实践方法。通过比较串行执行与多核CPU及图形处理器(GPU)的并行处理能力,可以揭示各种技术方案的优势和局限性,从而指导更高效的软件设计和技术选择。
  • MPI中All_gather
    优质
    本文探讨了在消息传递接口(MPI)环境中实现All_gather通信原语的有效并行算法。通过优化数据分布和减少通信延迟,提高了大规模分布式计算中的数据汇聚效率。 全局收集(Allgather)群集通信函数MPI_Allgather() 中的 Allgather 操作相当于每个进程都作为 root 进程执行一次 Gather 调用,即每一个进程都会按照 Gather 的方式从所有进程(包括自己)收集数据。
  • MatVec-MPI:基于MPI稀疏矩阵向量
    优质
    简介:本文介绍了MatVec-MPI,一种高效的稀疏矩阵-向量乘法并行计算方法,利用MPI在多处理器环境中实现了显著加速,适用于大规模科学与工程计算。 在使用 MPI 并行化稀疏矩阵向量乘法的过程中,在第一步采用一维行分解读取文件并将数据分配给所有处理器,这需要 O(n) 时间复杂度然后是O(nnz),其中 n 代表行数而 nnz 表示非零元素的数量。矩阵 A 的数据以 CSR(Compressed Sparse Row)格式读入并存储,在这种格式下包括三个数组:行指针、列索引和值。 在第一步中,使用 MPI Bcast 将数据分发给 p 个处理器,并且每个进程准备通过 prepareRemoteVec 函数获取它需要的非本地向量元素。在此过程中,遍历矩阵的局部列索引来确定所需的远程向量条目是什么,在调整了本地向量的数据数组大小后(新的大小为 vSize + numRemoteVec),以在末尾保存来自其他处理器的附加远程向量条目。 最后一步是重新映射本地列索引数组,即之前指向全局向量数据索引的部分。通过遍历这个局部列索引数组,并将其调整到正确的指向下标位置来完成这一过程。
  • MPI矩阵乘 运算
    优质
    本项目探索了利用消息传递接口(MPI)进行大规模矩阵乘法计算的有效并行化策略,旨在优化高性能计算环境下的数据处理效率。 在Linux环境下成功实现了矩阵乘法的MPI并行运算,并使用mpicc进行编译生成可执行文件,通过mpirun命令运行程序。
  • 基于MPIKNN算1
    优质
    本研究探讨了在分布式内存计算环境中采用消息传递接口(MPI)技术对经典的K近邻(K-Nearest Neighbors, KNN)算法进行高效并行化的方法,旨在提高大规模数据集上的分类和回归任务的处理速度与效率。通过优化通信模式及负载均衡策略,我们提出了一种创新性方案以显著减少计算时间,同时保持模型精度不变。 # 基于MPI的并行KNN算法实现 ## 引言 在并行计算领域广泛应用的通信协议是MPI(Message Passing Interface),它为开发分布式内存并行程序提供了一套标准接口。本段落档将介绍如何利用C++和MPI来实现K-Nearest Neighbor (KNN) 算法的并行化版本。 ## 一、KNN算法 ### 1.1 距离度量 计算实例之间的相似性是KNN算法的核心,常用的距离度量包括曼哈顿距离和欧式距离: - **曼哈顿距离**:( d = sum_{i=1}^{n} |x_i - y_i| ) - **欧式距离**:( d = sqrt{sum_{i=1}^{n} (x_i - y_i)^2} ) ### 1.2 k值的选择 k值是KNN算法的重要参数,表示考虑的最近邻的数量。合适的k值可以通过交叉验证等方法选择,一般取较小的整数值。 ### 1.3 分类决策规则 KNN算法采用多数表决原则,即新实例的类别由其k个最近邻中出现最多的类别决定。 ## 二、MPI ### 2.1 MPI简介 提供一组可移植编程接口的是MPI,它支持进程间通信。这使得并行程序可以在不同计算节点上协同工作。通常包含以下关键函数: - **初始化**:`MPI_Init` - **结束**:`MPI_Finalize` - 获取当前进程ID的函数是 `MPI_Comm_rank` - `MPI_Comm_size` 函数获取的是进程组中的进程总数。 - 将消息从一个根进程发送到所有其他进程中去使用的函数为 `MPI_Bcast` - 分散数据,将一个大数组分发给各个进程的函数为 `MPI_Scatter` - 收集数据,并将各个进程的数据合并成一个大数组的是` MPI_Gather` ## 三、基于MPI的并行KNN算法 ### 3.1 算法流程 1. **读取训练和测试数据**。 2. **归一化处理特征值**,确保不同特征在同一尺度上。 3. KNN: - 使用`MPI_Scatter`将训练集分散到各进程。 - 每个进程计算其部分训练集与测试实例的距离。 - 利用 `MPI_Gather` 收集所有进程的计算结果。 - 在主进程中找到k个最近邻并进行分类决策。 4. **汇总预测结果**。 ### 3.2 函数及变量 - **全局函数和变量**:用于数据处理和通信,如读取数据、距离计算等。 - 关键变量包括进程ID(myid)和进程总数(numprocs)等。 ### 3.3 算法运行 - 设置参数,例如k值以及数据集路径。 - 注意事项是确保MPI环境正确配置,并避免由于不均匀的数据分割导致性能下降。 - 运行方法是在Windows环境下通过命令行指定MPI编译器和程序。 ## 四、实验 ### 4.1 数据集 描述了特征数量,类别及实例数等信息的参数。 ### 4.2 实验结果 - **算法准确率**:评估预测准确性。 - **运行时间**:对比并行与非并行版本的效率。
  • MPI生命游戏
    优质
    《MPI并行实现的生命游戏》一文探讨了如何利用消息传递接口(MPI)技术优化经典生命游戏的计算效率与可扩展性,详述了其在高性能计算环境中的应用。 在C语言基础上使用MPI进行并行实现的生命游戏,在运行环境中采用VS和MPICH2。
  • MPI遗传算
    优质
    并行MPI遗传算法是一种利用消息传递接口(MPI)实现多处理器环境下高效求解复杂优化问题的计算技术。该方法通过并行化处理提升传统遗传算法的执行效率与搜索能力,广泛应用于科学工程领域的模型优化和参数寻优中。 通过这份文档可以学习MPI的并行编程,并了解遗传算法的并行化方法。这是一份很好的学习资料。
  • MPI:利用MPI矩阵乘
    优质
    本简介介绍如何使用消息传递接口(MPI)进行高效的并行计算,具体通过实例演示了用MPI实现大规模矩阵乘法的方法和优化策略。 MPI矩阵乘法通过将矩阵分解为子部分并分配给各个从属进行计算来实现高效处理。主控负责拆分任务并将这些子任务发送到不同的进程,每个从属完成其被指派的矩阵乘法运算后,再把结果返回给主控。最后,主人汇总所有从属的结果以生成最终的矩阵。 为了运行MPI程序,首先需要安装必要的软件包: 对于Mac用户: - 使用Homebrew安装Open MPI: `brew install openmpi` - 安装Python库:`pip install mpi4py numpy` 然后可以通过以下命令来执行多进程版本的代码: ``` mpiexec -n python multi_process_multiplier.py ``` 例如,使用四个过程运行程序可以这样写: ``` mpiexec -n 4 python multi_process_multiplier.py ``` 如果只需要单个处理的话,则可以直接运行下面这个脚本: ``` python single_process_multiplier.py ```
  • 基于MPIPSRS排序算
    优质
    本研究提出了一种基于MPI的PSRS(Pair-Sample Recursive Sorting)并行排序算法实现方法,有效提高了大规模数据集上的排序性能。 使用MPI计算的完整的PSRS(并行排序)代码适用于并行计算课程实验。
  • Microsoft MPI:微软MPI
    优质
    Microsoft MPI是微软开发的一种消息传递接口(MPI)实现方式,主要用于高性能计算环境中,以支持大规模并行应用软件的开发与运行。 微软MPI(MS-MPI)是微软在Windows平台上开发并行应用程序的实现方式。 MS-MPI具有以下优点: - 容易移植现有代码。 - 基于Active Directory域服务的安全性。 - 在Windows操作系统上提供高性能表现。 - 跨不同类型的互连选项上的二进制兼容性。 MPI标准版本方面,MS-MPI符合MPI 2.2规范,但不包括C和Fortran之间属性的绑定错误。在实现功能时,MS-MPI仅实现了部分MPI 3.1的标准特性: - 包含无阻碍的集体操作, - RMA(远程内存访问), - MPI共享内存支持, - 新的数据类型 以及大量的匹配探针。 关于API的具体列表,请参考相关文档。 对于最新版本的MS-MPI下载,可以查找官方渠道获取。此外,也可以在其他平台上找到MS-MPI SDK,并从同一平台获得早期版本的MS-MPI。