HPV Chimera_Gb

简介：
HPV Chimera_Gb是一款基于人乳头瘤病毒（HPV）构建的基因工程载体，主要用于科研中表达外源基因或者研究病毒感染机制。 HPVChimera_Gb 脚本用于检查推定的人乳头瘤病毒（HPV）核苷酸序列是否存在嵌合体。运行脚本需要以下条件：a) 包含contigs序列的Fasta文件；b) HPV数据库；c) 核苷酸-核苷酸BLAST 2.10.1+。 您可以使用如下命令创建所需的所有文件（更新日期为2020年11月17日）： ``` makeblastdb -in HPV_COMPLETE_GENOMES.fasta -parse_seqids -blastdb_version 5 -title HPVcomplete -dbtype nucl ``` 脚本需要三个参数作为输入：包含contigs序列的Fasta文件（完整路径）、工作区文件夹（完整路径）和HPV数据库（即HPV_COMPLETE_GENOMES.fasta，提供其完整路径）。例如： ```./HPVChimera_Gb [fasta file path] [workspace directory path] [database path] ``` 注意：请根据实际情况替换上述示例中的方括号部分。