本PDF文档深入探讨了环状RNA(circRNA)研究领域的多种方法和策略，旨在为科研工作者提供全面、实用的技术指导。
环状RNA（circRNA）是近年来在RNA生物学领域备受关注的研究对象，这类分子是由内源性非编码RNA通过选择性剪切生成的闭合环形结构。由于其独特的闭环特性，circRNA表现出较高的稳定性和持久性，在生物体内不易被核酸外切酶降解。与线性RNA相比，它们缺乏poly A尾巴，并且不参与蛋白质翻译过程；然而，circRNA在基因表达调控中扮演着重要角色。
circRNA的生成主要依赖于backsplicing机制，包括nlariat驱动环化、内含子配对驱动环化、ciRNAs形成模式以及通过RBPs和可变剪切实现的不同形式的环状结构。这些过程赋予了circRNA在转录过程中多样化产生的能力。
从分子特性来看，circRNA显示出组织特异性表达、高丰度及稳定性等特点。它们在不同组织或生命阶段中的表达量有所差异，并且某些情况下其表达水平甚至超过对应的线性mRNA。此外，大多数circRNA由外显子组成并含有miRNA结合位点（MREs），能够与miRNAs相互作用形成竞争内源RNA（ceRNA）网络，从而影响miRNAs的功能活性。
在生物学功能方面，circRNA最显著的作用是作为miRNA的海绵吸附体。例如，ciRS-7/CDR1as和Sry等特定类型的circRNA可以结合并抑制miRNAs的活性，进而调节靶基因表达水平的变化。除此之外，它们还能够通过与特异性RBPs相互作用或调控基因转录等方式影响基因表达。
由于其多样性和高度保守性，在各种生物体中广泛存在，使得circRNA具备成为潜在生物标志物和治疗目标的巨大潜力。随着高通量测序技术及计算分析方法的进步，越来越多的新型circRNAs被发现并研究，为探索它们在不同生理和病理条件下的功能提供了丰富的资源。特别是在癌症、神经退行性疾病等领域中已经显示出其作为理想生物标志物的应用前景。
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