MRlap: 使用R程序包进行含潜在重叠样本的两样本孟德尔随机化分析

简介：
MRlap是一款基于R语言开发的程序包，专门用于执行包含潜在重叠样本的两样本孟德尔随机化分析，帮助研究人员评估因果关系。 MRlap 是一个正在积极开发中的R程序包，它仅使用GWAS摘要统计信息即可执行两样本孟德尔随机化（MR）分析，并考虑到暴露和结果样本之间的可能重叠。由于这种重叠可能导致偏见，我们的方法利用跨特征LD评分回归（LDSC）来近似样品的重叠情况，并同时解决所有这些偏差并进行校正。 使用该软件包估算出经过校正的效果可以作为敏感性分析的一部分：如果校正后的效果与未校正的结果没有显著差异，则可以安全地采用IVW-MR估计值。然而，当存在显着差异时，应优先选择校正值以减少偏差，并且这种做法不依赖于样本重叠的程度。 该软件包建立在两个R程序包的基础上：一个用于执行跨特征LDSC分析，另一个则用于进行反方差加权（IVW-）MR分析以及仪器修剪。目前仅提供了一个功能——`MRlap()`，它能够执行LDSC和IVW-MR分析，并给出校正后的因果效应估计值。