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MATLAB独立性检验代码及HSIC:基于希尔伯特-施密特独立性的Python实现

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简介:
本项目提供了一套MATLAB和Python工具,用于执行独立性检验。其中MATLAB部分采用传统方法,而Python模块则实现了基于希尔伯特-施密特独立性的HSIC算法,适用于复杂数据集的分析与研究。 希尔伯特-施密特独立性标准(HSIC)的原始MATLAB代码已被转换为Python版本。在Windows上使用Python 2.7与Anaconda 4.3.0进行64位测试。 ### 使用方法 导入所需的模块: ```python from HSIC import hsic_gam ``` 应用HSIC: ```python testStat, thresh = hsic_gam(x, y, alph=0.05) ``` ### 函数描述 #### 输入参数 - `hsic_gam()`函数的输入参数如下: - `X`:第一个变量的数据。(n,dim_x) numpy数组。 - `Y`:第二个变量的数据。(n,dim_y) numpy数组。 - `alpha`:测试水平。 #### 输出结果 - `testStat`: 独立性检验统计量。 - `thresh`: 在给定的alpha下,拒绝独立性的阈值。 ### 结果解释 如果`testStat < thresh`,则x和y不具有统计上的独立关系;否则它们是独立的。 ### 作者 Shoubo Hu 如有疑问或需要进一步的帮助,请直接联系作者。

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客服
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  • MATLABHSIC-Python
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    本项目提供了一套MATLAB和Python工具,用于执行独立性检验。其中MATLAB部分采用传统方法,而Python模块则实现了基于希尔伯特-施密特独立性的HSIC算法,适用于复杂数据集的分析与研究。 希尔伯特-施密特独立性标准(HSIC)的原始MATLAB代码已被转换为Python版本。在Windows上使用Python 2.7与Anaconda 4.3.0进行64位测试。 ### 使用方法 导入所需的模块: ```python from HSIC import hsic_gam ``` 应用HSIC: ```python testStat, thresh = hsic_gam(x, y, alph=0.05) ``` ### 函数描述 #### 输入参数 - `hsic_gam()`函数的输入参数如下: - `X`:第一个变量的数据。(n,dim_x) numpy数组。 - `Y`:第二个变量的数据。(n,dim_y) numpy数组。 - `alpha`:测试水平。 #### 输出结果 - `testStat`: 独立性检验统计量。 - `thresh`: 在给定的alpha下,拒绝独立性的阈值。 ### 结果解释 如果`testStat < thresh`,则x和y不具有统计上的独立关系;否则它们是独立的。 ### 作者 Shoubo Hu 如有疑问或需要进一步的帮助,请直接联系作者。
  • MATLAB-JMI分析
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    本项目提供了一套基于MATLAB实现的独立性检验工具,特别聚焦于计算变量间的偏最小互信息(JMI),适用于复杂数据集的相关性分析。 该文件夹包含了我们所有仿真的代码。我们的模拟使用了以下R包:“FOREACH”,“doSNOW”,“FNN”,“HHG”,“minerva”,“energy”,“copula”,“ks”以及“mJMI”。提供了一个名为installpackages.r的脚本来安装这些包。“mJMI_0.1.0.zip”是我们的R包,它实现了相互信息估计和p值计算来进行独立性测试。可以直接在R环境下安装此包。 文件夹内还包含一个子文件夹“估计效率”,用于针对不同方法、模型以及样本数量来计算MSE的代码。“mJMI”的相关代码位于该子目录下的“R”子目录中,而其他方法如“经验规则KDE”,“lscvKDE”和“插入KDE”的代码也分别放置在不同的语言编写的不同子文件夹下。此外,“Python”子目录包含“混合KSG”和“基于copula的KSG”的相关代码。“Matlab”子目录则存放了名为“MirroredKDE”的方法。 另一个重要的子文件夹是“测试能力”,该文件夹内包含了用于计算不同模型、噪声水平以及多种独立性统计效能所需的代码。
  • R语言中
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    本文介绍如何在R语言中执行独立性检验,包括卡方检验的应用及其代码实现,帮助数据分析者验证变量间的关联性。 R语言提供了多种检验类别型变量独立性的方法,其中包括卡方独立性检验、Fisher精确检验以及Cochran-Mantel-Haenszel检验。 1. 卡方检验可以通过`chisq.test()`函数对二维表中的行变量和列变量进行独立性检验。具体数学原理不在这里讨论,但可以理解为原假设是两者之间没有关联。当P-值较小(例如p = 0.05),表示两个变量之间的无关可能性小于5%,即有95%的概率认为它们存在某种关系,从而拒绝原假设;反之如果P-值较大,则接受原假设,说明两变量间不存在显著联系。 此外,可以使用`library(vcd)`加载相关库,并通过`xtabs()`函数创建数据表以进行进一步分析。
  • 黄变换MATLAB使用说明_黄变换_matlab
    优质
    本资源提供详细的希尔伯特黄变换(HHT)MATLAB实现代码和操作指南,帮助用户掌握信号处理中的经验模态分解(EMD)与 Hilbert 谱分析。 提供希尔伯特黄变换的经典MATLAB代码及使用说明,适合初学者学习和应用。
  • -黄(Hilbert-Huang)变换,即使用
    优质
    希尔伯特-黄变换是由黄锷提出的信号处理方法,结合了经验模态分解和希尔伯特谱分析,适用于非线性及非稳态数据。 EMD算法和Hilbert-Huang算法可以直接运行使用。
  • Matlab变换-Hilbert:多种离散变换方法
    优质
    本项目提供多种离散希尔伯特变换的Matlab实现方案,适用于信号处理与分析领域中相位谱操作和解析信号生成。 希尔伯特变换是包含多种离散实现方式的一个项目(包括近似方法)。该项目目前还在开发阶段,并不建议使用。 已实施的方法有基于离散傅立叶变换的亨里奇·马普尔算法,该算法在SciPy和MATLAB中均有应用。此外还有基于Haar小波的方法,类似于周阳等人提出的技术。这些实现参考了P. 亨里奇《应用与计算复分析》第三卷(Wiley-Interscience,1986)以及L. Marple的论文“通过FFT计算离散时间‘解析’信号”,发表于IEEE Transactions on Signal Processing,47(9),2600–2603 (1999)。还有C.Zhou、L.Yang、Y.Liu和Z.Yang在《Journal of Computational and Applied Mathematics》上发表的文章“一种使用Haar多分辨率近似计算希尔伯特变换的新方法”,223(2),585–597 (2009)。 未来计划实现的方法包括B样条(由Bilato提出)、Haar多分辨率(Zhou-Yang)以及Sinc/Whittaker小波等。
  • Excel数据分析-卡方(上)
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    本教程讲解如何使用Excel进行卡方独立性检验的基础知识和操作步骤,帮助理解变量间的关联性分析。 Excel统计分析-卡方独立性检验(上)讲述了如何使用Excel进行卡方独立性检验的基本步骤和方法。通过本教程,读者可以学会在数据分析中应用这一重要工具来评估两个分类变量之间的关系是否具有统计学意义。文中详细介绍了数据准备、假设设定以及利用Excel内置函数执行计算的具体操作流程,并提供了实例演示以加深理解。
  • MATLAB-CausalExplorer_1.5:用因果发与变量选择MATLAB算法库
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    CausalExplorer_1.5是一款专为因果关系分析设计的MATLAB工具包,支持独立性检验、因果结构学习及变量筛选等功能,助力科研人员深入探究数据背后的因果机制。 CausalExplorer_1.5版本(2019年11月)更新内容包括重建所有P代码文件,并与Matlab R2017b(版本9.3)兼容。 在之前的1.4版中,发行时包含适用于Matlab R14的平台独立版本用户手册。新添加了MMPC、PMMPC、MMMB、HITON_PC和HITON_MB等算法,并改进了TPDA与MMHC的实现方式。此外,还增加了更多执行示例以及离散化实用工具。
  • C++变换.zip
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    本资源提供了使用C++编写的希尔伯特变换算法的完整实现代码。该代码可用于信号处理和分析中,帮助用户提取瞬时频率等特征信息。 C++实现希尔伯特变换的代码可以包含在名为c++实现希尔伯特变换.zip的文件中。此表述重复了多次,实际上只需提到一次即可。 更简洁地表达就是: C++ 实现的希尔伯特变换可以在一个名为“c++实现希尔伯特变换.zip”的文件里找到。
  • 变换
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    简介:本文档提供了实现希尔伯特变换的代码示例,适用于信号处理和分析领域,帮助读者理解并应用该数学工具。 希尔伯特变换的C++代码实现可以轻松移植。