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Abide-FMRi: Brainhack School 2020团队的仓库,利用fMRI及ABIDE数据训练机器学习模型

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简介:
Abide-FMRi是Brainhack School 2020期间由一支团队创建的开源项目。该项目致力于使用功能磁共振成像(fMRI)和来自ABIDE的数据集来开发并优化神经疾病预测的机器学习算法。 使用fMRI数据预测各种机器学习模型和交叉验证方法的自闭症诊断贡献者:Emily Chen,Andréanne Proulx,Mikkel Schöttner 该存储库包含在2020年BrainHack学校期间所做的贡献。该项目使用ABIDE数据集中的静止状态fMRI数据来训练机器学习模型,并获得了Creative Commons Zero v1.0 Universal许可。 如果您有任何疑问或意见,请随时与我们联系。 项目定义个人背景 艾米丽 你好!我是麦吉尔大学(即将入学)的四年级本科生,主修计算机科学和城市健康地理,辅修认知科学。我在Zatorre实验室工作。

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  • Abide-FMRi: Brainhack School 2020fMRIABIDE
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    Abide-FMRi是Brainhack School 2020期间由一支团队创建的开源项目。该项目致力于使用功能磁共振成像(fMRI)和来自ABIDE的数据集来开发并优化神经疾病预测的机器学习算法。 使用fMRI数据预测各种机器学习模型和交叉验证方法的自闭症诊断贡献者:Emily Chen,Andréanne Proulx,Mikkel Schöttner 该存储库包含在2020年BrainHack学校期间所做的贡献。该项目使用ABIDE数据集中的静止状态fMRI数据来训练机器学习模型,并获得了Creative Commons Zero v1.0 Universal许可。 如果您有任何疑问或意见,请随时与我们联系。 项目定义个人背景 艾米丽 你好!我是麦吉尔大学(即将入学)的四年级本科生,主修计算机科学和城市健康地理,辅修认知科学。我在Zatorre实验室工作。
  • 多视图异常检测和ABIDE方法诊断ASD患者.zip
    优质
    本研究采用机器学习技术结合多视图异常检测算法,通过分析ABIDE数据集,旨在提高自闭症谱系障碍(ASD)患者的诊断准确性。 该项目专注于使用机器学习技术,特别是异常检测方法来识别自闭症谱系障碍(ASD)患者。在当前的医疗领域内,数据驱动诊断技术正在快速发展,并且这些技术可以帮助医生更准确地识别疾病并提高治疗效率。在这个项目中,研究者利用ABIDE(Autism Brain Imaging Data Exchange)数据库进行研究,这是一个广泛使用的公开资源库,包含大量ASD患者的神经影像学数据和对照组的数据。 在该项目中涉及的两个重要文件是training.py和training_multiview.py。前者可能用于训练单视图模型,后者则很可能处理多视图学习任务——即从不同角度或特征维度分析数据以捕捉更全面的信息,并提高诊断性能。 models.py文件定义了多种机器学习模型,包括基础异常检测算法如孤立森林(Isolation Forest)和一类支持向量机(One-Class SVM),以及深度学习结构如自动编码器。这些模型的选择对于识别出与正常模式显著不同的特征至关重要。 construct_graph.py可能用于构建神经网络架构,在使用深度学习时需要定义卷积层、池化层等,并将它们连接起来形成完整的诊断系统。 layers.py文件中很可能包含为适应特定异常检测任务而设计的自定义神经网络层,这可以包括特殊的激活函数或损失函数的设计。 util.py包含了数据预处理、模型评估和结果可视化等功能。这些工具对于确保数据质量的一致性以及帮助理解和改进模型性能至关重要。 multiview_model.py文件可能是多视图学习的核心实现部分,它整合了从不同来源提取的数据,并通过联合训练或集成学习来提高诊断的准确性。 README.md提供了项目的概述、使用指南和依赖库信息。该项目展示了如何结合多视图学习与异常检测技术利用ABIDE数据库进行ASD患者的早期识别工作,旨在改善患者的生活质量并推动相关领域科研的进步。
  • ABIDE-预处理与建
    优质
    ABIDE-预处理与建模专注于利用ABIDE数据集进行神经影像学研究的前期准备及模型构建过程,旨在促进自闭症谱系障碍相关的数据分析和科学理解。 编写所有脚本以预处理ABIDE数据集并进行建模。
  • 图异常检测等方法ABIDE集对ASD患者进行诊断研究.zip
    优质
    本研究运用了图异常检测等机器学习技术,并结合ABIDE数据集,旨在提升自闭症谱系障碍(ASD)患者的诊断准确性。文档内含详细的分析与实验结果。 人工智能项目实践之机器学习
  • 北京师范大fMRI资料.pdf
    优质
    这份PDF文档由北京师范大学提供,包含了有关功能磁共振成像(fMRI)的技术培训资料,适合科研人员和学生学习使用。 北师大的fMRI培训材料提供了关于功能性磁共振成像技术的详细指导和学习资源。这份文档旨在帮助学生和研究人员更好地理解和应用fMRI技术,在神经科学领域开展深入研究。
  • MLPClassifier__源码_
    优质
    本项目基于Python的scikit-learn库,实现多类概率分类(MLPClassifier)模型的训练与应用。通过详细解读源代码,帮助理解并优化神经网络在复杂数据集上的分类性能。 适合初学者学习的机器模型相关知识涉及一些常用的Python库文件,通过这些内容可以深入理解相关的概念和技术。
  • 包含与深度清洗转换.zip
    优质
    本资料包涵盖使用机器学习和深度学习技术进行数据预处理的方法,包括清洗和转换步骤,以优化模型训练效果。 数据清洗与转换涉及使用多种机器学习和深度学习模型进行训练,包括LSTM、GRU、Attention机制、Transformer架构、BERT模型以及Stacking技术。此外,还应用了传统的随机森林(RF)、XGBoost、GBDT、AdaBoost和支持向量机(SVM)及朴素贝叶斯(NB)等算法。
  • SPM-fMRI处理综述.pdf
    优质
    本文为一篇关于SPM-fMRI数据分析方法的综述文章,系统介绍了功能磁共振成像的数据预处理、统计分析及结果解释等方面的最新进展与技术要点。 SPM-fMRI数据分析总述介绍了功能性磁共振成像(fMRI)数据处理的基本流程以及如何使用统计参数映射(SPM)软件进行分析。这一过程包括预处理、单被试分析及群体水平的第二级分析等步骤,旨在探索大脑在执行特定任务时的功能活动模式和神经网络连接。
  • 深度发动
    优质
    该数据集专为深度学习模型在复杂工业环境中优化性能而设计,包含大量高精度发动机运行参数与状态记录,助力研究人员及工程师精准建模、故障预测和效能提升。 发动机数据集用于深度学习模型训练。
  • LinearRegression.py文件夹中包含
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    文件名:Linear Regression.zip