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Neuroglancer:基于WebGL的三维体数据浏览器

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简介:
Neuroglancer是一款利用WebGL技术打造的三维体数据分析工具,它能够高效地在网页上浏览和分析复杂的神经科学图像数据。 Neuroglancer 是一个基于 WebGL 的体积数据查看器。它能够显示任意(非轴对齐)横截面视图,并支持展示3-D网格和线段模型(骨架)。这并不是 Google 的官方产品。 现场演示托管在某个服务器上,可以使用提供的链接打开预加载了示例数据集的查看器。 四窗格视图由三个正交横截面视图以及一个独立方向的 3D 视图组成。该视图会显示所选对象的三维模型(如果可用)。所有四个视图都保持相同的中心位置,也可以调整三个横截面视图的方向,尽管它们彼此之间的相对方向是固定的。(尝试按住 shift 键并用鼠标左键拖动或使用箭头键进行操作。) 提供的示例数据集包括: - 8x8x8 立方纳米分辨率的数据集 - 4x4x40 立方纳米分辨率的数据集 这些数据来自 Kasthuri等人于2014年的研究工作。

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客服
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  • NeuroglancerWebGL
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    Neuroglancer是一款利用WebGL技术打造的三维体数据分析工具,它能够高效地在网页上浏览和分析复杂的神经科学图像数据。 Neuroglancer 是一个基于 WebGL 的体积数据查看器。它能够显示任意(非轴对齐)横截面视图,并支持展示3-D网格和线段模型(骨架)。这并不是 Google 的官方产品。 现场演示托管在某个服务器上,可以使用提供的链接打开预加载了示例数据集的查看器。 四窗格视图由三个正交横截面视图以及一个独立方向的 3D 视图组成。该视图会显示所选对象的三维模型(如果可用)。所有四个视图都保持相同的中心位置,也可以调整三个横截面视图的方向,尽管它们彼此之间的相对方向是固定的。(尝试按住 shift 键并用鼠标左键拖动或使用箭头键进行操作。) 提供的示例数据集包括: - 8x8x8 立方纳米分辨率的数据集 - 4x4x40 立方纳米分辨率的数据集 这些数据来自 Kasthuri等人于2014年的研究工作。
  • Three.js图形编辑
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    这是一款利用Three.js技术开发的浏览器端三维图形编辑工具,用户无需安装额外软件即可在网页上创建和编辑复杂精美的3D模型。 我开发了一款基于Three.js的三维图编辑器,适用于Chrome、Firefox及360浏览器。该工具具备以下功能,并且仍在持续优化和完善中: 1. 支持添加立方体、圆柱体、球体、半球体和圆锥体等多种几何形状。 2. 提供虚实线选项来展示几何体的边框效果。 3. 用户可以通过鼠标点击选中对象,然后使用鼠标或键盘在场景内进行平移操作。 4. 允许用户从正视图、俯视图和侧视图等不同视角查看整个场景。 5. 支持通过鼠标的旋转来调整场景的观察角度。 6. 提供修改几何体材质的功能,包括颜色和透明度的设置。 7. 实现环境光源与点光源效果,并允许用户调节点光源强度及方向等相关属性。 8. 具备缩放功能,支持整体缩放以及沿X、Y、Z轴进行单独尺寸调整的能力。 9. 支持将多个几何体合并成一个单元,以便于统一管理其移动和大小变化等操作。
  • Waymo Open Dataset Viewer:WebGL点云
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    Waymo Open Dataset Viewer是一款利用WebGL技术开发的在线点云数据浏览工具,旨在为开发者和研究人员提供便捷高效的三维激光雷达数据可视化服务。 Waymo提供了一个数据集查看器的WebGL浏览器插件,该插件与集成的Python服务器在浏览器内无缝运行,此Python服务器负责处理并提供数据集片段。使用前,请确保已从官方渠道获取所需的数据集部分,并将其保存在一个包含`.tfrecord`文件的新目录中。 安装TensorFlow(推荐版本2.0.0)是必要的步骤之一;建议使用带有GPU支持的TensorFlow以加速读取过程。接下来,需要通过执行以下命令来安装服务器和前端所需的依赖项: ``` pip install -r requirements.txt yarn install ``` 启动websocket服务用于处理并提供指定目录内的段文件,请运行: ```shell python websocket.py --segments-dir path/to/segments ``` 完成上述步骤后,构建前端项目。这可以通过执行以下命令来实现: ```shell yarn build ``` 最后,在浏览器中打开`index.html`以开始查看数据集片段。
  • NGL: WebGL蛋白
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    NGL是一款基于WebGL技术的蛋白质结构可视化工具,它能够高效地渲染复杂的生物分子模型,并提供丰富的交互功能以支持科学研究与教育。 NGL Viewer 是一款用于分子可视化的Web应用程序,能够展示蛋白质、DNA/RNA等多种形式的分子结构。它支持以下功能: - 分子结构显示(mmCIF, PDB, PQR, GRO, SDF, MOL2, MMTF) - 密度体积数据查看(MRC/MAP/CCP4,DX/DXBIN,CUBE,BRIX/DSN6,XPLOR/CNS) - 用户交互功能(鼠标选择、语言切换、动画播放和图像导出) - 坐标轨迹显示(DCD 和 PSF, NCTRAJ 和 PRMTOP, TRR/XTC 和 TOP,远程访问MDSrv) 此外,NGL Viewer 可以作为独立文件或通过API嵌入到其他应用中使用。由于它是一组静态Web文件,因此无需复杂的安装过程。在开发过程中,在本地提供服务会非常有用。 当将NGL Viewer 作为一个库来使用时,请包含自包含的build dist/ ngl.js 文件即可。
  • 获取WebGL上下文:webgl-context
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    本教程讲解如何在网页应用中通过JavaScript访问和配置WebGL渲染环境,详细介绍获取并设置WebGL上下文的方法。 获取一个 WebGLRenderingContext,如果它不存在则返回 null。 ```javascript var gl = require(webgl-context)(); if (gl) { document.body.appendChild(gl.canvas); do something... } ``` 或者,带有选项: ```javascript var gl = require(webgl-context)({ canvas: canvas, // 使用的canvas DOM元素 width: 400, }); ```
  • MATLAB开发-视图(Viewer3D)
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    本软件为一款基于MATLAB开发的三维视图浏览工具Viewer3D,能够实现复杂数据集的高效可视化和互动探索。 在MATLAB开发中实现Viewer3D功能,包括最大强度投影(MIP)、颜色调整、切片视图以及使用shearwarp技术的体积渲染。此外还提供了一个交互式的3D视角与测量图形用户界面(GUI)。
  • WebGL地球模型
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    本项目采用WebGL技术构建了一个交互式的三维地球模型,用户可进行全方位视角切换和地理信息探索。 基于WebGL的JavaScript实现的三维地图效果不错,可以参考一下。该资源当前未能找到源码。不喜勿下。
  • WebSQLite(Sqliteweb).zip
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    本资源提供了一个基于Web的SQLite数据库管理工具SqliteWeb的压缩包。它允许用户通过网页直接访问、管理和操作 SQLite 数据库文件,无需安装额外软件,支持数据查看、编辑和备份等功能。 sqliteweb 是一个基于Web的SQLite数据库浏览器。它受到 pgweb 和 SQLite 浏览器的影响和启发。sqliteweb 旨在为用户提供一种便捷的方式来管理和查询SQLite数据库,通过网页界面实现对SQLite数据库的操作。它是用特定技术编写的(原文中未提及具体使用的技术)。
  • OpenGL简易场景功能实现
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    本项目利用OpenGL技术构建了一个简易的三维场景浏览器,实现了基本的图形渲染和交互操作,为用户提供了直观、高效的三维空间探索体验。 OpenGL是一种强大的图形编程库,在游戏开发、科学可视化及工程设计等领域得到广泛应用。本项目探讨了如何在Microsoft Visual C++(VC)环境中使用OpenGL创建一个简单的三维场景漫游功能,该场景包含平地、立方体和四面体,并允许用户通过键盘操作来改变视角并旋转物体。 首先需要了解的是,OpenGL基于向量及矩阵运算提供了一系列用于绘制与操控3D几何形状的函数。在VC中,我们通常会利用OpenGL的头文件和库文件创建图形上下文、窗口以及初始化OpenGL状态。 设置视口(viewport)和投影矩阵是构建三维场景的第一步。视口决定了渲染区域大小,而投影矩阵则影响物体如何映射到2D屏幕上,如正交或透视方式。在本案例中可能使用了glViewport()函数设定视口,并通过glOrtho()或gluPerspective()设置投影。 接下来是定义三维模型部分,包括地面、立方体和四面体。通常情况下,地面被视为无限大的平面;而立方体与四面体作为基本几何形状,则可通过顶点数组表示。使用glBegin()和glEnd()之间的代码段来逐个指定每个顶点的坐标以绘制这些形状。 为了实现漫游功能,需要监听键盘事件。VC通过消息循环及Windows消息处理函数支持键盘输入操作。当用户按下特定键时,可更新相机的位置与方向,这通常涉及修改视图矩阵:前后移动改变z坐标的值;左右移动调整x坐标;上下移动则影响y坐标。 对于立方体和四面体的旋转,则可以使用glRotatef()函数,并传入旋转角度及轴向坐标。根据用户按键的不同,可以在X、Y或Z轴上独立地对这些物体进行旋转操作。 此外,颜色与光照也是提升场景视觉效果的关键因素。通过调用glColor3f()设置物体的颜色;而利用glLightfv()和glLightModel*()系列函数则能调整光源参数及全局光照模型以增强真实感体验。 整个渲染过程在主循环中执行:包括清除屏幕(使用glClear())与深度缓冲、绘制几何形状(如通过调用glDrawElements()或glDrawArrays()),以及交换双缓存来呈现下一帧图像(利用glSwapBuffers())。 综上所述,“基于OpenGL的简单三维场景漫游”项目涵盖了视口和投影设置、几何体绘制、键盘交互、物体旋转及基本光照效果等核心概念。通过此项目的学习,开发者能够在VC环境下构建出一个互动式的3D环境,并为后续深入学习OpenGL编程奠定坚实基础。
  • JSPWeb可(含源码和文档).zip
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    本资源提供一个基于JSP技术开发的Web应用——可维护数据库浏览器。该应用旨在方便用户管理和浏览各类数据库内容,并附带完整源代码及详细文档,便于学习与二次开发。 **标题解析:** jsp基于Web的可维护的数据库浏览器(源代码+lw) 这个标题揭示了我们要讨论的核心内容。jsp是JavaServer Pages的缩写,是一种动态网页开发技术,由Sun Microsystems(现已被Oracle收购)开发。这个项目显然是一个使用JSP技术构建的Web应用,其主要功能是提供一个数据库浏览器。基于Web意味着它可以通过互联网进行访问,用户无需在本地安装任何特定软件。可维护表明设计时考虑到了系统的长期管理和更新,这通常包括良好的代码结构、文档记录和模块化设计。源代码的提供意味着我们可以查看、学习甚至修改程序的内部工作原理。“lw”可能代表轻量级(lightweight),暗示这个应用程序可能设计得相对简洁,易于理解和部署。 **描述解析:** 描述中的信息与标题相吻合,再次强调这是一个基于JSP的Web应用,具有数据库浏览功能,并且附带源代码,适合学习和定制。没有进一步的具体细节,但我们可以推测这个应用可能包含用户友好的界面,允许用户查询、添加、编辑和删除数据库中的记录。 **标签解析:** 由于没有提供标签信息,我们无法得到额外的分类信息。通常相关标签可能会包括“Java”,“Web开发”,“数据库管理”,“开源”等,帮助用户更快速地理解内容主题。 **子文件名列表解析:** 虽然没有具体的子文件名列表,但可以期待在这样的项目中找到以下类型的文件: 1. JSP文件:包含HTML和Java代码,用于生成动态网页。 2. Java类文件或源代码:实现业务逻辑和数据库交互。 3. SQL脚本:可能用于创建或初始化数据库表结构。 4. XML配置文件:如web.xml,定义Web应用的部署描述符。 5. CSS和JavaScript文件:负责页面样式和交互效果。 6. README或文档文件:提供项目介绍、安装指南和使用说明。 7. 图像或其他资源文件:用于增强用户体验。 这个项目为学习JSP和数据库交互提供了宝贵的资源。通过分析和运行源代码,开发者不仅可以了解如何在Web环境中操作数据库,还能学习到如何构建可维护的Web应用。对于初学者或希望提升JSP技能的开发者来说,这是一个非常实用的学习材料。