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基于UNet的视网膜血管分割代码

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简介:
本项目提供了一种基于UNet架构的深度学习模型,用于自动分割视网膜图像中的血管结构。该代码旨在辅助医学研究与临床诊断,提高视网膜疾病的检测效率和准确性。 UNet医学影像分割源码的文件结构如下: - src:包含搭建U-Net模型的相关代码。 - train_utils:包括训练、验证以及多GPU训练所需的模块。 - my_dataset.py:自定义数据集类,用于读取DRIVE数据集(视网膜血管分割)。 - train.py:以单个GPU为例的训练脚本示例。 - train_multi_GPU.py:专为使用多个GPU进行训练而设计的脚本。 - predict.py:简易预测脚本,利用已训练好的权重文件对新图像进行预测测试。 - compute_mean_std.py:统计数据集各通道均值和标准差。

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客服
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  • UNet
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    本项目提供了一种基于UNet架构的深度学习模型,用于自动分割视网膜图像中的血管结构。该代码旨在辅助医学研究与临床诊断,提高视网膜疾病的检测效率和准确性。 UNet医学影像分割源码的文件结构如下: - src:包含搭建U-Net模型的相关代码。 - train_utils:包括训练、验证以及多GPU训练所需的模块。 - my_dataset.py:自定义数据集类,用于读取DRIVE数据集(视网膜血管分割)。 - train.py:以单个GPU为例的训练脚本示例。 - train_multi_GPU.py:专为使用多个GPU进行训练而设计的脚本。 - predict.py:简易预测脚本,利用已训练好的权重文件对新图像进行预测测试。 - compute_mean_std.py:统计数据集各通道均值和标准差。
  • U-Net(Pytorch实现)
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    本项目采用Pytorch框架实现了基于U-Net的深度学习模型,专为视网膜血管自动分割设计,旨在提高眼底疾病诊断的准确性和效率。 代码适配数据集需要根据数据集的特点进行相应的调整和优化,确保程序能够高效准确地处理数据。这通常包括对算法的选择、参数的调优以及可能的数据预处理步骤等。在开始编码之前,深入理解数据集的需求和限制是至关重要的。
  • 改良U-Net图像算法
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    本研究提出了一种改进的U-Net架构,专门用于视网膜血管图像的精确分割。通过优化卷积神经网络结构和引入注意力机制,显著提升了血管边缘检测的准确性和稳定性,为眼科疾病的早期诊断提供了有力工具。 为了应对视网膜图像血管细小导致的分割精度低等问题,本段落在U-Net网络基础上引入了Inception、空洞卷积与注意力机制模块,提出了一种改进的视网膜血管图像分割算法。具体而言,首先,在编码阶段加入了Inception模块,并利用不同尺度的卷积核进行特征提取,以获得多尺度的信息;其次,在U-Net底部增加了级联空洞卷积模块,从而在不增加网络参数的情况下扩大了感受野;最后,在解码阶段结合注意力机制和跳跃连接方式设计反卷积操作,聚焦目标特征,解决了权重分散等问题。实验结果显示,基于DRIVE标准图像集的测试表明,该算法相较于U-Net和其他传统分割方法分别提高了1.15%、6.15%与0.67%的平均准确率、灵敏度和特异性。
  • VesselSeg-Pytorch:用Pytorch工具包
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    简介:VesselSeg-Pytorch是一款基于Pytorch开发的视网膜血管分割工具包,旨在提供高效、准确的视网膜血管自动识别解决方案。 VesselSeg-Pytorch:基于pytorch的视网膜血管分割工具包 介绍: 该项目是使用Python和PyTorch框架开发的视网膜血管分割代码库,包含数据预处理、模型训练与测试及可视化等功能模块。适用于从事视网膜血管分割研究的研究人员。 要求: 项目的python环境所需的主要软件包及其版本如下所示: - python:3.7.9 - pytorch:1.7.0 - torchvision:0.8.0 - cudatoolkit:10.2.89 - cudnn:7.6.5
  • 图像与眼底三维重建
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    本研究致力于开发先进的算法和技术,用于精确分割视网膜血管图像,并构建眼底血管的三维模型,以提高眼科疾病的诊断和治疗水平。 眼底视网膜图像中的血管分布情况为高血压、糖尿病等疾病的早期诊断提供了重要的参考依据。通过计算机处理这些眼底图像可以减轻医生的重复劳动负担。本段落提出了一种新的用于分割眼底视网膜血管图像的算法,该算法首先利用局部归一化方法来消除背景差异性的影响;然后使用期望最大化算法进行聚类操作以实现精确地分割出血管区域;最后基于眼底成像原理通过投影逆变换构建了三维模型,使得可以从多个角度观察和分析视网膜结构。所建立的这种模型有助于更全面深入地理解与研究相关疾病的情况。
  • 改进U-Net方法研究.docx
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    本文探讨了一种基于优化版U-Net架构的视网膜血管自动分割技术,旨在提升医学图像处理精度与效率。通过实验验证了该算法的有效性及优越性能。 本段落探讨了视网膜血管分割的重要性以及在这一领域中深度学习技术的应用,特别是对U-Net网络的改进。视网膜血管分割对于多种眼部疾病的早期诊断至关重要,如糖尿病、高血压和早产儿的眼部病变。传统的方法依赖于医生的手动标注,效率低下且易出错。因此,研究人员转向了自动化算法,包括非监督学习和监督学习。 非监督学习算法,例如B-COSFIRE滤波器,能够精确检测血管的主干和末端部分,并特别适合处理微小血管的情况。而监督学习则利用预标注图像训练模型,如AdaBoost分类器用于对像素点进行分类。近年来,深度学习方法尤其是卷积神经网络(CNN)在医学图像处理中展现出强大的潜力。Ronneberger等人提出的U-Net以其特有的跳跃连接结构提升了特征提取的效率,但原始U-Net仍存在一些局限性,可能导致血管分割性能下降。 针对这些问题,研究者们进行了多种改进尝试。UU-Net引入了残差结构以增加网络深度,并通过Addition或Concatenation操作改善信息传递过程,形成多路径的信息流方式;AG-Net则结合注意力机制来指导滤波器恢复空间信息并减少噪声干扰的影响;无监督集成策略则是通过对多个基础网络结果的融合提高分割精度。IterNet采用迭代式U-Net结构发现并连接血管细节。 本段落提出的算法特别关注解决血管边界和非血管像素误分类的问题。在编码阶段,使用全局卷积网络(GCN)以及边界细化模块替代传统卷积操作以更准确地识别边界特征;为提高低对比度条件下的分割效果,改进了注意力机制包括位置注意与通道注意,并将这些改进应用于跳跃连接中;同时引入DenseNet加强特征提取过程,在解码阶段利用卷积长短记忆网络(ConvLSTM)来更好地捕捉空间信息并优化分割结果。 本段落的贡献在于提出了一种结合GCN、BR模块、改进后的注意力机制和ConvLSTM的新网络结构,旨在更精准地进行视网膜血管的分割处理。特别是在解决边界问题及低对比度场景时表现尤为突出。这种改进的U-Net架构有望进一步提升医学图像分析效率与准确性,并对临床诊断提供有力支持。
  • 改良版U-Net眼底方法
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    本研究提出了一种改进型U-Net算法,专门针对眼底图像中的视网膜血管进行精确分割,以提高眼科疾病的早期诊断和分析能力。 针对视网膜血管图像特征复杂度高的问题以及现有算法在微血管分割精度低及病理信息误分割等方面的不足,本段落提出了一种融合DenseNet和U-Net网络的血管分割模型。首先通过限制对比度直方图均衡化和滤波器处理增强图像中的血管;其次利用局部自适应gamma校正提升图像亮度并减少伪影干扰;接着采用多尺度形态学滤波来加强微小血管特征信息;最后使用U型密集链接模块进行精确分割。该算法在DRIVE数据集上的实验结果显示,其平均准确率、灵敏度和特异性分别达到了96.74%、81.50%和98.20%,表明了良好的性能表现。
  • DRIVE——利用像素点BP络与CNN实现
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    本项目采用基于BP神经网络和卷积神经网络(CNN)技术,通过处理像素级数据来精确分割视网膜血管图像。该方法在DRIVE数据库上进行了测试,为眼底疾病早期诊断提供技术支持。 主要包括数据预处理:读取DRIVE数据集的训练和测试数据,然后将图片灰度化、填充、进行像素点切片(9*9)、归一化等操作。网络为BP和CNN的训练代码以及测试代码。
  • 深度类与图像提取模型
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    本研究提出了一种创新的深度学习模型,专门用于从视网膜图像中高效、准确地提取血管结构。该模型结合了先进的分类和分割技术,显著提升了血管检测精度,为眼疾早期诊断提供了有力工具。 视网膜图像中血管提取的深度分类和分割模型
  • Retina-VesselNet:TensorFlow2简化U-net模型用-源
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    本项目提供一个基于TensorFlow2的精简版U-net模型——Retina-VesselNet,专为视网膜血管图像分割设计。代码开源以促进相关研究与应用开发。 由于该项目已于2021年3月18日升级到Tensorflow 2.3版本,因此可以找到停止维护的旧分支: - [2019-6-9] keras-tensorflow 分支: - [2018-5-2] keras-theano 分支: 项目结构包括一个简单的U-net模型用于视网膜血管分割,并带有DRIVE数据集。我们提供了两个版本的项目,它们在实现上完全一致。 建议首先运行其中一个版本以获得直观演示。不同笔记本有不同的用途: - EntireBookForColab.ipynb 包含项目的完整部分,如过程、训练和测试。 - PreprocessIllustration.ipynb 展示了一些视网膜图像的预处理方法。 - TestAndEvaluation.ipynb 用于评估。 选择一个版本并开始使用吧!