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DFT的Matlab源代码“SurfinPy”用于热力学相图的生成。

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简介:
DFT的matlab源代码SurfinPy是一个开放源代码Python项目,名为surfinpy。它旨在为用户提供一种便捷的方式,从头计算开始,生成可以直接应用于发布的相图。Surfinpy构建于现有的Python软件包之上,这些软件包已广泛应用于固态物理和化学领域,因此用户应该对此类工具较为熟悉。我们期望该工具能够为固态物理/化学社区带来积极影响,并加速生成可直接使用的相图(借助Matplotlib提供的支持)。其主要功能包括:基于化学势的表面相图生成方法;根据两种吸附物质(例如水和二氧化碳)的化学势,绘制相应的图表;根据一个吸附物种和一个表面物种(例如水和氧空位)的化学势,生成对应的图表;以及将实验数据与从头计算数据相结合,从而构建温度相关的相图。此外,该工具还能够生成表面相图随温度和压力变化趋势的方法。通过将实验数据与从头计算数据结合使用,可以绘制压力与温度关系的图表,清晰地展示表面状态在温度和压力下的表现形式。Surfinpy还利用计算出的表面能来确定晶体形态。同时,它能够与所生成的表面能以及Pymatgen内置的颗粒形态协同工作。为了避免粒子形状随温度和压力变化而改变,该工具还具备了避免这种变化的机制。最后, Surfinpy能够生成体相图作为化学势函数的表现形式, 同样基于两种物质(例如水和二氧化碳)的化学势进行绘图, 并将实验数据与从头计算数据进行整合.

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客服
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  • DFTMatlab-SurfinPy:工具
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    SurfinPy是一款基于Matlab开发的开源软件包,利用密度泛函理论(DFT)计算数据来生成材料系统的完整热力学相图。 DFT的matlab源代码SurfinPy是开放源代码Python项目surfinpy的一部分。该项目旨在帮助从头算开始生成发布就绪相图,适用于表面和散装材料的研究。surfinpy基于现有Python软件包构建,这些软件包在固态物理/化学社区中已被广泛使用。希望该工具能够为固态研究带来一些益处,并促进准备就绪的阶段图(由Matplotlib支持)的生成。 主要功能包括: - 根据化学势生成表面相图的方法。 - 依据两种吸附物质,如水和二氧化碳的化学势来绘制图表。 - 利用一个吸附物种与一个表面物种,例如水和氧空位之间的化学势关系生成图表。 - 结合实验数据与从头算数据以创建随温度变化的关系图。 - 根据计算出的表面能建立晶体形态,并利用Pymatgen内置颗粒形态来避免粒子形状因温度和压力的变化而改变。 - 依据两种物质,例如水和二氧化碳之间的化学势生成体相图。
  • 和色斑
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    这段代码能够帮助用户轻松创建美观且信息量大的热力图与色斑图,适用于数据分析、科学展示等多种场景。 适用于各种色斑图生成的热力图代码,导入VS后可直接运行。
  • MATLABDFT - ligpy:木质素解动模型
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    ligpy是一款基于MATLAB开发的木质素热解动力学模拟工具,包含详细的离散傅里叶变换(DFT)源码,用于深入研究和分析木质素降解过程。 木质素热解的动力学模型(ligpy)的开发是由于通过木质纤维素原料进行生物量增值的过程中缺乏详细动力学模型而受到限制。为了优化用于生产燃料和化学品的工业生物质快速热解,除了增加机械理解外,还需要更详细的模型来实现这一目标。 我们已建立了一个涉及约100种不同物质与400个反应步骤的动力学模型,该模型能够预测木质素在热解过程中分子及官能团的时间演变情况。此模型提供的信息超出了常规热解模型的总产量范围,并且无需进行拟合即可适用于更广泛的原料和反应条件。 通过超过200万次模拟进行了详尽的全局敏感性分析,揭示了对预测结果影响最大的因素(可通过使用灵敏度分析的结果及可视化软件包来确定)。虽然该模型可以用于快速热解过程中的预测,但最近开发的动力学控制生物质快速热解技术尚未应用于木质素。 ligpy是为了创建动力学模型而设计的软件包,并在我们2016年的IECR论文中进行了描述。请查阅文档以了解如何使用ligpy的相关信息。
  • pyHeatMap——一个Python库
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    pyHeatMap是一款专为Python用户设计的开源工具包,它能够帮助开发者轻松创建美观且功能强大的交互式热力图。通过简单的代码即可展现复杂数据集中的模式和趋势。 pyHeatMap是一个用于绘制热力图的Python库,依赖于Pillow,并且兼容Python 2/3。
  • DFTMatlab-DFT_Panorama: 全景DFT
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    DFT_Panorama项目提供了一套使用MATLAB实现的离散傅里叶变换(DFT)算法,专门应用于全景图像处理。此代码库适合研究和开发全景图像技术的专业人士。 DFT的MATLAB源代码项目通过在表面上传递滑动窗口并将离散傅里叶变换(DFT)应用于窗口内的音高类来分析乐谱(编码为XML,MEI,MusicXML等)。结果以数字形式表示谐波质量,并可以将其转换成表格或图形可视化。为了运行程序并生成可视化文件,请使用笔记本DFT_Main。项目包含一个小规模的语料库,但您也可以在DFT_Corpus中添加其他乐谱文件。可视化的图表将被保存为交互式的HTML格式,在DFT_Graphing中可以编辑这些文件的保存位置。此外,除了Python3.8之外,还需要安装以下软件包:music21、numpy、pandas、plotly和tkinter。
  • MATLAB
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    本篇文章详细介绍了如何使用MATLAB创建和定制热力图,并附有实用示例代码,帮助读者掌握数据可视化技巧。 尽管PPT能够绘制大多数图像,但在处理特定类型的图像时会显得有些力不从心。相比之下,在MATLAB环境中可以更方便地解决这类问题。强制色阶热力图的常用方法是通过颜色对比来识别两个矩阵或表格之间的变化和差异,默认情况下,heatmap函数将矩阵中的最小值与最大值分别映射为最低和最高色彩级别。 然而,当需要确保数据到颜色的映射保持一致时,这种默认设置可能并不理想。为此,heatmap提供了MinColorValue和MaxColorValue参数来控制哪些数值对应于热图中最低或最高的色阶,从而帮助我们在比较不同热力图的时候能够使用相同的颜色范围。此外,在处理包含NaN值的数据集时,默认情况下这些缺失值会被映射为最暗的颜色。 通过设置NaNColor选项,用户可以指定用于表示NaN或者空缺数据的具体色彩;例如在下述示例中我们将其设定成黑色以便与代表低数值的其他元素区分开来。颜色条(colorbar)也是一个有用的工具,它允许你将一个直观的颜色参考添加到热力图旁边,并且这些标签会根据热图上的文本格式自动调整。 请注意,在下面展示的一个具体实例里,可以看到颜色栏上使用了$符号进行标记。
  • DFTMatlab-DFTfun_A_density_functional_theory_solver: 展示...
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    DFTfun_A_density_functional_theory_solver是一个基于Matlab编写的程序包,提供了一套实现密度泛函理论计算的函数,适用于教学和科研展示。 DFT的MATLAB源代码DFTfun曾经在CodePlex上上传过,但由于Microsoft关闭了CodePlex,该代码已转移到其他地方。这是一个针对Hartree-Fock(HF)和密度泛函理论(仅X-alpha功能)学习者的示例性代码,在内部有详细的注释来帮助读者理解DFT和HF的基础算法。 此代码可以利用我自己的高斯基集积分函数计算包含第二行及第三行原子的分子。此外,它还提供了从计算结果中提取并可视化分子轨道、电子密度以及波函数等信息的功能。 对于对分子几何优化感兴趣的用户,在我的GitHub账户的Chem-kit存储库中实现了BFGS和GDIIS优化器(不打算实现分析能量梯度功能,因为如果不使用编译器级别的优化,其计算速度会太慢)。 在HF级别上进行的能量计算结果应与高斯软件完全一致。然而由于密度函数积分网格定义的不同(我的积分网格不会被截断且更粗糙),DFT的计算结果可能会稍有不同。
  • DFTMATLAB-DFT:DFT
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    这段MATLAB源代码实现了离散傅里叶变换(DFT),可用于信号处理和分析中的频谱计算等应用。代码简洁高效,适合学习与研究使用。 DFT是用于筛选(F)和转化(T)的工具。数据通过stdin输入,并以json格式提供,在经过过滤器和转换处理后输出结果。 使用方法:dft [FILTER|TRANSFORM]*[OUTPUT] 每个应用在命令行中的过滤器和变换会按照它们出现的顺序应用于整个对象。 例子: 测试文件应从上至下阅读,首先查看filter_test.go,接着是transform_test.go,最后看output_test.go。 通过元数据键筛选GoogleComputeEngine实例: 实际的数据列表包含更多信息,但为了便于理解示例已简化。DFT处理时不会在意这些细节。 $cat in.json [ { metadata: { items: [ {key:who,value:owned-by-jasmuth}, {key:startup-script,value:/root/start_worker.bash} ] }, name:process-1 ]
  • 优质
    热力图代码来源介绍了一系列用于创建和展示数据热力图的编程资源和教程。涵盖多种编程语言及工具,帮助用户轻松实现可视化数据分析。 本代码简单介绍如何用Python绘制热力图,仅供大家分享和参考。
  • Unity中方法
    优质
    本篇文章将详细介绍如何在Unity引擎中利用插件和脚本来创建动态热力图,涵盖数据收集、处理及可视化全过程。 在图片上绘制热力图并赋予材质。