SCENIC: 一个用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络及细胞类型的R软件包

简介：
SCENIC是一款基于单细胞RNA测序技术的R语言软件包，能够高效地推断出基因调控网络与细胞类型，为复杂生物系统的解析提供了强大工具。 SCENIC（单细胞重组网络推断和聚类）是一种利用单细胞RNA序列数据来推断基因调控网络及识别不同细胞类型的计算方法。 该技术的详细描述以及一些使用示例可以在相关文献中找到。目前，SCENIC在R语言环境与Python环境中均有实现版本。对于不熟悉R编程语言的用户来说，可以考虑查看包含Nextflow工作流程的SCENIC或pySCENIC Jupyter笔记本以简化运行过程（强烈建议用于批量处理大体量数据）。之后可以在R、Python或是Web界面SCope中浏览分析结果。 有关在R环境中使用和安装SCENIC的具体说明，请参考相关教程。示例输出文件可在指定位置获取。 常见问题解答： - 2021年3月26日：发布新的教程以帮助用户更好地理解和应用该方法； - 2020年6月26日：更新了包含Nextflow工作流程的SCENIC协议及pySCENIC Jupyter笔记本，现在已正式上线。