
夏末项目2020,基于SEIR传染病模型的Matlab代码。
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简介:
该“seir”传染病模型项目于2020年启动。此存储库提供了一个简化的模拟程序,并包含一些探索性的代码,旨在补充关于狄拉克型流行病的理论研究成果(可在其他文献中查阅)。该项目主要由两个部分构成:首先,R代码用于生成具有不同参数和假设的流行病模型。所有这些R代码均基于iGraph和[2,3](两者均位于主文件夹中)的灵感,它们是用于图论分析的强大工具。其次,Matlab代码(位于/R0目录中)用于模拟示例1.4.5的内容,包含了功能以及一个示例文件,以便用户深入了解运行机制和技术细节。R代码仅依赖于两个非标准程序包:iGraph(仅在探索性代码的一小部分中使用,不包含任何功能),以及collection包(请参考相关文档)。该R版本为3.6.1,较早的版本也可能满足需求。Matlab则使用R2020a版本开发,并充分利用了SymbolicMathToolbox中的vpasolve函数进行求解。我们通过假设个体具有随机的传染性来对流行病行为进行建模,例如模拟俱乐部访问等流行病事件。具体而言,每个个体被归类为两种类型的传染性:要么所有传染性都集中在一个时间点上;要么受感染的个体在一段时间内持续保持感染状态,随后最终结束感染过程。
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