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基于PyTorch的U-Net图像分割网络代码

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简介:
本项目提供了一个基于PyTorch框架实现的U-Net神经网络模型,专门用于医学影像中的图像分割任务。 图像分割U-Net网络的代码可以基于PyTorch实现。这种架构特别适合处理医学影像分析中的任务,如生物组织边界检测。通过编码器解码器结构结合跳跃连接,U-Net能够有效利用空间上下文信息提高边缘细节的精确度和连贯性。在使用时,请确保安装了相应的依赖库,并根据具体需求调整网络参数或添加预训练模型进行迁移学习以适应不同场景的应用要求。

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  • PyTorchU-Net
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    本项目提供了一个基于PyTorch框架实现的U-Net神经网络模型,专门用于医学影像中的图像分割任务。 图像分割U-Net网络的代码可以基于PyTorch实现。这种架构特别适合处理医学影像分析中的任务,如生物组织边界检测。通过编码器解码器结构结合跳跃连接,U-Net能够有效利用空间上下文信息提高边缘细节的精确度和连贯性。在使用时,请确保安装了相应的依赖库,并根据具体需求调整网络参数或添加预训练模型进行迁移学习以适应不同场景的应用要求。
  • PyTorch-Unet: 简易实现U-Net及全卷积(FCN)
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    本项目提供了一个简易实现的PyTorch版U-Net和全卷积网络(FCN),用于高效处理医学影像等领域的图像分割任务。 该存储库包含U-Net和FCN的简单PyTorch实现,这是Ronneberger等人提出的深度学习分割方法以及Long等人提出的方法。用于训练的合成图像/掩码首先需要克隆此存储库并进入项目目录。 导入所需的Python包: ```python import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np import helper import simulation ``` 生成一些随机图像: ```python input_images, target_masks = simulation.generate_random_data(192, 192, count=3) for x in [input_images, target_masks]: print(x.shape) print(input_images.mean()) ``` 注意:代码中的最后一行`print(x.m`可能是错误的,应该为`print(input_images.mean())`以输出输入图像的平均值。
  • 3DUnetCNN:Pytorch医学用3D U-Net卷积神经(CNN)设计
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    3DUnetCNN是一个采用PyTorch框架实现的深度学习项目,专注于使用3D U-Net卷积神经网络进行高效的医学图像分割。该模型特别适用于处理三维医学影像数据,以提高医疗诊断和治疗规划的精确度与效率。 我们设计了3D U-Net卷积神经网络(CNN),使其易于应用并控制各种深度学习模型对医学成像数据的训练与使用。该项目提供了如何将本项目与来自MICCAI的各种挑战的数据一起使用的示例/教程。 依赖关系包括: - 火炬 - Nilearn - 大熊猫 - 凯拉斯 引用如下:Ellis DG,Aizenberg MR(2021),尝试使用开源深度学习框架对胶质瘤进行分割的U-Net培训修改。在Crimi A.和Bakas S.编辑的《脑损伤:脑胶质瘤、多发性硬化症、中风和脑外伤》一书中,作为BrainLes 2020的一部分。计算机科学讲座第12659卷。 其他引用: Ellis DG,Aizenberg MR(2020)使用通过注册增强的深度。
  • PyTorchU-Net与ResNet细胞类实战
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    本项目提供在PyTorch框架下实现的U-Net模型用于图像分割和基于ResNet的细胞分类模型。包括详细注释的实战代码,适合深度学习初学者实践。 在当前人工智能领域,特别是深度学习技术逐渐成熟并广泛应用的背景下,图像处理技术正在医疗行业引发一场变革。医学图像处理的重要性在于它能够帮助医生更准确地诊断疾病,并提高治疗效果。本课程主要围绕两个关键部分进行:基于U-Net的图像分割技术和基于Resnet网络的细胞分类技术。 首先介绍的是U-Net,这是一种用于生物医学图像分割任务中的卷积神经网络架构。由于其编码器与解码器结构,即使在标注数据有限的情况下也能实现高效利用上下文信息,并达到较好的分割效果。这种通过连接高级特征图和上采样特征图的机制使得U-Net在网络处理复杂背景下的图像时表现出色,在医学领域得到了广泛应用。 另一方面,Resnet网络(残差网络)是另一种在图像识别任务中表现优异的深度学习架构。它引入了“残差学习”的概念解决了训练过程中梯度消失的问题,并能够支持更深层次的神经网络模型以提高准确率和效率。在细胞分类的应用场景下,利用Resnet可以将细胞图像精确地归类为不同的类别。 本课程中的实战代码旨在指导学生如何使用PyTorch这一强大的深度学习框架实现上述技术。通过提供的实例项目,学生们能够亲自编写并运行基于U-Net的分割任务和基于Resnet的分类模型,并理解其背后的原理与技巧。 关于在代码执行过程中遇到的问题AttributeError: module ‘albumentations.augmentations.transforms‘ has no attribute ‘RandomRotate90’。这通常是因为使用者试图调用一个不存在的方法或属性,可能是由于安装版本不兼容或者代码本身的错误导致的。解决此问题需要检查当前使用的库版本,并确保它与所需代码匹配;如果发现使用的是旧版,则需更新相应的库调用。 本课程的目标是让学生通过实战项目了解并掌握在医学图像处理中利用深度学习技术,特别是U-Net和Resnet模型的方法来实现图像分割及细胞分类。这些技能可以帮助学生更深入地理解相关技术的应用,并具备解决实际问题的能力。
  • U-net肝脏.pdf
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    本文探讨了利用U-Net模型进行肝脏图像自动分割的方法,通过改进神经网络架构和训练策略以提高分割精度与效率。 这篇学位论文对机器学习在肝脏Dicom图像分割领域的初学者非常有帮助。它详细介绍了整个流程以及网络的建立过程,非常适合深度学习新手阅读。
  • U-Net膜血管Pytorch实现)
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    本项目采用Pytorch框架实现了基于U-Net的深度学习模型,专为视网膜血管自动分割设计,旨在提高眼底疾病诊断的准确性和效率。 代码适配数据集需要根据数据集的特点进行相应的调整和优化,确保程序能够高效准确地处理数据。这通常包括对算法的选择、参数的调优以及可能的数据预处理步骤等。在开始编码之前,深入理解数据集的需求和限制是至关重要的。
  • Pytorch-UNet:PyTorchU-Net实现,适用高质量语义-源
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    简介:Pytorch-UNet是利用PyTorch框架构建的一个高效U-Net模型,专为高质量图像的精细语义分割设计。此项目提供完整的源代码,便于研究与应用开发。 在PyTorch中使用UNet进行语义分割的自定义实现针对Kaggle上的高清晰度图像。该模型是从头开始训练的,并且基于5000张无数据增强处理的图像,其测试结果为:在超过10万张测试图片上获得了得分0.988423(735中的511)。可以通过增加更多的训练、应用数据增强技术、微调模型参数、使用CRF后处理以及对蒙版边缘施加更多权重来进一步提高此分数。Carvana的数据集可以获取并用于实验。 在预言训练好模型,并将其保存为MODEL.pth之后,您可以通过命令行接口轻松地测试图像上的输出蒙版。 预测单个图片的掩码并保存: ``` python predict.py -i image.jpg -o output.jpg ``` 要对多张图进行预测并在屏幕上显示结果而不保存它们,请使用以下命令: ``` python predict.py -i image1.jpg image2.jpg --viz --no-save ```
  • Pytorch-UNet:PyTorchU-Net实现,适用高质量语义-源
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    Pytorch-UNet是一款利用PyTorch框架开发的高性能U-Net模型,专为高质量图像提供精准语义分割解决方案。此项目包含详尽源代码,适合研究与应用需求。 UNet使用PyTorch进行语义分割,在Kaggle的自定义实施中针对高清晰度图像进行了优化。该模型是从头开始训练的,并利用了5000张图像(无数据增强),在超过10万张测试图像上获得了0.988423的成绩,即735个预测中有511个正确。 可以通过增加更多的培训、使用数据增强技术、微调模型、应用CRF后处理以及在蒙版边缘施加更多权重来进一步提高这一分数。Carvana的数据集可以用来训练和测试该模型。 要使用已经训练好的模型进行图像预测,请确保您安装了Python 3.6或更高版本,并且已将预训练的模型保存为MODEL.pth文件。然后,可以通过命令行界面轻松地在单个或多张图片上运行预测并查看结果: - 预测单一图像并将输出蒙版另存为文件:`python predict.py -i image.jpg -o output.jpg` - 对多幅图像进行预测并在屏幕上显示而不保存它们: `python predict.py -i image1.jpg image2.jpg --viz --no-save`
  • U-Net遥感语义毕业设计.rar
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    本毕业设计采用U-Net网络模型对遥感图像进行语义分割研究,旨在提高分割精度和效率。包含算法实现、实验分析及结果讨论等内容。 基于 U-Net 网络的遥感图像语义分割 一、研究目的: U-Net 是一种由全卷积神经网络启发而来的对称结构,在医疗影像分割领域表现出色。本研究旨在探索将 U-Net 应用于多光谱遥感数据集,以实现自动建筑识别,并寻找简化遥感图像处理的方法。 二、研究方法: 提出了一种新的损失函数——类别平衡交叉熵(Category Balanced Cross Entropy),专门针对遥感影像中的类别不平衡问题。此新损失函数与 U-Net 结合使用,在 Inria Aerial Image Labeling 数据集上进行训练,分别采用传统交叉熵和类别平衡交叉熵两种方法得到两个模型。之后在测试数据集中评估这两种模型的性能。 三、研究结论: 无论是通过正确率还是交叉熵度量,上述两者的差异不大;但当使用 F1 Score 作为评价标准时,两者表现出显著区别:基于普通交叉熵的方法获得的F1分数为0.47,而类别平衡交叉熵方法则有更高的F1得分。
  • U-Net、R2U-Net、Attention U-Net及Attention R2U-Net...
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    本文综述了医学影像领域中四种主流的图像分割网络模型:U-Net、R2U-Net、Attention U-Net和Attention R2U-Net,深入探讨它们的特点与应用。 本段落介绍了几种基于U-Net架构的改进模型在生物医学图像分割中的应用:原始U-Net、递归残差卷积神经网络(R2U-Net)、带有注意力机制的U-Net(Attention U-Net)以及结合了R2U和Attention机制的新型网络结构(Attention R2U-Net)。这些改进旨在提升模型在医学图像分割任务中的性能。实验使用了一个包含2594张图像的数据集,该数据集被分为训练、验证及测试三个子集,比例分别为70%、10%和20%,其中用于训练的有1815幅图,用于验证的是259幅图,剩下的520幅则作为模型评估之用。