
DockIt:利用Vina系列引擎实现多目标和配体的高通量分子对接
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简介:
DockIt是一款基于Vina系列引擎开发的软件工具,专注于大规模药物筛选与设计。它支持同时进行多个靶点及配体的高效分子对接计算,显著加速了新药研发进程。
Dockit 使用AutoDock Vina系列引擎执行与多个目标和配体的高通量分子对接。
产品特点:
- 同时与多个靶标和配体进行分子对接。
- 灵活的目标残留声明。
- 可使用其他类似Vina的引擎。
- 配备原始PDBQT准备方法,随MGLTools分发。
- 自动化的PDBQT文件准备流程。
- 选项支持配体能量最小化处理。
- 输出CSV文件汇总所有模式下的停靠结果,便于访问和分析数据。
- 支持Docker容器环境。可以在任何地方运行Dockit。
安装方法(Docker或Conda):
对于使用Docker的用户,请确保已经安装了Docker及docker-compose工具后进行以下操作:
1. 克隆Dockit仓库
2. 进入克隆后的目录
或者,如果您更喜欢使用conda环境来管理依赖项,则可以按照如下步骤操作:
1. 安装必要的软件包。
2. 克隆Dockit仓库并进入相应的文件夹。
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