Allen-Voxel-Network：艾伦脑科学研究所体素连接数据的处理管道

简介：
Allen-Voxel-Network是由艾伦脑科学研究所开发的一种创新性处理管道，专门用于分析和解释复杂的体素连接数据，推进了大脑网络研究。 艾伦-体素网络是一个用于处理来自艾伦脑科学研究所的体素级连接数据的工具。 需求： 1. 安装h5py（已通过0.13.1版本测试，但不保证与更高版本兼容）。 2. 安装skimage和mayavi（可选，主要用于可视化）。 操作步骤如下： 生成体素线性模型：编辑run_setup.py文件。这一步用于设置要包含的结构以及正则化参数值等信息。 创建视觉矩阵：运行命令`python create_visual_matrices.py` 。此命令会构建一个目录层次结构以进行带有嵌套交叉验证的模型拟合过程。 执行模型拟合：在项目目录中，使用model_fitting_cmds文件中的命令来执行模型拟合操作。 选择与适配模型：运行 `python model_select_and_fit.py`。该脚本会在内部交叉验证循环中评估误差并进行模型选择。 适合选定的模型：最后，通过运行model_fitting_after_selection_cmds文件中的命令来适应所选的模型。