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GATK: 4及以上版本的官方代码仓库

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简介：
GATK（Genome Analysis Toolkit）是一款由Broad研究所开发的用于高通量测序数据分析的软件套件。自4.0版起，其官方代码库托管于GitHub上，持续更新与维护中。 请访问相关页面以下载预编译的可执行文件、阅读文档并获取技术支持。有关GitHub的基础知识，请自行查阅相关资料。 GATK 4 存储库包含下一代基因组分析工具包（GATK）。该存储库的内容是100%开源，并根据Apache 2.0许可发布。 GATK4旨在在一个简化的框架下将来自不同代码库的完善工具集整合在一起，使选定的工具能够在本地集群或云环境中大规模并行运行。它还包含许多在早期版本中没有的新开发工具。 目录包括： - 将JVM选项传递给gatk - 将配置文件传递给gatk - 使用Google Cloud Storage上的输入来运行GATK4 - 在本地运行GATK4 Spark工具 - 在Spark集群上运行GATK4 Spark工具 - 在Google Cloud Dataproc上运行GATK4 Spark工具 - 使用R生成图 - Bash的GATK标签完成

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  • GATK: 4及以上版本的官方代码仓库
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    GATK（Genome Analysis Toolkit）是一款由Broad研究所开发的用于高通量测序数据分析的软件套件。自4.0版起，其官方代码库托管于GitHub上，持续更新与维护中。 请访问相关页面以下载预编译的可执行文件、阅读文档并获取技术支持。有关GitHub的基础知识，请自行查阅相关资料。 GATK 4 存储库包含下一代基因组分析工具包（GATK）。该存储库的内容是100%开源，并根据Apache 2.0许可发布。 GATK4旨在在一个简化的框架下将来自不同代码库的完善工具集整合在一起，使选定的工具能够在本地集群或云环境中大规模并行运行。它还包含许多在早期版本中没有的新开发工具。 目录包括： - 将JVM选项传递给gatk - 将配置文件传递给gatk - 使用Google Cloud Storage上的输入来运行GATK4 - 在本地运行GATK4 Spark工具 - 在Spark集群上运行GATK4 Spark工具 - 在Google Cloud Dataproc上运行GATK4 Spark工具 - 使用R生成图 - Bash的GATK标签完成
     
  • TransBTS官方代码库：此仓库包含TransBTS的官方代码
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    简介：TransBTS官方代码库汇集了该模型的全部官方源码，便于研究人员和开发者学习、实验及进一步开发。 TransBTS：使用变压器的多模式脑肿瘤分割 这是正式实现的一部分。可以从相关来源获取多模式脑肿瘤数据集（BraTS 2019）。 3D TransBTS架构描述如下： 要求： - Python 3.7 - PyTorch 1.6.0 - TorchVision 0.7.0 数据预处理步骤包括从下载的数据集中将.nii文件转换为.pkl文件，并进行日期归一化。 运行命令：`python3 preprocess.py` 训练过程涉及在BraTS数据集上使用训练脚本。分布式培训可用于建议的TransBTS模型，其中--nproc_per_node参数指定了使用的GPU数量，而--master_port则用于指定端口号。 运行命令：`python3 -m torch.distributed.launch --nproc_per_node=4 --master_port 20003 train.py` 测试已训练好的模型时，请使用相应的测试脚本。
     
  • MATLAB解压代码-XVFI: XVFI官方仓库
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    XVFI官方仓库提供了用于MATLAB环境下的XVFI工具包解压代码，便于用户直接使用和进一步开发。此资源为研究人员及工程师在相关领域工作提供了便利。 这是XVFI（eXtreme Video Frame Interpolation）的官方仓库，最后更新日期为2021年6月7日。 我们提供了训练与测试代码以及用于XVFI的预训练权重和数据集（包括训练集和测试集）。如果您发现此存储库有用，请考虑引用我们的相关文献。 在X-TEST上展示了x8倍帧内插的结果示例，即从4K@30fps输入帧生成4K@240fps输出。由于文件大小的限制，所有结果以30fps编码，并通过空间缩小比例来呈现慢动作效果。 所有方法都在X-TRAIN数据集上进行训练。 目录包括： - X4K1000FPS：这是一个包含极端运动情况下的高分辨率（4096×2160）和高速率（每秒1000帧）视频帧的数据集。 - 数据集中展示了一些示例，这些是具有极高帧速率（1000fps）和超高清分辨率的场景片段。我们的数据集涵盖了各种具有极端运动情况的场合。 我们提供了由X-TEST和X-TRAIN组成的完整版X4K1000FPS数据集，请参阅主要补充材料以获取有关此数据集的详细信息。
     
  • Android Studio官方汉化包2.2.0及以上版本下载
    优质
    本页面提供Android Studio官方汉化包2.2.0及以上版本的免费下载服务，帮助开发者轻松进行中文界面设置，提升开发效率。 网上流传的Android Studio汉化包2.2.2及2.2.3版本存在一些问题，在我的电脑上发现了bug——使用这些汉化包后，左侧定位代码文件按钮消失，导致无法直接跳转到指定文件。 经过一段时间寻找，我发现了一个可以使用的汉化版本，并且已经通过测试确认可用。这个新的汉化版能够正常显示并操作左侧的代码文件导航功能。之前上传过的其他汉化包也有同样的问题。
     
  • Android 5.0及以上版本的录屏源代码
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    这段简介可以描述为：“Android 5.0及以上版本的录屏源代码”提供了从API level 21开始的安卓系统屏幕录制功能的核心编码，适合开发者深入研究和二次开发使用。 这段源码的下载地址我已经忘记了，但是在运行过程中遇到了一些问题：录屏功能无声音输出，并且在Android 6.0系统上出现错误。这些问题我已修复并进行了测试，在小米手机的Android 6.0及魅族手机的Android 5.0系统中均可正常运行。
     
  • Unity3D 官方中文汉化包 (适用于2018.2.0及以上版本)
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    本汉化包为Unity官方软件提供中文支持，专为2018.2.0及以上版本设计，帮助用户更好地理解和操作Unity 3D引擎的各项功能。 虽然不建议大家使用中文版的Unity，因为后续会遇到很多英文文档，并且这个版本有很多直译的地方让人感到尴尬，例如“disable”被直译为“残疾人”，这让我当时找了半天才找到正确的词汇。
     
  • POI和EASYPOI的包依赖及冲突（版本4.X及以上）
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    本文章探讨了在使用POI及其简化版EasyPOI处理办公文档时遇到的包依赖与冲突问题，并提供了针对4.x及以上版本的有效解决方案。 在本地的MacOS及Windows系统上运行JAR文件都没有问题，但当上传到生产环境中的CENTOS并使用WAR包运行时，在导出或导入EXCEL操作中会出现各种错误。该资源包含了所有POI相关的包及其依赖项，主要包括：commons-compress-1.18.jar、easypoi-annotation-4.1.3.jar、poi-4.1.0.jar、poi-ooxml-4.1.0.jar、poi-ooxml-schemas-4.1.0.jar 和 xmlbeans-3.1.0.jar。
     
  • MyBatis-Plus 3.0及以上版本的代码生成器
    优质
    简介：MyBatis-Plus 3.0及以上版本提供了一款强大的代码生成器工具，能够自动生成实体类、Mapper接口及XML等常用代码文件，极大提高开发效率。 该版本是MyBatisPlus 3.0以后自动生成代码的工具，包含VO、DTO、Domain、Service、Controller和DAO。
     
  • 数据仓库（第4版）
    优质
    《数据仓库（第4版）》全面介绍了构建和使用企业级数据仓库的关键技术和最佳实践，是数据管理和商业智能领域的经典之作。 推荐一本学习数据仓库的经典书籍，以下是该书的目录： - 译者序 - 审、译者简介 - 前言 第1章 决策支持系统的发展 1.1 演化 1.2 直接存取存储设备的产生 1.3 个人计算机/第四代编程语言技术 1.4 进入抽取程序 1.5 蜘蛛网 1.6 自然演化体系结构的问题 1.6.1 数据缺乏可信性 1.6.2 生产率问题 1.6.3 从数据到信息 1.6.4 方法的变迁 1.7 体系结构设计环境 1.7.1 体系结构设计环境的层次 1.7.2 集成 1.8 用户是谁 1.9 开发生命周期 1.10 硬件利用模式 1.11 建立重建工程的舞台 1.12 监控数据仓库环境 1.13 小结 第2章 数据仓库环境 2.1 数据仓库的结构 2.2 面向主题 2.3 第一天到第n天的现象 2.4 粒度 2.4.1 粒度的一个例子 2.4.2 粒度的双重级别 2.5 分割问题 2.6 样本数据库 2.7 数据分割 2.8 数据仓库中的数据组织 2.9 数据仓库—标准手册 2.10 审计和数据仓库 2.11 成本合理性 2.12 清理仓库数据 2.13 报表和体系结构设计环境 2.14 机遇性的操作型窗口 2.15 小结 第3章 设计数据仓库 3.1 从操作型数据开始 3.2 数据/过程模型和体系结构设计环境 3.3 数据仓库和数据模型 3.3.1 数据模型 3.3.2 中间层数据模型 3.3.3 物理数据模型 3.4 数据模型和反复开发 3.5 规范化/反规范化 3.6 数据仓库中的快照 3.7 元数据 3.8 数据仓库中的管理参照表 3.9 数据周期 3.10 转换和集成的复杂性 3.11 触发数据仓库记录 3.11.1 事件 3.11.2 快照的构成 3.11.3 一些例子 3.12 简要记录 3.13 管理大量数据 3.14 创建多个简要记录 3.15 从数据仓库环境到操作型环境 3.16 正常处理 3.17 数据仓库数据的直接访问 3.18 数据仓库数据的间接访问 3.18.1 航空公司的佣金计算系统 3.18.2 零售个性化系统 3.18.3 信用审核 3.19 数据仓库数据的间接利用 3.20 星型连接 3.21 小结 第4章 数据仓库中的粒度 4.1 粗略估算 4.2 粒度划分过程的输入 4.3 双重或单一的粒度？ 4.4 确定粒度级别 4.5 一些反馈循环技巧 4.6 粒度级别的例子：银行环境 4.7 小结 第5章 数据仓库和技术 5.1 管理大量数据 5.2 管理多介质 5.3 索引/监视数据 5.4 多种技术的接口 5.5 程序员/设计者对数据存放位置的控制 5.6 数据并行存储/管理 5.7 元数据管理 5.8 语言接口 5.9 数据高效装入 5.10 高效索引利用 5.11 数据压缩 5.12 复合键码 5.13 变长数据 5.14 加锁管理 5.15 单独索引处理 5.16 快速恢复 5.17 其他技术特征 5.18 DBMS类型和数据仓库
     
  • 解决Bootstrap 4及以上版本的图标使用问题
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    本文将详细介绍如何在Bootstrap 4及更高版本中有效地使用图标，帮助读者解决常见的图标集成和显示问题。 1. 将3版本的fonts文件夹复制到你的目录。 2. 在bootstrap.min.css后面添加以下代码以完成@font-face设置： ```css @font-face { font-family: Glyphicons Halflings; src: url(../fonts/glyphicons-halflings-regular.eot); src: url(../fonts/glyphicons-halflings-regular.eot?#iefix) format(embedded-opentype), url(../fonts/glyphicons-halflings-regular.woff) ```