在R中实现PHATE降维的phateR方法
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简介：
phateR是用于R语言的一个专用软件包，专门实现了PHATE（潜在哈密顿单元嵌入）算法，以高效地对高维数据进行非线性降维，便于复杂生物信息学数据集的可视化与分析。
磷酸盐 R包提供了PHATE可视化方法的支持。关于该方法的详细介绍，请参阅相关文档。
为了在R环境中使用PHATE，您还需要安装Python软件包。如果您尚未安装python或pip，则需要先进行这些工具的安装。我们推荐使用Miniconda3来同时获取Python和pip；或者您可以按照pip官方说明自行安装pip。
首先，在终端中通过执行以下命令来从PyPi（Python代码库）安装phate：
```
pip install --user phate
```
然后，您可以通过在R中运行下列代码行从CRAN（综合R存档网络）获取并安装phateR包：
```r
install.packages(phateR)
```
此外，还可以通过devtools进行安装，并使用reticulate。
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