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PyTorch-GAT: 基于Veličković等人论文的实现 附带用于探索Cora数据集及GAT嵌入的代码

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简介:
PyTorch-GAT是一个基于Veličković等人的研究成果,提供了使用PyTorch框架进行图注意力网络(GAT)操作的工具。此项目还包含了针对学术文章分类数据集Cora的相关实验代码以及探索性分析代码,以帮助用户更好地理解与应用图神经网络技术。 GAT-图注意力网络(PyTorch):简化了原始GAT论文的PyTorch实现。其目的是让一般用户更轻松地理解和使用GAT以及其它图形神经网络。 目录 什么是GNN? 图神经网络是一系列处理定义在图上信号的神经网络。 由于图可以模拟许多有趣的自然现象,因此它们被广泛应用于各个领域: - 计算生物学:预测强效 - 计算药理学:预测药物效果 - 流量预测:例如交通流量分析 - 推荐系统(用于电影、音乐等) 甚至在大型粒子加速器等领域也得到了应用,并且这个列表还在不断增长! GAT是一种空间(卷积)图神经网络的代表。由于CNN在计算机视觉领域取得了巨大成功,研究人员决定将其推广到图形处理中,从而诞生了如GAT这样的技术。

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  • PyTorch-GAT: Veličković CoraGAT
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    PyTorch-GAT是一个基于Veličković等人的研究成果,提供了使用PyTorch框架进行图注意力网络(GAT)操作的工具。此项目还包含了针对学术文章分类数据集Cora的相关实验代码以及探索性分析代码,以帮助用户更好地理解与应用图神经网络技术。 GAT-图注意力网络(PyTorch):简化了原始GAT论文的PyTorch实现。其目的是让一般用户更轻松地理解和使用GAT以及其它图形神经网络。 目录 什么是GNN? 图神经网络是一系列处理定义在图上信号的神经网络。 由于图可以模拟许多有趣的自然现象,因此它们被广泛应用于各个领域: - 计算生物学:预测强效 - 计算药理学:预测药物效果 - 流量预测:例如交通流量分析 - 推荐系统(用于电影、音乐等) 甚至在大型粒子加速器等领域也得到了应用,并且这个列表还在不断增长! GAT是一种空间(卷积)图神经网络的代表。由于CNN在计算机视觉领域取得了巨大成功,研究人员决定将其推广到图形处理中,从而诞生了如GAT这样的技术。
  • PyTorchGCN和GAT
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    本项目提供使用PyTorch实现的图卷积网络(GCN)与图注意力网络(GAT)的基础代码,适合初学者学习图神经网络的基本原理及应用。 在深度学习领域,图卷积网络(Graph Convolutional Networks, GCN)和图注意力网络(Graph Attention Networks, GAT)是处理图数据的重要工具。这两者都是图神经网络家族的成员,并广泛应用于社交网络分析、推荐系统、化学分子结构识别等多个场景中。本教程将通过PyTorch库,引导你入门GCN和GAT的实现。 ### 一、GCN简介 **1.1 图卷积的概念** GCN是由Kipf和Welling于2016年提出的一种基于图的深度学习模型,它借鉴了卷积神经网络的思想,并将这种操作应用到非欧几里得数据——即图上。通过传播节点特征并结合邻居节点的信息,GCN能够提取出更高级别的特征表示。 **1.2 GCN的数学表达** GCN的核心运算可以表示为对节点特征矩阵进行线性变换后,再使用邻接矩阵或拉普拉斯矩阵来传递信息的过程。在最简单的单层GCN中,这一过程可以用以下公式描述: \[ H^{(l+1)} = \sigma(\tilde{D}^{-\frac{1}{2}}\tilde{A}\tilde{D}^{-\frac{1}{2}}H^{(l)}W^{(l)}) \] 这里,\( H^{(l)} \) 表示第 \( l \) 层的节点特征矩阵;\( \tilde{A} \) 是邻接矩阵加上自环项得到的结果;\( W^{(l)} \) 代表权重矩阵;\(\sigma\) 则是激活函数。 ### 二、GAT简介 **2.1 图注意力机制** GAT引入了注意力机制到图神经网络中,允许模型根据节点的重要性来加权邻居节点的信息。相比GCN来说,这种能力使得GAT能够更好地捕捉不同节点之间的异质性特征。 **2.2 GAT的运算** 在计算过程中,GAT通过确定一对对节点间的注意系数,并用这些值来加权平均其邻接点的特征向量以得到更新后的表示。对于任意一个结点i来说,注意力权重通常依据以下公式进行计算: \[ e_{ij} = a(W_hh_i, W_hh_j) \] \[ \alpha_{ij} = \frac{\exp(e_{ij})}{\sum_{k\in N(i)} \exp(e_{ik})} \] 其中 \( h_i \) 和 \( h_j \) 分别表示节点i和j的特征向量;\( W_h\) 是线性变换权重矩阵;函数a通常采用LeakyReLU激活内积形式给出。最终,新的结点表示为: \[ h_i = \sigma\left(\sum_{j\in N(i)} \alpha_{ij}W_vh_j\right) \] 这里 \( a \) 表示注意力机制函数,\( W_v\) 则是另一个权重矩阵。 ### 三、PyTorch实现 在利用PyTorch来实现出这两种模型时,你需要完成以下步骤: 1. **构建图数据结构**:使用`torch_geometric`库创建图的数据结构,并包含节点特征和邻接矩阵等信息。 2. **定义模型**:根据GCN或GAT的数学表达式编写相应的前向传播函数。 3. **训练模型**:设置损失函数、优化器,然后进行反向传播更新参数值。 4. **评估模型性能**:在验证集上测试准确率等指标。 实际编程过程中可能会遇到图数据预处理、调整超参数以及并行计算等问题。这些问题的解决需要深入理解PyTorch和图神经网络的基本原理。 总结来说,GCN与GAT是用于处理图结构化数据的强大工具,并且通过使用PyTorch可以灵活地适应各种类型的建模需求。理解和掌握它们的工作机制对于在机器学习领域特别是图形计算方向上的研究工作是非常重要的。
  • 详尽注释AlexNetPyTorch
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    本项目提供了一个带有详细注释的AlexNet模型实现,使用PyTorch框架,并附有相应的数据集处理方法,便于深度学习研究与教学。 本段落提供了一个包含超详细注释的AlexNet模型、训练及预测代码示例,特别适合初学者使用。所有代码均在PyTorch环境中验证通过,确保易于理解和运行。
  • 有详尽注释ResNetPyTorch
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    本项目提供了一个详细的、带注释的ResNet模型代码库,并附有测试所需的数据集。所有内容均使用PyTorch框架实现,旨在帮助初学者理解深度学习网络结构和实践应用。 本段落提供了一个包含详细注释的ResNet模型、训练及预测代码示例,特别适合初学者使用。所有代码都在PyTorch环境中进行了测试并可直接运行。每一行代码都有详细的解释,帮助新手更好地理解和学习深度学习中的经典网络结构和相关操作。
  • MTAD-GAT与源分析
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    本文章对MTAD-GAT模型进行深入解析和代码层面的剖析,旨在帮助读者理解其工作原理和技术细节。通过详尽讲解和示例代码,指导开发者掌握该模型的应用及优化方法。 MTAD-GAT的实现:通过图形注意网络进行多元时间序列异常检测 这是草稿内容。 预测和重新构建模式都可以分别训练。单独使用预测可以提供良好的结果,但仅依靠重建的效果不如当前方法好。虽然我计划合并培训作品,但我尚未执行此操作。 run_mode标志用于指定模型是在FORECASTING(预测)、RECONSTRUCTING(重构)还是BOTH中进行训练或预测。 如果在FORECASTING模式下进行了训练,则对其他模式的预测是没有意义的;同样地,在RECONSTRUCTING模式下的情况也是如此。剪辑渐变设置为0.1,学习速率为5e-6。d3是18,即SMD中的38个特征的一半。 在时间序列中每个时间点上都使用重建pdf而不是仅限于最后一个时间点,并且异常日志pdf应被定义为“-重建日志pdf”,而非“1-pdf”。 为了计算综合得分,按照上述说明来计算异常log pdf。预测平方差和重构误差也被考虑进来。
  • PyTorch图卷积网络(包括GCN、GAT、Chebnet)在交通流量预测中完整源
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    本研究利用PyTorch框架下的三种图卷积模型(GCN,GAT,ChebNet),探索它们在交通流量预测的应用价值,并提供详尽的代码和数据集供参考学习。 图卷积网络(GCN、GAT、Chebnet)在交通流量预测中的PyTorch实现 ### 依赖库: - Pytorch - Numpy - Pandas - Matplotlib ### 数据集实例: 这些数据由加州交通局性能测量系统(PEMS-04)收集。 - 检测器数量:307个 - 特征包括:流量、占用率和速度。 #### 探测数据分析: 1. 有三个特征,分别是流量、占有率和速度。首先对数据分布进行可视化分析。 2. 运行代码文件 `data_view.py` 来查看数据的分布情况。 3. 每个节点(检测器)具有三个特征属性,但其中两个特征的数据变化不大,因此我们只选取第一个维度的流量作为主要预测依据。 #### 读取数据集: 在`traffic_dataset.py` 文件中提供了 `get_adjacent_matrix` 和 `get_flow_data` 函数来分别读取相邻矩阵和流量数据。 ### 模型训练: 模型训练相关代码位于文件 `traffic_predi` 中。
  • LSTM多输多输出负荷预测(Pytorch
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    本项目采用Pytorch框架,利用长短期记忆网络(LSTM)进行电力负荷的多输入多输出预测,并提供配套的数据集以供训练和测试。 使用LSTM进行多输入多输出的负荷预测,并且在PyTorch环境下可以直接运行代码。已有数据可供使用。
  • GAT:图注意力网络在此
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    本项目提供了一个详细的图注意力网络(GAT)实现,旨在帮助研究者和开发者理解和应用这一先进的图神经网络模型。 这段文字是关于图注意力网络的代码实现。
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  • PyTorchGraph Attention Networks (GAT) 图自注意力网络
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    本项目提供了一个基于PyTorch实现的图注意力网络(GAT)框架,适用于图结构数据上的节点分类任务。代码简洁易懂,并包含详细的文档和示例。 GAT(图注意力网络)具有以下特点:1. 使用了attention机制来描述邻接节点对于目标节点的重要性;2. 采用了邻接矩阵作为mask;3. 引入了多个attention heads,以扩展attention机制的通道宽度。