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AGNES算法(Python)用于层次聚类。

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简介:
层次聚类算法(AGNES),在Python环境中得以实现,是一种用于数据聚类的强大工具。其核心机制是通过分析不同类别数据点之间的相似性程度,从而构建出一棵具有层级结构的嵌套聚类树。在生成的聚类树中,各个原始的数据点被放置在树的底层分支,而树的顶端则代表着一个最终的聚类根节点。AGNES算法尤其适用于那些需要处理大量簇,并且存在连接约束等复杂场景的应用。

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客服
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  • Python中的(AGNES)
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    简介:AGNES是一种层次聚类方法,用于Python中基于相似性或距离对数据进行分组。该算法自底向上逐步合并最接近的数据点群,形成层级结构。 层次聚类(AGNES)算法是聚类算法的一种实现方式。该方法通过计算不同类别数据点间的相似度来构建一棵有层次的嵌套聚类树。在这棵树里,最底层代表原始的数据点集合,而顶层则是一个包含所有簇的根节点。当处理需要大量簇或存在连接限制的情况时,AGNES算法是一种常用的解决方案。
  • AGNES.zip
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    AGNES层次聚类算法是一种自底向上的聚类方法,通过不断合并相近的数据点或数据点组形成层级结构,适用于数据分析和模式识别。此压缩包包含相关代码及文档。 我用C++实现了一个AGNES凝聚层次聚类算法,并提供了一个完整的VS2010工程文件。代码包含测试数据、良好的编程风格以及详细的注释,可以运行并得到正确结果。
  • C/C++实现AGNES
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    本项目采用C/C++语言实现了AGNES(Agglomerative Nesting)层次聚类算法,通过自底向上的策略逐步合并数据点以构建层级簇结构。 AGNES聚类法的基本算法部分使用结构体数组来存放测试数据,并利用LIST容器及迭代器辅助进行聚类操作。代码中的注释采用UTF-8编码格式,在Linux环境下可以直接查看,而在Windows系统中需要先转换文件的编码格式以正常显示。
  • BIRCH
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    BIRCH层次聚类算法是一种高效的数据聚类方法,特别适用于大规模数据集。通过构建一个能够容纳大量信息的树状结构,它能够在一次或多次扫描数据后生成高质量的簇摘要,从而有效减少计算复杂度和空间需求。 **BIRCH聚类算法详解** BIRCH(Balanced Iterative Reducing and Clustering using Hierarchies)是一种高效且可伸缩的层次聚类方法,特别适用于大规模数据集处理。该算法的主要特点在于其分层构建过程和对局部特征的有效表示,这使得它在处理大数据时具有较高的时间和空间效率。 ### 一、BIRCH算法的基本概念 1. **局部特征直方图(CLUSTER FEATURE)**:BIRCH的核心是使用CLUSTER FEATURE (CF)。这是一种紧凑的数据结构,用于存储子样本集的信息。每个CF包含两个主要部分:样本数量(N)和中心化及规范化累积向量(CS),通过不断合并子样本集,CF可以逐步表示更大的聚类。 2. **层次结构的构建**:BIRCH算法在迭代过程中逐渐建立层级结构。每次新数据点到来时,会与现有的CF进行比较,并根据相似性来决定是将该数据点加入到一个已存在的CF中还是创建一个新的CF。这一过程确保了每个节点的数据分布较为平衡,从而避免了一个单独的节点过于庞大导致内存消耗过多的问题。 3. **存储效率**:BIRCH使用固定大小的CF结构来存储数据信息,即使面对庞大的数据集也能有效控制内存占用情况,这使得它在大数据场景下具有优异的表现能力。 ### 二、BIRCH算法流程 1. **初始化阶段**: 开始时每个样本作为一个独立的CLUSTER FEATURE (CF)。 2. **合并过程**:当新来的样本到达时,会与现有的CF进行对比。如果该样本和某个已存在的CF之间的距离小于预设阈值,则将此样本添加到对应的CF中;反之则创建一个新的CF并加入这个新的数据点。 3. **更新CLUSTER FEATURE**: 每次合并操作后都需要对相应的N(数量)以及CS(累积向量)进行修正以反映最新的信息状态。 4. **层次构建**:重复上述的步骤直到所有样本都被处理完毕,最终会形成一棵由CF节点构成的树状结构即为所求得的层级体系。 5. **生成最终聚类结果**: 通常需要借助其他类型的聚类算法(例如谱聚类或DBSCAN)来对生成出来的层次化模型进行剪枝操作以获得最佳效果。这是因为BIRCH本身并不能直接确定最合适的簇数。 ### 三、BIRCH的优点与缺点 **优点**: 1. **高效性**: BIRCH无需全局扫描数据,只需顺序读取即可完成处理任务,大大降低了计算成本。 2. **可扩展性强**: 固定大小的CF使得它能够轻松应对大规模的数据集挑战。 3. **内存友好型**: 通过避免一次加载所有原始数据的方式减少了对系统资源的需求。 **缺点**: 1. **聚类质量较低**: 相比于其他算法(如K-Means或谱聚类),BIRCH生成的最终结果可能不够理想。 2. **依赖后续剪枝策略**: BIRCH构建出来的层次结构需要通过额外的方法来完成最后一步优化,这就增加了复杂性和不确定性。 ### 四、应用与扩展 BIRCH算法在数据挖掘、推荐系统及图像分析等多个领域都有广泛的应用。由于其高效的特性,它常常被用作预处理步骤为后续的深入分析提供初步聚类结果。此外,也有研究人员对BIRCH进行了改进和优化(如调整CF结构或合并策略),以期进一步提高聚类准确性和效率。 总结来说,凭借独特的数据表示方式与层次构建方法,BIRCH成为了一种有效工具来处理大规模的数据集问题;尽管其在某些方面的表现可能不如同类算法优秀,但它的高效性以及对内存管理的优势使其成为一个值得考虑的选择。
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    层次式聚类是一种通过构建分层树状结构(称为 dendrogram)对数据对象进行分类的方法,依据相似性逐步合并或分割数据集。 关于层次聚类的一些算法的介绍,如果能够理解的话可以进一步探讨。不过目前提供的内容有些混乱,建议明确表达想要讨论的具体算法或者问题点。
  • BIRCH
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    BIRCH层次聚类算法是一种高效的 clustering 方法,特别适用于处理大规模数据集。它通过构建集群特征树来识别数据中的密集区域,并形成簇结构。 Zhang T, Ramakrishnan R, Livny M. BIRCH: A new data clustering algorithm and its applications[J]. Data Mining and Knowledge Discovery, 1997, 1(2): 141-182. 这是一篇不错的英文文献。
  • OpenCV的AGNES实现
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    本项目采用OpenCV库,实现了AGNES层次聚类算法,应用于图像处理和数据分析领域,有效提升数据分类准确性与效率。 关于OpenCV的配置,请自行查阅相关资料。由于本项目是基于OpenCV开发的,因此输入数据应为Mat格式特征数据,并按行排列;返回的数据则为标签列表形式的Mat矩阵。若要应用于一般数据场景,则可适当调整代码并封装成类以供使用。假设OpenCV已正确配置,程序即可直接运行。
  • 代码
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    这段代码实现了层次聚类算法,能够根据数据间的相似性或距离进行分层聚合分析,适用于无监督学习场景下的数据分类与可视化。 我完成了基于熵特征的层次聚类分析,并进行了可视化展示。此外,我还提供了一个数据集用于支持这项研究。
  • 使Python实现K-means、PCA降维和
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    本项目采用Python编程语言,实现了K-means聚类、主成分分析(PCA)降维及层次聚类三种经典数据挖掘技术。通过这些方法可以有效地对大量复杂数据进行分类与简化处理。 中科大2019年春季AI实验二涵盖了Kmeans算法、PCA算法和层次聚类算法。
  • :基 Ruby 的 agglomerative_clustering
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    层次凝聚聚类算法是使用Ruby语言实现的一种数据分析方法,通过递归地将单个数据对象合并到更大的群集,形成层级结构的数据分类系统。 凝聚聚类分层算法可以处理三维点集,并根据欧几里德距离将这些点分为最近的 k 个集群。这种算法支持四种不同的链接方式:单链(基于两个簇间最近两点的距离)、全链(基于最远两点的距离)、平均链(基于所有点之间的平均距离)和中心链(以各簇中心为基准)。为了使用此功能,首先需要在 Gemfile 中添加以下行: ```ruby gem agglomerative_clustering ``` 然后执行 `bundle install` 命令。或者直接通过命令安装: ```shell $ gem install agglomerative_clustering ``` 有关如何使用的示例,请参阅 cluster.rb 文件,待我有空时会在此处添加更多说明。要为项目贡献代码,请创建一个新分支(例如 `git checkout -b my-new-feature`),提交您的更改,并进行推送。