Advertisement

基于Transformer-Unet的内窥镜图像语义分割代码分享【含代码和数据集】

  •  5星
  •     浏览量: 0
  •     大小:None
  •      文件类型:ZIP


简介:
本项目提供基于Transformer-Unet架构的内窥镜图像语义分割代码及数据集。适用于医疗影像分析与疾病诊断,促进人工智能在医学领域的应用研究。 内窥镜图像数据集包括腹壁、肝脏、胃肠道、脂肪、抓握器、结缔组织、血液、胆囊管、L 钩电烙术(仪器)、胆囊、肝静脉以及肝韧带等部分。 参数设置如下:优化器为AdamW,学习率衰减策略采用余弦退火算法,损失函数使用交叉熵。 1. `train` 脚本会生成训练集和验证集的loss曲线、iou曲线、学习率变化曲线,并记录训练日志。此外,该脚本还会提供数据集可视化图像以及最终与最佳权重文件。 2. `evaluate` 验证脚本用于评估模型性能,计算测试集中各项指标如iou、召回率(recall)、精确度(precision)及像素准确率等。(注意:训练集用于网络拟合,验证集用来调整参数设置,而测试集则用以最终评估模型效果。) 3. `predict` 脚本负责推理图像处理,并生成目标标签(gt)及其与原图叠加后的掩膜图像。 代码中附有详细注释,便于用户理解并自行下载查看;若需训练自有的数据集,请参考README文件中的指示进行傻瓜式操作。

全部评论 (0)

还没有任何评论哟~
客服
客服
  • Transformer-Unet
    优质
    本项目提供基于Transformer-Unet架构的内窥镜图像语义分割代码及数据集。适用于医疗影像分析与疾病诊断,促进人工智能在医学领域的应用研究。 内窥镜图像数据集包括腹壁、肝脏、胃肠道、脂肪、抓握器、结缔组织、血液、胆囊管、L 钩电烙术(仪器)、胆囊、肝静脉以及肝韧带等部分。 参数设置如下:优化器为AdamW,学习率衰减策略采用余弦退火算法,损失函数使用交叉熵。 1. `train` 脚本会生成训练集和验证集的loss曲线、iou曲线、学习率变化曲线,并记录训练日志。此外,该脚本还会提供数据集可视化图像以及最终与最佳权重文件。 2. `evaluate` 验证脚本用于评估模型性能,计算测试集中各项指标如iou、召回率(recall)、精确度(precision)及像素准确率等。(注意:训练集用于网络拟合,验证集用来调整参数设置,而测试集则用以最终评估模型效果。) 3. `predict` 脚本负责推理图像处理,并生成目标标签(gt)及其与原图叠加后的掩膜图像。 代码中附有详细注释,便于用户理解并自行下载查看;若需训练自有的数据集,请参考README文件中的指示进行傻瓜式操作。
  • Kvasir-Sessile
    优质
    Kvasir-Sessile数据集是一套专为训练和评估内窥镜图像中息肉与扁平病变自动检测及分割算法设计的高质量医学影像资料库。 《kvasir-sessile内窥镜图像分割数据集:深度学习在医学图像分析的应用》 内窥镜图像分析是现代医学中的重要工具之一,它能够帮助医生非侵入性地观察人体内部结构。Kvasir-Sessile 内窥镜图像分割数据集正是一个专门用于这一领域的专业资源库,其中包含的mask 数据为研究人员提供了宝贵的训练和测试素材,从而支持机器学习和深度学习算法在医学图像处理中的应用。 该数据集的核心任务是进行图像分割,这是计算机视觉领域的一个关键问题。它旨在将一幅图中的不同区域或物体精确地划分出来。在医学成像分析中,这种技术能够帮助医生识别病灶、肿瘤等重要特征,并提高诊断的准确性和效率。Kvasir-Sessile 数据集专门针对 sessile 息肉进行研究,这是一种常见的结肠病变,在早期发现和治疗上至关重要。 数据集中包含的数据类型包括内窥镜图像以及医学成像等多个关键概念。这些标注过的图像集合能够帮助研究人员训练并验证模型的准确性。此外,该数据集强调了其在消化道疾病检测中的应用,并且表明这不仅是一个普通的图像处理问题,还涉及到了生命科学的知识和应用。 研究者通常会利用深度学习模型(如U-Net、Faster R-CNN或Mask R-CNN等)来进行分割任务。这些模型能够通过大量标注的训练数据来学习特征表示,并在新的未见过的数据上进行预测生成与真实情况相匹配的结果。Kvasir-Sessile 数据集提供的mask 可以作为深度学习算法的目标,通过反向传播优化网络权重实现对sessile 息肉自动检测和分割。 为了充分利用这个数据集,研究人员需要执行预处理步骤(例如图像归一化、噪声去除以及对mask 的处理),确保模型能够有效地捕捉到关键信息。同时还需要选择合适的评估指标如IoU 和Dice 系数来衡量预测结果与真实情况的吻合度。 此外,该数据集中多样化的内窥镜图像是一个重要的优势因素,这有助于训练出具有泛化能力更强的深度学习模型,并且避免过拟合问题的发生。研究人员还可以通过诸如旋转、翻转和裁剪等技术进一步增加训练集规模以提高模型在实际应用中的稳健性。 总的来说,Kvasir-Sessile 内窥镜图像分割数据集为医学成像分析领域的研究提供了有力的支持工具。结合深度学习技术的应用前景广阔,并有望推动医疗诊断自动化进程并提升临床效率,从而更好地服务于人类健康事业的发展需求。随着未来更多高质量的数据集出现以及不断进步的深度学习模型发展,在医学成像领域将会有更多的突破和创新成果问世。
  • PyTorchUNet汽车训练
    优质
    本项目提供了一个使用PyTorch实现的UNet模型,专门用于对汽车图像进行语义分割。包括预处理后的汽车图像数据集和详细的训练代码,旨在促进自动驾驶领域的研究与开发。 U-Net是一种专为图像分割设计的卷积神经网络(CNN)架构,由欧洲的一位计算机视觉博士生Olaf Ronneberger及其团队在2015年提出。最初用于生物医学领域的医学图像分割任务,后来被广泛应用于其他领域。 该模型的名字来源于其独特的U形结构:编码器部分负责捕获输入图像的全局信息,并逐渐降低空间分辨率;而解码器则通过上采样操作逐步恢复细节,同时保持高阶特征的信息。这种设计使得网络能够更好地理解并保留局部和整体之间的联系,在像素级语义分割任务中表现出色。 U-Net的一个关键特性是采用了跳跃连接(skip connections),它将编码器中的某些层与解码器对应位置的层相连,从而促进了低层次细节信息与高层次上下文特征的有效结合。这种机制增强了模型对图像局部结构的理解能力,并提高了整体分割精度和鲁棒性。 总体而言,U-Net通过其独特的架构设计,在处理复杂的医学影像和其他类型的图像数据时展现出了卓越的能力。
  • Swin-Transformer
    优质
    本研究提出了一种基于Swin-Transformer模型的创新方法,专门针对图像和语义分割任务,结合了卷积神经网络与变换器架构的优势,显著提升了复杂场景下的目标识别精度。 可以使用自己的数据集进行训练。如果选择使用自定义的数据集,则需要先将标签转换为VOC格式,相关代码位于tools文件夹下的voc.py中。具体流程是通过train脚本训练网络模型,并利用prediction脚本来输出分割结果。图片应放置在data文件夹下,但请注意更换数据集时需确保图像均为灰度图。 初始任务主要针对医学图像的分割问题进行设计,但也适用于其他类型的图像处理工作。该系统包含滑窗操作功能,采用具有层级化设计特点的Swin Transformer模型。具体来说,在滑窗操作中包括不重叠的local window和带有一定重叠区域的cross-window机制。通过将注意力计算限制在一个窗口内的方式,一方面引入了CNN卷积操作中的局部性特征,另一方面也有效减少了计算资源的需求量。
  • PyTorchUnetMRI肝脏.zip
    优质
    本资源提供基于PyTorch框架和Unet模型的MRI肝脏图像分割代码与相关数据集,适用于医疗影像处理研究与开发。 基于Pytorch+Unet进行MRI肝脏图像分割的源码及数据集需要以下环境配置:Python >= 3.7, opencv-python, Pillow == 7.0.0, torch == 1.4.0, torchsummary == 1.5.1, torchvision == 0.4.2。
  • Unet-MobileNet腹部肝脏实战完整等】
    优质
    本项目提供了一套基于Unet-MobileNet模型进行腹部肝脏图像自动分割的实战教程与代码实现,包含详尽的数据预处理、模型训练及评估步骤,并附有开源代码和数据集。 基于Unet-Mobilenet的腹部肝脏图像分割实战代码提供了完整的数据集及训练脚本,并增加了新的评估指标如loss、iou、dice、recall以及precision及其对应的平均值(mean)。此外,还生成了各类别的曲线图与平均值的曲线图(针对训练集和验证集)。 该项目使用LIver数据集进行模型训练。经过100个epoch后,验证集中各指标如下: - 精确率 (Precision): [0.9846, 0.9590] - 召回率 (Recall): [0.9958, 0.8642] - IoU: [0.9805, 0.8334] - Dice系数: [0.9901, 0.9092] 平均值为: - 平均精确率 (Mean Precision): 0.9718 - 平均召回率 (Mean Recall): 0.9300 - 平均Dice系数 (Mean Dice): 0.9497 - 平均IoU: 0.9070 如需使用自己的数据集进行训练,可以参考项目中的readme文件。
  • SwinTransformer、ResNetUnetST-Unet网络实现
    优质
    本项目实现了结合Swin Transformer与ResNet架构的ST-Unet语义分割模型,并提供了详细的代码及文档支持。 ST-Unet是一种结合了Swin Transformer、ResNet和Unet的语义分割网络。原论文提供的源码较为复杂且存在不少错误与资源缺失问题。我对此进行了整理和完善,使其更加通俗易懂,并补充了一些不足之处。这份代码适合初学者进行语义分割相关研究或实践使用。
  • PyTorchUNet模型及
    优质
    本项目采用PyTorch框架实现经典UNet语义分割模型,并提供详细的代码和文档。适用于医学图像处理等领域研究与应用开发。 模型在FloodNet数据集上进行了训练,mIOU达到了0.83左右。为了训练自己的数据集,建议将输入的训练图像切分为384x384的小图片后再进行模型训练。推荐使用标准UNet架构,并按照以下方式来训练你自己的模型: 首先,在`train.py`文件中修改数据集地址为你自己的文件夹路径。 然后可以采用如下命令行参数进行训练: ``` python train.py --epochs 20 --batch-size 16 --learning-rate 2e-4 --scale 1 --validation 0.1 --classes 10 --amp ``` 其中,`--amp`表示使用半精度训练模式。而`--scale`参数用于在图片已经裁剪为384x384大小的情况下不需要再进行缩放处理。
  • Swin-Unet-Transformer网络
    优质
    本研究提出了一种基于Swin-Unet-Transformer架构的新型二分类语义分割模型,旨在提高复杂场景下图像细节识别与分割精度。 1. 增加了数据加载部分,并优化了二分类的损失函数。 2. 添加了必要的中文注释以便更好地理解代码。 3. 附带了自己的数据集以供测试使用。 4. 如有问题,欢迎随时联系交流。