SourceTracker2：Sourcetracker2

简介：
SourceTracker2是一款用于微生物源解析的强大工具。通过分析微生物群落数据，它能够追踪样本中的微生物来源，广泛应用于生态学、医学和环境科学等领域。 SourceTracker2 是在最初描述 SourceTracker 的论文基础上开发的。使用此软件包的研究人员应当引用原始的 SourceTracker 论文，并且对于即将发布的 SourceTracker 2 进行适当的引用。 访问 SourceTracker 2 功能可以通过命令行（CLI）或 Python API 实现。需要复制 SourceTracker 1 功能的用户应使用 CLI 命令 `sourcetracker2 gibbs`，而方案设计者则被建议采用 API 方式（通过暴露 `gibbs` 函数）。帮助文档分为几个部分，并且详细介绍了如何使用 API 和 CLI。 档案格式和命令行选项的具体说明，请参阅 `sourcetracker2 gibbs --help` 提供的帮助文档。此脚本需要功能特征X样本表以及示例元数据（传统上是映射文件）。特征X样本表是一个 n 行 m 列的表格，其中每一行代表一个样本，每列代表一种特性或操作单元（OTU）计数。