期权MATLAB代码-Hippovol：自动沿纵轴划分MRI海马体体积

简介：
Hippovol是一款用于自动分析MRI图像中海马体体积的MATLAB程序。该工具利用期权理论优化算法，在纵向轴上精准分割海马体，便于科研人员进行相关疾病研究。 预算的MATLAB代码旨在自动分割MRI图像中的海马体（沿其纵轴）。该代码最初是为了从大脑图像中手动或使用如Freesurfer或FSL等社区工具分割出海马体而创建的。我们正在更新此代码，如果有紧急需求，请联系Garikoitz Lerma-Usabiaga。 尽管开发重点在于海马体自动分割，但此代码同样适用于其他C形细长结构（例如Call体）。该工具已被用于生成以下论文中的所有数据：G. Lerma-Usabiaga, Iglesias, JE, Insausti, R., Greve, D., and Paz-Alonso PM (2016). 人海马沿其纵轴的自动分割。Human Brain Mapping。 要求与安装： - 克隆此存储库或将.zip文件下载并添加到MATLAB路径中。 - 将$FREESURFER_HOME/matlab添加至您的路径。 - 下载geom3d() 并将其加入到您的路径。 - 默认版本需要“优化工具箱”。如果没有，可以免费安装L-BFGS-B，并在设置选项中进行更改。