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dcm2niix是一个DICOM到NIfTI转换工具。

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简介:
dcm2niix 的核心目标是实现神经影像数据的转换,具体是将DICOM格式的数据转化为NIfTI格式。 提供的网页包含了开发源代码的最新稳定版本,支持在Linux、MacOS和Windows操作系统上编译运行。 此外,该软件还提供了完整的用户手册,以文档的形式呈现。 该软件采用开源许可协议,主要依赖于 BSD 许可证来覆盖大部分代码。 一些组件则处于公共领域(例如 nifti *。* 和 miniz.c),另一些则使用 MIT 许可证(ujpeg.cpp)。 如果您希望了解更全面的许可信息,请查阅 license.txt 文件。 通常情况下,dcm2niix 在 macOS、Linux 和 Windows 系统上能够顺利运行,无需安装额外的软件。 然而,如果使用 dcm2niix 生成 GZ 压缩的图像文件,并且您已经安装了 pigz 工具包,则可以获得更快的转换速度。 您可以通过下载针对您操作系统编译的版本来获取 dcm2niix 和 pigz 的软件包。 在图像转换和压缩领域,存在多种存储和压缩图像数据的技术方案,这些方案统称为 DICOM 存储/压缩方法。 为了方便用户配置和扩展支持更多格式的功能,详细信息已包含在文档中。 基本代码集成了对原始...的实现.

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客服
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  • dcm2niix: DICOMNIfTI
    优质
    DCM2NIIX是一款高效便捷的软件工具,专门用于将医学影像文件格式DICOM转换为NIfTI格式,便于神经影像学数据处理与分析。 dcm2niix 是一款用于将神经影像数据从 DICOM 格式转换为 NIfTI 格式的工具。该软件的最新稳定版本可以在多个操作系统(包括 Linux、MacOS 和 Windows)上编译并提供下载。完整的用户手册也一同发布。 这款开源软件主要遵循 BSD 许可证,部分代码则属于公共领域或采用 MIT 许可证授权(例如 nifti*.*, miniz.c, ujpeg.cpp)。具体详情请参阅 license.txt 文件。 dcm2niix 通常可以在 macOS、Linux 和 Windows 系统上直接运行而无需额外安装其他软件。然而,如果用户希望使用该工具创建 GZ 压缩图像,则建议先安装 pigz 软件以获得更佳的压缩性能和速度。可以通过官方渠道获取针对不同操作系统的 dcm2niix 及其配套的 pigz 版本。 此外,DICOM 格式提供了多种存储及压缩医学影像数据的方法。dcm2niix 支持启用不同的选项来兼容更多种类的数据格式,并能高效地进行图像转换与压缩处理。
  • DCM2NIIX和DCM2NIINIfTI.zip
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    本资源包提供了一个便捷工具,用于将医学影像文件从DCM(DICOM)格式或DCM2NII格式转换为NIfTI格式。此工具旨在简化跨平台的数据处理流程,并支持研究和临床应用中的高效数据交换与分析。 dcm2niix 是一种用于将神经影像数据从 DICOM 格式转换为 NIfTI 格式的工具。开发的源代码可以在 Linux、macOS 上编译,并且最近稳定版本已经包含在 MRIcroGL 中。
  • DICOMNIFTI的医学图像格式
    优质
    这款DICOM转NIFTI的医学图像格式转换工具旨在为医疗专业人士提供高效、便捷的服务。它能够快速准确地将DICOM格式的医学影像数据转换成NIFTI格式,便于进行进一步的数据分析和处理,大大提高了临床科研的工作效率。 医学图像格式转化软件(DICOM转NIfTI)可以方便地将不同格式的医学影像数据进行转换,以便于研究或临床应用中的进一步处理与分析。这类工具通常支持批量操作,并且能够保持原始图像的数据完整性及元信息准确无误地传递到目标文件中。
  • TiffToDicom:从TIFFDICOM-开源
    优质
    TiffToDicom是一款用于将医学图像格式TIFF转换为DICOM的专业软件,它能够帮助用户轻松实现不同图像文件之间的兼容性。作为一款开源项目,欢迎有兴趣的人士参与贡献和改进。 这不是最终版本,而是正在进行的工作。我发布代码只是为了帮助您。随着项目的积极开发,将来还会有进一步的更新。
  • DICOM至JPG
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    DICOM至JPG转换工具是一款专业的图像处理软件,能够高效地将医学影像存储与通信(DICOM)格式文件转换为JPEG格式,便于医生和研究人员查看及分享。 DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine)是一种用于存储、传输及查看医学图像的标准化格式,在医疗环境中广泛应用。这种格式包含大量元数据,包括患者信息、诊断报告以及详细的成像技术参数等。 MFC(Microsoft Foundation Classes)是微软提供的C++类库,旨在简化Windows应用程序中窗口、菜单和对话框等用户界面元素的设计与创建过程。 DICOM转JPG工具是一款基于MFC开发的应用程序,其核心功能在于将医学图像从DICOM格式转换为JPEG格式。JPEG作为一种常见的有损压缩图像文件类型,在网络传输及存储方面具有显著优势,因其较小的文件大小而广受欢迎。 在实现这一工具时,首先需理解DICOM文件结构及其头部信息解析方法来获取像素数据和元数据。随后进行解码步骤以提取原始图像数据,并可能需要处理RLE(行程长度编码)或JPEG压缩算法,因许多DICOM图像存储时已采用这些压缩技术。 转换过程中还包括色彩空间调整、尺寸缩放等图像处理操作,确保转换后的JPEG文件质量满足预期标准。MFC中的CImage类支持加载和保存图片,并可执行必要的图像编辑任务。用户还可以通过设定不同的压缩级别,在保持高质量的同时控制输出文件的大小。 从界面设计角度看,该工具利用了MFC提供的创建对话框、菜单及按钮等功能,使用户能够方便地选择输入DICOM文件、配置转换参数并启动转换流程。同时可能提供预览功能以供检查确认图像效果。 综上所述,DICOM转JPG工具集成了医学图像处理技术、格式转换知识以及Windows应用程序界面设计等多个方面的内容。它的开发不仅需要深入了解MFC库的应用及DICOM标准解析方法,还涉及到JPEG编码技术和一系列复杂的图像编辑操作。对于开发者而言,这是一个既具挑战性又富有意义的任务。
  • 医学影像处理中的DICOMNIfTI-GZ文件格式软件
    优质
    本软件旨在实现医学影像数据从DICOM至NIfTI-GZ格式高效、准确的转换,助力科研人员及医生便捷获取适用于多种分析工具的数据格式。 将磁共振医学文件格式转换为NIFTI协议中的nii或niigz格式,用于医学影像深度学习的数据处理。
  • 西门子 DICOM 及排序至 NIfTI:将西门子 MRI 的 DICOM 数据NIfTI 格式,并进行匿名处理与排序...
    优质
    本工具用于转换并整理医学影像数据,专门针对西门子MRI设备生成的DICOM文件,将其高效地转化为NIfTI格式,同时确保患者信息的安全性。 该程序提供了GUI(dicom_sort_convert_main.m)和命令行输入(example_dscm_call.m),用于选择输入和输出目录并设置选项。主要功能包括:i) 将西门子MR扫描仪(IMA)数据分类到不同的文件夹中,删除患者姓名,并进行轻微的匿名处理(仅对PatientName字段进行处理,但不涉及出生日期、性别或PatientID等信息);ii) 转换为单个NIfTI格式(.nii)或两个文件(NIfTI .img和.hdr),每次扫描一个。对于复杂的扫描,程序会重新组织数据以适应最多六个维度的NIfTI结构(时间点、回波、RF通道、相位/幅度等)。此外,还会将DICOM头信息以及西门子特有的头部信息写入到text_header.txt文件中;iii) 列出所有执行过的扫描(在scan_list.txt文件中),包括最相关的参数,并且这些输出可以根据需要进行自定义。
  • dcmrtstruct2nii: DICOM RT-Struct 遮罩
    优质
    DCMRTSTRUCT2NII是一款专为医学影像处理设计的软件工具,用于将DICOM格式的放射治疗结构(RT-Struct)文件高效转化为NIfTI标准格式。此程序简化了数据在不同研究和临床环境中的应用与共享过程,支持科研人员及医疗专家对肿瘤及其他病灶进行精确分析和三维重建。 dcmrtstruct2nii 是将 DICOM RT-Struct 转换为 nii 格式的遮罩的一种简单方法。如果您的 RT-Struct 包含孔洞,这种方法可能无法正常工作。RT 结构必须在原始 DICOM 切片的范围内。光栅化是在逐个切片的基础上完成的,并且当前不支持跨切片插值。 目前,RT结构被视为多边形并通过逐个切片地进行栅格化处理。如果您提供一些代码来执行此操作或发送拉取请求,我们将很高兴添加其他栅格化算法(例如可以处理多边形中孔洞的算法)以及支持跨切片之间蒙版插值的方法。 输入文件格式 需要将 DICOM 和 RT-Struct 文件解压缩到目录中。当前这是读取输入文件的唯一方法。 CLI 工具安装和显示工具帮助可以通过 pip 安装并使用命令行查看。
  • DICOM图像器 - dicom2image(filename, imagetype): 将任何DICOM...
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    简介:dicom2image(filename, imagetype) 是一个用于将DICOM格式文件转换为指定类型图像(如PNG、JPEG)的实用工具,便于医学影像数据可视化。 %% 打开DICOM数据并将其保存为图像文件 函数 dicom2image(filename, imagetype) % Dicom 到图像转换器 % 作者:兰斯·蒂诺 % 版本:0.2 %% 输入错误检查 %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%输入姓名%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% 如果 ~exist(filename,var) % 文件不存在 error(需要一个有效的文件名!); %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% 结束 %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%图像类型%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% 如果~ischar(imagetype) || isempty(strsplit({png,bmp,jpg,tiff,gif},imagetype)) error([无效的输出图片格式。请使用 png, bmp, jpg, tiff 或 gif]); %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%结束
  • 地图坐标的
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    这是一款便捷的地图坐标转换工具,支持多种常用坐标系之间的快速切换与精准转换,满足用户在地理信息处理中的各种需求。 该系统主要具备三大功能:地理编码查询、坐标转换以及POI(兴趣点)查询。这些功能能够满足一般的地理数据分析需求。需要注意的是,部分功能的使用需要用户进行注册。