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医学生存分析

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简介:
《医学生存分析》一书深入探讨了医学领域中的生存数据分析方法,旨在帮助临床医生和研究人员理解并应用这些统计技术来评估治疗效果、预测患者预后及疾病进展。书中结合大量实例与案例研究,为读者提供了实用的操作指南和技术解析。 在这个项目中,我们利用生存数据及线性与非线性技术的结合来构建风险模型。该数据集收录了原发性胆汁性肝硬化(PBC)患者的生存信息。PBC是一种肝脏自身免疫性疾病,由胆汁在肝脏内堆积导致的小胆管损伤引起。我们的目标是探究不同因素如何影响患者的生命长度。项目涵盖的主题包括考克斯比例风险模型的解释、考克斯模型的应用以及生存模型评估方法,此外还涉及随机生存森林和个人生存函数等内容。

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    《医学生存分析》一书深入探讨了医学领域中的生存数据分析方法,旨在帮助临床医生和研究人员理解并应用这些统计技术来评估治疗效果、预测患者预后及疾病进展。书中结合大量实例与案例研究,为读者提供了实用的操作指南和技术解析。 在这个项目中,我们利用生存数据及线性与非线性技术的结合来构建风险模型。该数据集收录了原发性胆汁性肝硬化(PBC)患者的生存信息。PBC是一种肝脏自身免疫性疾病,由胆汁在肝脏内堆积导致的小胆管损伤引起。我们的目标是探究不同因素如何影响患者的生命长度。项目涵盖的主题包括考克斯比例风险模型的解释、考克斯模型的应用以及生存模型评估方法,此外还涉及随机生存森林和个人生存函数等内容。
  • 之道:Python中的
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    本书《生存之道:Python中的生存分析》深入浅出地讲解了如何运用Python进行生存数据分析,涵盖基础概念、常用库及实战案例。适合数据分析爱好者和专业人士阅读学习。 生存分析最初由精算师和医学界开发并广泛应用。其主要目的是探讨为何事件现在发生而不是延迟到未来(例如死亡或疾病缓解)。对于关注寿命测量的研究人员来说,这一方法非常有用:他们可以探究哪些因素可能影响人的寿命。除了在医学和精算科学中的应用外,生存分析还有许多其他有趣的应用场景,如SaaS供应商可能会关心订阅用户的留存时间或是首次采取某些行动的时间点;库存缺货则可视为对商品真实需求的评估事件;社会学家关注政党的生命周期、人际关系或婚姻关系等。此外,在A/B测试中可以利用此方法来确定不同组执行特定操作所需的时间长短。lifelines是一个纯Python实现,涵盖了生存分析的重要部分。
  • 图像处理与——IRADON技术
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    本简介聚焦于生物医学图像处理领域的IRADON技术,深入探讨其原理、应用及其在现代医学成像中的重要性。 生物医学图像处理与分析课程的上机实验题目是实现iradon算法,并完成一份包含代码的完整实验报告。
  • 数据的及MATLAB应用-尚志刚
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    《生物医学数据的分析及MATLAB应用》由尚志刚撰写,本书深入浅出地讲解了如何利用MATLAB这一强大的工具进行生物医学数据分析,为相关领域的研究者提供了实用指南。 《生物医学数据分析及其MATLAB实现-尚志刚》是一本专为生物医学研究者和工程师设计的实用指南,旨在帮助读者掌握如何运用MATLAB进行有效的生物医学数据分析。本书结合了理论与实践,深入浅出地介绍了MATLAB在生物医学领域的应用,并通过具体的例题和代码使读者能够理解和应用生物医学数据处理技术。 书中涵盖的基础知识点包括心电信号(ECG)、脑电信号(EEG)等生物医学信号的基本概念及其特征提取和分析方法。借助于强大的数值计算和可视化工具MATLAB,复杂信号的预处理、滤波及特征提取变得简便易行,为后续诊断与研究提供了便利。 书中详细讲解了MATLAB的数据处理功能,包括数据导入、清洗、统计分析以及图像处理等操作。在生物医学领域中,确保数据质量和准确性的关键在于如何有效利用MATLAB进行管理,并通过消除噪声和执行统计检验来提高数据分析的可靠性。 此外,本书还介绍了MATLAB在建模与仿真方面的应用。建立生理系统的数学模型有助于理解和预测生命现象,而MATLAB提供的Simulink等工具箱则为系统动力学模拟提供了丰富的资源,这对于解释生物医学数据背后的生理机制具有重要意义。 针对生物医学图像处理技术如MRI和CT扫描的分析,《生物医学数据分析及其MATLAB实现》可能涵盖了图像分割、特征提取及配准等内容。借助于Image Processing Toolbox和Computer Vision Toolbox中的大量函数,这些复杂的影像数据可以被直观高效地处理与解析。 《生物医学数据分析及其MATLAB实现-各章例题mfile》压缩包中包含了书中各个章节的MATLAB源代码示例文件。通过运行及修改这些代码实例,读者能够亲身体验各种分析方法的应用,并加深对理论知识的理解。 本书不仅适合具有生物医学背景的研究人员和学者使用,也适用于任何希望掌握MATLAB编程技能的技术工程师们。学习并实践该书内容后,读者将能熟练运用MATLAB进行复杂的生物医学数据分析,在科研或临床工作中提高效率并推动相关领域的创新与发展。
  • 利用PyTorch做(pycox)
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    本文章介绍了如何使用Python深度学习库PyTorch进行生存分析,并引入了pycox工具包以实现更高效的模型构建和训练。 使用PyTorch进行事件预测 pycox是一个Python包,用于生存分析和时间对事件的预测,并建立在训练PyTorch模型的基础之上。该软件包还有一个R版本可用。 此软件包包含多种评估指标以及一系列针对事件时间数据集的工具。此外,在pycox.preprocessing模块中提供了一些有用的预处理功能。 开始使用前,请首先安装PyTorch,然后通过以下命令安装pycox: ``` pip install pycox ``` 我们推荐从01_introduction.ipynb文件入手,该文件详细介绍了软件包的一般用法,涵盖了数据的预处理、神经网络创建、模型训练及评估流程。尽管示例中使用的是LogisticHazard方法进行说明,但大多数原理同样适用于其他方法。 在examples文件夹内还可以找到更多相关实例供参考。
  • 指南(英文原版 第三版)
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    《生存分析自学指南》(第三版)为初学者提供了全面而深入的生存数据分析方法介绍,涵盖统计理论与实际应用案例。原文英文版,适合自学者及专业人士参考使用。 生存分析是统计学中的一个分支领域,专注于研究从特定初始事件(如疾病诊断、手术或暴露于某种风险因素)到某一结果事件(例如复发或死亡)之间的时间长度的分布特征及影响因素。《生存分析自学手册》英文原版第三版由David G. Kleinbaum和Mitchel Klein合著,是针对该领域专业学习者的权威参考书。 本书强调了生存分析的核心概念及其实际应用,并涵盖了描述性方法、概率模型以及主要数据分析技术等内容。书中详细介绍了如何使用Kaplan-Meier估计器来估算生存函数,计算风险比(hazard ratio),构建和解析Cox比例风险模型,运用图形表示法展示数据特征等技巧。 除了非参数性的Kaplan-Meier方法之外,《手册》还讨论了多种适用于不同情况的参数性分布模型如指数分布与Weibull分布。这些模型有助于理解生存时间的概率特性,并据此推断出相应的生存曲线。 Cox比例风险模型作为半参数化工具,在实际应用中尤为广泛,因为它不需要对基础概率密度函数做出明确假设。通过该方法能够分析协变量如何影响相对危险度的变化情况,进而评估其对于个体寿命预期的影响程度与方向性指标——即风险比的大小。 另外,《手册》还介绍了Log-rank检验等比较不同群体间生存曲线差异性的统计手段,并探讨了处理删失数据和时间依赖型自变量时所面临的挑战及解决策略。这些问题在实际研究中普遍存在,正确应对它们是提高分析准确性的重要环节之一。 为了帮助读者更好地掌握这些理论知识,《手册》还提供了使用SAS、SPSS或STATA等常用统计软件进行生存数据分析的具体指导方法。例如,在SAS环境中可以利用PROC LIFETEST过程来执行Kaplan-Meier估计和Log-rank检验;而在SPSS中则可以通过其内置的生存分析模块实现相同功能;对于使用STATA的研究人员来说,stset命令用于准备数据集而stcox则是构建Cox模型的关键指令。 《生存分析自学手册》英文原版第三版是一部全面介绍该领域理论与实践内容的重要参考书籍。它不仅适合流行病学、生物医学统计及公共卫生领域的研究人员和学生阅读学习,同时也为他们提供了处理复杂现实问题的有效工具和技术支持。
  • 疗仪器——工程
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    生物医学工程中的医疗仪器涉及将工程技术原理和方法应用于医学领域,旨在改善人类健康。包括诊断、治疗及康复设备的研发与应用。 这份生物医学工程的PPT资料内容详尽且系统化地涵盖了生物电及生物(化学)参数测量等方面的知识。难度适中,非常适合自学和作为参考材料使用。此外,还对生物医学工程领域进行了概述,并展望了其未来的发展前景。
  • 多门课程的成绩记录
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    本系统旨在为教师和学生提供便捷的成绩管理服务。它能够安全存储、高效查询以及全面分析多个学期、多门课程的成绩数据,帮助用户更好地了解学习状况与趋势。 任务要求如下: 1. 通过键盘输入各学生的多门课程的成绩,并将这些数据存储到文件input.dat中。 2. 对于文件input.dat中的成绩数据进行处理,具体功能包括: - 按照每门课程的分数对学生成绩进行排序并输出相应的结果至新文件。 - 计算每个学生的所有科目的平均分,并根据这些平均分对学生进行排名后将信息写入新的文件中。 - 统计各科目成绩的相关统计数据,包括: * 各学科的平均分 * 每门课程中的最高分数和最低分数 * 不及格的学生人数(即低于60分的人数) * 分别统计处于不同等级段内的学生数量:60-69、70-79、80-89以及90及以上。 - 提供一个查询功能,能够根据学生的姓名或学号检索特定学生的成绩记录。在重名情况下也能准确处理并返回正确的信息。 3. 界面设计要求简洁且美观。
  • 乳腺癌年龄(agec.sav)
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    本研究使用SPSS软件对数据集agec.sav进行分析,探讨不同因素对乳腺癌患者生存年龄的影响,旨在为临床治疗提供依据。 Breast cancer survival agec.sav 是一个数据文件名。
  • SAS中介效应_Timo.rar
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    本资料包《SAS生存分析中介效应》由Timo整理提供,内容涵盖使用SAS软件进行生存数据分析的方法和技术,特别关注于探索和验证中介变量在预测模型中的作用。 适用于生存资料的中介效应分析SAS宏可以帮助研究人员在进行统计分析时更有效地评估变量之间的间接影响关系。这种工具特别适合于处理涉及时间因素的数据集,在医学、社会科学等领域有着广泛的应用价值。通过使用这个特定的SAS宏,用户能够简化复杂的数据分析过程,并获得关于潜在机制和因果路径的重要见解。