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HumanPrimaryCellAtlas-hpca.se-human.RData 单细胞注释的singleR参考图谱

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简介:
本数据集为人类原代细胞图谱(HPCA)项目中的单细胞转录组注释资源,采用singleR工具构建,提供全面的人类细胞类型分类标准,助力精准医学研究与疾病机制探讨。 单细胞singleR注释参考图谱可用于本地使用。对于网络受限的朋友来说,可以直接利用这些内容进行操作。

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  • HumanPrimaryCellAtlas-hpca.se-human.RData singleR
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    本数据集为人类原代细胞图谱(HPCA)项目中的单细胞转录组注释资源,采用singleR工具构建,提供全面的人类细胞类型分类标准,助力精准医学研究与疾病机制探讨。 单细胞singleR注释参考图谱可用于本地使用。对于网络受限的朋友来说,可以直接利用这些内容进行操作。
  • singleRBlueprintEncode-bpe.se-human.RData文件
    优质
    这段资料是用于单细胞分析的参考数据文件BlueprintEncode-bpe.se-human.RData,它基于SingleR软件包进行细胞类型注释,适用于人类基因表达谱研究。 单细胞singleR注释参考文件可以在本地使用。
  • SingleR7个数据集(含5人和2鼠)
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    SingleR的7个参考数据集注释汇集了来自人类与小鼠的生物样本信息,为单细胞转录组分析提供详尽的标注,涵盖广泛生物学场景。 SingleR的7个参考注释数据集包括5个人类数据集和2个鼠类数据集。
  • Symphony:利用Symphony实现高效精准映射
    优质
    Symphony是一款创新工具,旨在通过构建和应用精确的单细胞参考图谱来提高单细胞数据分析效率。它能够高效地将新的单细胞数据映射到现有的高质量参考图谱上,极大地促进科研人员对复杂生物系统的理解与研究进展。 使用Symphony进行高效且精确的单细胞参考图谱映射安装,请按照以下命令从GitHub安装当前版本的Symphony: ```R # install.packages(devtools) devtools::install_github(immunogenomics/symphony) ``` 注意事项:您可能需要安装最新版的`devtools`,因为GitHub最近将默认分支名称从“master”更改为“main”,这可能会导致使用旧版本的`devtools`时出现错误。此外,请确保安装了最新的Harmony: ```R devtools::install_github(immunogenomics/harmony) ``` 关于用法和演示讲解,您可以查看相关文档以获取如何构建自定义参考并进行映射的示例。同时也可以查阅手稿中的数据集来了解如何将它们映射到所提供的Symphony参考上。
  • NSGA-II(含详文献).rar
    优质
    该RAR文件包含详细的NSGA-II算法介绍及其Python实现代码,并附有全面的注释和相关学术文献引用。适合深入研究多目标优化问题的学生与研究人员使用。 已经实现了多目标遗传算法NSGA2,并附有详细注释及相关论文。读者可以根据具体问题进行简要修改后直接使用该算法。
  • Java自动机(含详)- 翁恺教授,浙江大学
    优质
    本项目由翁恺教授指导,基于Java语言实现的一款包含详细注释的细胞自动机程序。通过模拟细胞状态变化规则,展示复杂模式生成过程,适用于教学与研究。出自浙江大学计算机科学课程。 这是浙江大学翁恺老师课堂上展示的细胞自动机程序,我在阅读过程中添加了许多代码注释,现发布供大家学习使用。
  • MATLAB中带有详Turbo系统仿真代码(Dr. Wuyufei)
    优质
    这段代码提供了基于MATLAB的Turbo编码和解码系统的全面仿真,内含详尽注释以辅助理解复杂过程。借鉴了Dr. Wuyufei的研究成果,适用于通信工程领域的学习与研究。 为了构建Turbo系统,参考Dr.wuyufei的数学架构是必要的,在我的代码中已经做了详细的注释。这份文档非常适合作为学习资料,并具有很高的参考价值!在运行结果中列出了每次迭代过程中的误码率数据,用户可以自行调整迭代次数,但请注意这将导致较长的计算时间。 本段落档实现了Log-Map译码算法,而SOVA译码算法虽然已经给出代码,但是尚未调试完成。请下载的朋友注意这一点! 以下是Dr. wuyufei典型Turbo系统的主函数描述: 该脚本模拟了经典的Turbo编码与解码系统。 它采用并行级联卷积码(Parallel Concatenated Convolutional Codes)。 假设有两个RSC (Recursive Systematic Convolutional) 码率1/2的组件编码器。 第一个编码器使用尾比特终止。信息位加上尾比特后进行随机化处理,并传递给第二个编码器;而第二个编码器没有添加自身的尾比特。 随机的信息位被调制为+1/-1信号,然后通过AWGN(加性高斯白噪声)信道传输。 每个帧的交织器是随机生成的。在我们的第一个版本中这其实不是必需的! 本段落档使用了无量化或近似化的Log-Map算法,并利用 ln(e^x + e^y) = max(x,y) + ln(1+e^(-abs(x-y))) 来简化 Log-MAP 算法,通过查找表实现修正函数。如果采用 ln(e^x + e^y) = max(x,y) 的近似方式,则算法变为 MAX-Log-MAP。
  • 画色
    优质
    《细胞图画色》是一本将科学知识与艺术创作结合的趣味图书,通过给细胞结构上色的方式,让读者在享受绘画乐趣的同时,学习和巩固生物学基础知识。 在细胞图像处理和识别过程中,区域特征至关重要,并构成分析细胞特性的基础。这些特征可能包括外接矩形或像素点的数量等。为了进行有效的特征分析,我们需要首先确定并跟踪不同区域的位置,然后用不同的颜色对其进行标注。为此,我们设计了一个类及其相关方法来实现这一目标。
  • PFC3D程序及代码_PFC_pfc3d_
    优质
    本资料提供PFC3D参考程序及其详尽代码注释,旨在帮助用户深入理解颗粒流模拟软件PFC3D的编程机制与应用技巧。 PFC3D提供参考程序流代码的注释方法与解析。
  • RGGB Bayer
    优质
    本作品展示了一幅采用RGGB Bayer滤镜阵列技术拍摄的细胞图像,通过色彩编码增强细节表现力,揭示微观世界的精细结构。 RGGB Bayer格式的细胞图像是一张从相机直接获取的raw格式的原始图像。